|
|
Vývoj grafického rozhraní pro zpracování MR spektroskopických vyšetření
Černý, Karel ; Hájek, Milan (vedoucí práce) ; Hačkajlo, David (oponent)
Účelem této diplomové práce bylo zjednodušení zpracovaní spektroskopických dat a vytvořeni databáze provedených MR vyšetřeni. Výchozí stav ukládání MR dat vyžadoval ovládání několika programů. Proto bylo nutné vytvořit ovládací rozhraní, které obsahuje potřebné funkce a je přizpůsobeno požadavkům personálu, který vyšetření zpracovává. Výzkum a vývoj softwaru probíhal v Institutu Klinické a Experimentální Medicíny na pracovišti MR spektroskopie ZRIR IKEM. Výsledkem diplomové práce je rozhraní, které ovládá stávající MR spektroskopicky PACS (SPACS) určeny pro archivaci a správu dat pacientů výzkumných MR projektů v IKEM. Aplikace je dostupná přes webový prohlížeč. Všechny funkce, výpočty a náhledy jsou vytvořeny v programovacím jazyku PHP, použita databáze je implementovaná v PostgreSQL, doplňkové funkce a drobné utility zajišťuje Javascript Aplikace umožňuje zobrazit bázové obrázky s vykreslenou oblasti zajmu, vygenerovat z naměřených dat náhled spektra, zvolit parametry pro zpracování a odeslat všechna data do výpočetní jednotky LCModel. Samozřejmosti je přehledné ukládání výsledků do databáze. Aplikace byla otestovaná a umístěná na hlavní SPACS server v IKEMu a uživatelům ulehčuje zpracovávání spektroskopických vyšetření.
|
|
|
Mesiální temporální epilepsie: Sledování efektu léčby různými chirurgickými metodami s morfologickým obrazem detekovaným magnetickou rezonancí
Malíková, Hana ; Vymazal, Josef (vedoucí práce) ; Kršek, Pavel (oponent) ; Hájek, Milan (oponent)
SOUHRN Úvod: Mesiální temporální epilepsie (MTLE) je chirurgicky nejlépe léčitelný typ epilepsie a výsledky neurochirurgické terapie jednoznačně převyšují dlouhodobou farmakologickou léčbu. Stereotaktická amygdalohippocampektomie (SAHE) je alternativní léčbou MTLE k otevřených neurochirurgickým přístupům. V naší nemocnici je SAHE prováděna od roku 2004. Stereotaktické léze jsou prováděny sondou s flexibilním aktivním hrotem, z occipitálního přístupu, z jedné trajektorie v dlouhé ose amygdalohippocampálního komplexu (AHK). Cílem studie bylo korelovat morfologické změny v temporálním laloku včetně volumetrie jednotlivých struktur /hippocampus, amygdala, entorhinální (EC) a peririnální (PRC) kortex/ po různých neurochirurgických přístupech s klinickým výsledkem léčby. Metody: Zařadili jsme 26 konsekutivně léčených pacientů, kteří prodělali SAHE Leksellovým stereotaktickým systémem a 10 pacientů léčených mikrochirurgickou amygdalohippocampektomií (AHE). MR volumetrie hippocampu, amygdaly, EC a PRC byla provedena 1 rok po výkonu. Klinické výsledky vzhledem k redukci epileptických záchvatů byly hodnoceny Engelovou klasifikací za 2 roky po prodělané léčbě. Výsledky: Nebyly nalezeny žádné závažné chirurgické komplikace obou metod. Rok po SAHE hippocampální objem poklesl o 55.5 18.0% (p<10-4 ), amygdalární objem...
|
|
| |
|
|
Metabolický profil lidského mozku in vivo v MR obraze a spektru
Wagnerová, Dita ; Hájek, Milan (vedoucí práce) ; Lang, Jan (oponent)
Magnetic resonance imaging and spectroscopic imaging have proven to be useful to monitor a metabolism in the human brain. The thesis is concerned to repeatability and reproducibility of spectroscopic data measured on 1.5T and 3T scanners and to the development of a new method enabling the separation of pathologic and healthy tissues in patients with brain tumor using the combination of MR spectroscopic and diffusion measurements. Evaluation of repeatability and reproducibility in white matter in the parieto-occipital region, in the hippocampus and in gray matter in the frontal lobe did not show significant differences in accuracy of measurements on 1.5T and 3T scanners, but showed a significant increase of signal-to-noise ratio on 3T As a part of the thesis a program KORELACE has been developed. The program enables the evaluation of spectroscopic and diffusion data on the "pixel-by-pixel" basis in individual subjects. The existence of a statistically significant inverse correlation between the concentrations of choline and the diffusion trace values has been proven in glioblastoma, but no significant correlation has been found in a healthy tissue in volunteers. The correlation can be used to characterize borders of brain tumors and to identify the healthy tissue. Simulations confirmed the influence of...
|
|
|
Studium metabolismu kosterního svalu technikami MR spektroskopie a MR zobrazování
Škoch, Antonín ; Hájek, Milan (vedoucí práce) ; Vymazal, Josef (oponent) ; Žižka, Jan (oponent) ; Lang, Jan (oponent)
Magnetická rezonance je technika, která má všestranné použití. Od prvních aplikací pro zobrazování anatomie centrálního nervového systému nalezla v klinické praxi a výzkumu své místo i ve studiu srdce, jater, prostaty, svalu a dalších tkání. Kromě klasického zobrazování T1, T2 a proton-denzitními obrazy nalezly své uplatnění techniky spektroskopické, techniky difuzně váženého zobrazování, perfuzní techniky, angiografické a další. Cílem této dizertační práce bylo studium kosterního svalu pomocí technik MR spektroskopie a MR zobrazování. V první studii popsané v experimentální části této dizertační práce bylo technik analýzy textury úspěšně použito při klasifikaci MR obrazů kosterních svalů pacientů a zdravých dobrovolníků. Prokázali jsme, že analýza textury může sloužit jako pomocný nástroj při klasifikaci stupně postižení kosterního svalu nemocných s myopatiemi. V této studii bylo využito klasické zobrazení T1 a T2 váženými obrazy, které je na našem pracovišti prováděno jako klinické vyšetření již několik let. Naše výzkumná skupina spolupracuje na společném evropském projektu COST B21, jehož hlavním cílem je studium aplikace technik analýzy textury na MR obrazech. Studie byla důležitou součástí tohoto mezinárodního projektu. Druhá část dizertační práce se zabývala použitím techniky 1H MR spektroskopie pro...
|
|
|
Somatomotorická a somatosenzorická modulace bolesti v obraze fMR a EEG
Vrána, Jiří ; Stančák, Andrej (vedoucí práce) ; Vymazal, Josef (oponent) ; Jech, Robert (oponent) ; Hájek, Milan (oponent)
Zpracování bolesti je na různých úrovních CNS modulováno současně probíhajícími ději. Ze studia nebolestivých somatosenzorických evokovaných potenciálů známe jev hradlování somatosenzorických podnětů pohybem. Klasicky uváděný mechanizmus hradlování v zadním rohu míšním založený na teorii Melzacka a Walla [Melzack R, Wall PD. Pain mechanisms: a new theory. Science 1965;150(699):971-979.] je podle dalších důkazů doplněn ještě nedostatečně prozkoumanými supraspinálními mechanizmy. Podobným nedostatkem porozumění na korové úrovni trpí i metody modulace bolesti interkurentní elektrickou nervovou stimulací. Předkládaná práce se zaměřuje na korové mechanizmy modulace bolesti ve speciálních případech (a) izometrické kontrakce svalů pravé nebo levé ruky při elektrické intraepidermální bolestivé stimulaci pravého ukazováku a (b) při pozorování akutních účinků souběžné nebolestivé vysokofrekvenční mediánové stimulace (PNS) na tonickou tepelnou bolestivou stimulaci thenaru.
|
|
| |
|
|
Možnosti metody Analýza textury pro hodnocení MR obrazu
Jirák, Daniel ; Hájek, Milan (vedoucí práce) ; Vymazal, Josef (oponent) ; Žižka, Jan (oponent)
V této práci byly analyzovány MR obrazy fantomu, jablek, lýtkových svalu a jater pomocí TA. Dosažené výsledky lze shrnout do nekolika bodu: · Pro potreby optimalizace algoritmu výberu texturních parametru a klasifikace textury byl vyvinut nový typ fantomu. Tento PSAG fantom byl podroben dlouhodobému testování, pri kterém byla prokázána jeho stabilita po dobu minimálne 12 mesícu. PSAG fantom je vhodný pro MR zobrazování i pro aplikace TA, protože poskytuje dostatecný MR signál a umožnuje simulovat ruzné nodulární textury. · Ukázali jsme vliv rozlišení na presnost klasifikace textury pomocí TA. Pri dostatecném rozlišení metoda TA prokázala dobrou separovatelnost ruzných struktur na MR obrazech. Dostatecné rozlišení je i nutnou podmínkou pro potenciální použití TA v klinické aplikaci, v opacném prípade naše studie neukazuje velký prínos pro zavedení TA v klinickém vyšetrování. · Byl úspešne testován program MaZda urcený pro analýzu MR obrazu. Tento program, vyvíjený v rámci projektu COST B11 a B21 [10, 11], kterých jsme se zúcastnili, plne dostacuje pro statistickou texturní analýzu MR obrazu. Implementované klasifikacní metody a techniky pro výber parametru byly aplikovány v experimentálních i klinických studiích. · Byl navržen algoritmus výberu invariantních texturních parametru, které nesou obrazovou...
|
|
|
Methods of the Spectroscopic I maging in clinical practice and experiments
Jírů, Filip ; Hájek, Milan (vedoucí práce) ; Horký, Jaroslav (oponent) ; Mechl, Marek (oponent)
Předkládaná dizertační práce se zabývala různými aspekty zpracování SI dat. Jednotlivé výsledky lze shrnout do následujících bodů. Byl vytvořen program CULICH umožňující kompletní zpracování a analýzu dat naměřených metodou spektroskopického zobrazování. První zkušenosti ukazují, že CULICH je vhodný pro použití v klinické praxi i experimentu. Program byl implementován na pracovišti magnetické rezonance v IKEM a na dalším zahraničním pracovišti, kde se podrobuje podrobnému testování. Bylo provedeno porovnání koncentrací metabolitů naměřených metodami SI a SVS z prostorově si odpovídajících voxelů. V daném experimentálním uspořádání nebyl nalezen rozdíl v koncentracích vypočítaných oběmi metodami. Stejný výsledek platí i pro poměry koncentrací, pokud je provedeno vhodné filtrování dat. Byla navržena sekvence pro měření rozložení radiomagnetického pole (RF) ve vzorku ve třech dimenzích. Naměření třírozměrné RF mapy v lidském mozku vyžaduje přibližně 1.5 minuty. Znalost rozložení RF v mozku byla použita pro výpočet navržené korekce na neideální profil VOI u PRESS-SI a STEAM-SI sekvencí v nehomogenním magnetickém poli. Byly testovány Cramer-Rao bounds (CRBs) vypočtené programem LCModel jako možný parametr pro výpočet chybových obrazů. Dále byl navržen a testován parametr pro výpočet chybových obrazů poměru...
|
|
| |
host ::
RSS.