|
|
Quantitative analysis of Scratch assay and Colony formation assay data using MATLAB
Ingrová, Kateřina ; Chmelíková, Larisa ; Zumberg, Inna
Utilizing Scratch and Colony formation assays is crucial for understanding cell migration and proliferation dynamics. In this study, we present novel approaches utilizing MATLAB for the processing of images obtained from these assays. We demonstrate the effectiveness of our approaches through validation experiments on human osteosarcoma SaOS-2 cells, showcasing their applicability across different experimental conditions. Moreover, the inhibitory effect of two concentrations of gentamicin (0.1 mg/ml, 0.3 mg/ml) on the migration and clonogenicity of SaOS-2 cells was declared.
|
|
|
Assessing Diversity in Predictive Equations for Body Compartment Estimation
Kampo, Dávid
This paper evaluates the validity of prediction equations for estimating total body water (TBW), extracellular water (ECW), fat-free mass (FFM), and body cell mass (BCM) using bioelectrical impedance analysis (BIA). The study focuses on a sample of 10 Czech individuals of European ethnicity. Prediction equations were selected based on similarity to the study population and were compared to reference ranges for accuracy. Findings show promising outcomes for TBW estimation, with low relative errors (RE) of 0.11% and -3.26% for equations by Deurenberg et al. and Kotler et al. respectively. Matias et al.’s equation for ECW estimation demonstrated the most accurate results with an RE of 2.13%. For FFM estimation, equations by Lukaski et al. and Deurenberg et al. showed favorable outcomes with RE values of 4.4% and -1.27% respectively. However, none of the BCM prediction equations provided satisfactory accuracy. Further research with larger sample sizes is needed for more accurate validation. Nonetheless, this study offers valuable insights into selecting appropriate prediction equations for BIAbased body composition analysis.
|
|
|
LSTM-Based Autoencoders in Online Handwriting Data Augmentation and Preprocessing
Gavenciak, Michal
On-line handwriting analysis is a research field that is among others used in assessment of handwriting difficulties (HD), which can be manifestations of degenerative brain diseases such as Parkinson’s disease in the elderly, or developmental dysgraphia in children. Using advanced modelling approaches or artificial intelligence is often difficult because of the limited data availability in both demographic cohorts. In this article, a data processing approach, using LSTM-based autoencoders, is described as a way of augmenting the database with semisynthetic data or preprocessing the data to improve the performance of feature-based classification. The proposed method has led to a 3 percentage point increase in classification accuracy when compared to baseline. While the improvement is marginal, it highlights another possible area of research to improve the efficacy of automated HD assessment.
|
|
|
Bacterial Identifier: Accelerating Bacterial Genome Detection
Nejezchlebová, Julie ; Rychlík, Ivan ; Schwarzerová, Jana
Bacterial identification is crucial for effectively monitoring and controlling the spread of infectious diseases. In addressing this critical need, our study introduces an engineered application designed to expedite the analysis of bacterial sequencing data, thus providing a streamlined method for species identification. The Bacterial Identifier underwent thorough testing using a significant dataset obtained from the Veterinary Research Institute. Central to the app's functionality is the integration of three essential tools. Implemented through a cohesive bash script, these tools are seamlessly combined to ensure optimal performance and accuracy in bacterial identification. Furthermore, to enhance user experience, a userfriendly interface was developed using Python 3, facilitating intuitive navigation and efficient utilization of the application's capabilities.
|
|
|
Implementation of LTE Cat-M Technology for Smart Measurement Scenarios
Tamentsev, Viacheslav
The requirements introduced in Directive 2019/944 of the European Parliament for smart metering scenarios, which differ from the ones defined in ITU-R M.2410, accelerated the integration of cellular technologies for the Internet of Things (IoT). With the release of cellular IoT (CIoT) technologies in the Czech Republic, recently LTE Cat-M, the focus shifts towards evaluating the performance in massive scenarios where thousands of devices are connected to one base station. This paper examines the feasibility of implementing LTE Cat-M communication technology in Network Simulator 3 (NS-3) to cover massive Machine-Type Communication (mMTC). The paper analyzes the capabilities of cellular modules within the selected simulation tool Networks Simulator 3 (NS-3), including the LENA module. First, simulation scenarios are created to validate and benchmark the performance of legacy LTE/LTE-A networks with attention to (mMTC) scenarios. The key output is the determination that the 4G networks are unsuitable for these scenarios. Further, based on the obtained data, the initial discussion on the requested implementation to support the LTE Cat-M in the NS-3 is provided, pointing out the exact changes associated with the physical layer.
|
|
|
Evaluating BPL Communication: A Simulation Approach
Baranyk, Matěj ; Benešl, Lukáš ; Rusz, Martin
In recent years BPL (Broadband over Power-line) technology is becoming more used. Despite the technology not needing any additional cable installation it is important to make sure that using the technology itself makes sense or what the needed requirements will be. Due to this reason, we opt to simulate almost real scenarios and compare them with outputs from network simulator ns-3. This way we can recognize the usefulness of our efforts even before we make any plans to install anything, which saves time and money. Furthermore, we can use the same simulator for diagnostics of already installed BPL routes.
|
|
|
Kvalita života dospělých osob s těžkou formou poruchy autistického spektra - územní komparace
Tuzarová, Romana ; Bártová, Alžběta (vedoucí práce) ; Cooke, Dana (oponent)
Předložený text je zacílen na analýzu kvality života dospělých osob s těžkými formami poruch autistického spektra v důležitých aspektech jejich života. V rámci 3 kapitol se věnujeme základnímu povědomí o poruchách autistického spektra, popisů a rozboru důležitých aspektů v životě osob s těžkými formami poruch autistického spektra a samotné analýze vnímaní vlastní míry kvalita života těchto osob a jejich rodičů/přímo pečujících. Výsledky analýzy nabízejí odpovědi na otázky, které základní aspekty života dospělých osob s těžkými poruchami autistického spektra jsou snížené nebo ohrožené.
|
|
|
Nové struktury s potenciálem inhibice FLT3 receptoru: In vitro hodnocení s využitím AML buněčných linií
Zídková, Anna ; Čečková, Martina (vedoucí práce) ; Jirkovský, Eduard (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Student: Anna Zídková Školitel: doc. PharmDr. Martina Čečková, Ph.D. Konzultant: Mgr. Jan Rataj Název diplomové práce: Nové struktury s potenciálem inhibice FLT3 receptoru: In vitro hodnocení s využitím AML buněčných linií Akutní myeloidní leukemie (AML) je rapidně progredující hematoonkologické onemocnění, charakterizované proliferací a akumulací nezralých myeloblastů v kostní dřeni a periferní krvi. Výsledky léčby AML, i přes významné úspěchy, stále zůstávají neuspokojivé. Až u jedné třetiny pacientů s nově diagnostikovanou AML jsou detekovány mutace genu pro FLT-3 (FMS like tyrosin kináza 3), přispívající ke špatné prognóze onemocnění. FLT-3 inhibitory tak představují nový přístup cílené terapie. Přesto, že byly zavedeny do terapie teprve nedávno, už vůči nim leukemické buňky rozvíjí rezistenci, která bývá jedním z důvodů selhání léčby. Cílem této práce bylo otestovat 8 nově syntetizovaných sloučenin jako potenciálních FLT-3 inhibitorů a zhodnotit jejich přínos v překonávání rezistence vůči klinicky používanému FLT-3 inhibitoru gilteritinibu. Pomocí metody MTT byla otestována schopnost těchto látek navodit buněčnou smrt u linie MV4-11 (nesoucí FLT-3 mutaci) v porovnání s linií THP-1 (mutaci...
|
|
|
Vliv neurotréninku na postkomoční syndrom u hráče fotbalu - kazuistika
Crkalová, Monika ; Křivánková, Markéta (vedoucí práce) ; Daďová, Klára (oponent)
Název: Vliv neurotréninku na postkomoční syndrom u hráče fotbalu - kazuistika Cíle: Cílem této práce je analyzovat účinnost neurotréninku pro zmírnění symptomů postkomočního syndromu pomocí kazuistiky u dospělého fotbalisty po otřesu mozku. Metody: V kazuistice byla použita technika test, re-test. K posouzení změn účinnosti metody byl využit standardizovaný dotazník SCAT5, testování neurovizuálního systému pomocí optotypu, prizmatického flipperu 6/12, Neurotrackeru, RightEye a přístroje Senaptec Sensory Station. Měření stability proběhlo pomocí aplikace Physics Toolbox Sensor Suite a pro kognitivní funkce Stroop effect. Dále proběhla neurodiagnostika, na základě které byly probandovi vybrány cviky neurotréninku, které prováděl po dobu dvou měsíců (testován byl vizuální systém a mechanorecepce). Výsledky: proband se zlepšil v ostrosti vidění o 20 %, ve vergenční flexibilitě o 44 %, neurokognitivních funkcích o 44 %, reakčním čase o 29 %, v hloubce ostrosti binokulárně o 12 %, vizualizaci o 6 % a zrychlil se na neurotrackeru o hodnotu 0,3. Mírně se zhoršil v akomodaci levého oka a binolukárně o 5 %, hloubce ostrosti na pravé oko o 1 %, na levé oko o 4 % a přechodu ostření z dálky na blízko o 16 %. Zlepšení bylo patrné při měření stability ve stoji spojném se zavřenýma očima a stabilitě na pravé i...
|
|
|
Využívání zdravotnictví na základě genderu
Vojta, Filip ; Angelovská, Olga (vedoucí práce) ; Kotherová, Zuzana (oponent)
Termíny pro podávání projektů bakalářských / diplomových prací bakalářské studijní programy SOSP, SOSA, SOC_SSS a SOC_SA magisterský studijní program SOC 30. 6. Zaslání projektů na sekretariát Katedry sociologie (projekty.ks.iss@fsv.cuni.cz). 5. 9. Vyrozumění studentů o přijetí či nepřijetí projektů. 30. 9. Zaevidování projektů bakalářských a diplomových prací v SISu. Postup při zadávání a schvalování projektu bakalářské / diplomové práce 1. Vyplňte následující formulář. 2. Soubor uložte pod jménem "studijní program_kód semináře_příjmení, jméno" (SOSP_BCA_Černá, Jana; SOC_MGRB_Černý, Jan). Soubor zašlete ze své fakultní emailové adresy na sekretariát Katedry sociologie ISS FSV UK: projekty.ks.iss@fsv.cuni.cz; v kopii projekt zašlete na fakultní emailovou adresu vedoucího vaší bakalářské / diplomové práce. Projekty zaslané z jiné než fakultní adresy a / nebo bez uvedení vedoucího práce v kopii, nebudou přijaty. 3. Po schválení projektu jej ve spolupráci s vedoucím práce zadejte do SISu. V případě neschválení projektu celý proces opakujte. ................................................................................................... Projekt bakalářské / diplomové práce Jméno a příjmení studujícího: Filip Vojta Studijní program: Sociologie a sociální politika Předpokládaný název práce: Rozdíl vnímání...
|
host ::
RSS.