|
Interakce proteinů s inhibitory: kvantověchemická studie
Dobeš, Petr ; Hobza, Pavel (vedoucí práce) ; Vondrášek, Jiří (oponent) ; Jurečka, Petr (oponent)
Předložená disertační práce se zabývá teoretickým studiem interakcí mezi proteinkinázami a jejich inhibitory. Studované proteinkinázy, cyklin-dependentní kináza 2 (CDK2) a kináza CK2 (angl. casein kinase 2) hrají důležitou roli v regulaci buněčných procesů u eukaryotických organismů. Jejich nesprávná funkce v buňce může u člověka vést k závažným onemocněním. Tento proces je možné zvrátit vyřazením aberantních proteinkináz pomocí specifických nízkomolekulárních inhibitorů. Inhibitory proteinkináz se typicky vážou do aktivního místa enzymu pomocí nekovalentních interakcí. Teoretický popis těchto interakcí pomocí kvantověchemických a molekulárně mechanických metod může pomoci při pochopení biofyzikálních principů řídících vazbu. Ty pak mohou být následně využity při racionálním návrhu účinnějších či specifičtějších inhibitorů. Stabilizační energie komplexu CDK2 s inhibitorem roskovitinem je převáženě tvořena disperzní energií. Metoda DFT, která nezahrnuje disperzní energii, je tak pro popis uvedeného komplexu zcela nevhodná. V případě zahrnutí disperze pomocí empirického členu dojde ke správnému popisu této interakce a metodu SCC-DFTB-D lze naopak doporučit pro uvedený komplex. Dominantní část celkové interakce je tvořena omezeným počtem aminokyselin, které přispívají k vazbě roskovitinu s CDK2 a jejich mutace...
|
|
Vícerodinná terapie v léčbě poruch příjmu potravy : zavedení do praxe v České republice a pilotní ověření účinnosti
Tomanová, Jana ; Papežová, Hana (vedoucí práce) ; Miovský, Michal (oponent) ; Eisler, Ivan (oponent)
Souhrn Práce přináší shrnutí šestiletého fungování programu vícerodinné terapie v léčbě poruch příjmu potravy při Centru pro poruchy příjmu potravy Psychiatrické kliniky v Praze. Jde o první zkušenosti s využitím vícerodinné terapie u psychiatrických pacientů v Čechách. Tento terapeutický koncept (Multifamily Therapy)je v zahraničí často využívanou formou práce s pacienty trpícími touto diagnózou a je metodou první volby dle vodítek NICE (2004). Inspirací pro pražský tým byl londýnský Maudsley model. Hlavními cíli práce bylo 1) zavést tento terapeutický přístup do komplexní péče o pacienty s poruchami příjmu potravy, optimalizovat fungující strukturu a program a stabilizovat vyškolený terapeutický tým; a 2) zhodnotit efektivitu vícerodinné terapie a navrhnout vhodnou metodologii. Od roku 2004 se projektu zúčastnilo 20 rodin (zkoumaná skupina). Pro prvotní výzkumný záměr byla zvolena kombinace kvalitativní a kvantitativní metodologie. Kvantitativními metodami byly dotazníky Beck Depression Inventory (BDI), Schwartzova škála hodnocení terapie (SOS-10), dotazník kvality života (SQUALA) a Rosenbergův dotazník sebepojetí (RSE). Bylo hodnoceno 10 oblastí, v nichž byly sledovány změny a posuny. Těmito oblastmi jsou: kvalita života, emoční stabilita jedince, přítomnost symptomů PPP, změny v rodinném stravování,...
|
|
Side-chain Side-chain Interactions in Proteins
Berka, Karel ; Hobza, Pavel (vedoucí práce) ; Rulíšek, Lubomír (oponent) ; Otyepka, Michal (oponent)
Universita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta Katedra fyzikální a makromolekulární chemie Interakce mezi vedlejšími řetězci aminokyselin v proteinech Souhrn disertační práce RNDr. Karel Berka Školitelé: Prof. Ing. Pavel Hobza, DrSc., FRSC RNDr. Jiří Vondrášek, CSc. Ústav organické chemie a biochemie AV ČR Centrum biomolekul a komplexních molekulárních systémů Praha 2009 7 Úvod Proteiny jsou univerzální a nejpoužívanější buněčné nástroje. Ve schopnosti katalyzovat chemické reakce se jim v přírodě nic nevyrovná. Mají významnou funkci v metabolismu, v buněčné signalizaci, podílí se na procesu ukládání genetické informace a tvoří i mechanickou oporu buňky. Ohromné množství funkcí proteinů s sebou nese i ohromné množství jejich tvarů a struktur. Přesto je každý protein sestaven z jednoduchých stavebních prvků - aminokyselin. Každá z nich má mnoho možností, jak interagovat se svými sousedy. Proměnlivost struktury proteinů pak jedině závisí na sekvenci řazení aminokyselin. Charakter a relativní síla jednotlivých interakcí mezi aminokyselinami se experimentálně stanovuje obtížně, protože je těchto interakcí v každém proteinu příliš mnoho. Na druhou stranu jsou metody teoretické chemie na takovýto úkol dobře přizpůsobeny a mohou vnést alespoň trochu světla do informací o struktuře, stabilitě a původu těchto...
|
|
Tumour Suppressor HIC1 - a novel inhibitor of Wnt Signalling
Pospíchalová, Vendula ; Filipp, Dominik (oponent) ; Kořínek, Vladimír (vedoucí práce)
1. ABSTRACT In all metazoan organisms Wnt ligands regulate various developmental and physiological processes during embryogenesis and also in adult tissues. Moreover, deregulation in Wnt-related signalling is associated with several human disorders including cancer. In the so-called canonical pathway, activation of the Wnt receptor complex Frizzled/LRP triggers a complex network of molecular events that ultimately lead to the stabilization of β-catenin and formation of TCF/β- catenin heterodimers in the nucleus. These protein complexes drive expression of a specific set of genes that control the cell fate decision. The Wnt pathway is tightly regulated by several mostly negative feedback loops involving scores of extracellular, cytoplasmic or nuclear proteins. Recently, we have identified tumour suppressor Hypermethylated in cancer 1 (HIC1) as a negative modulator of canonical Wnt signalling. The HIC1 gene encodes a BTB/POZ-zinc finger transcriptional repressor. Interestingly, the HIC1-dependent repression of the TCF/β-catenin- dependent genes is not mediated by direct association of HIC1 with the regulatory regions of the Wnt-responsive genes but rather by a sequestration of TCF/β-catenin complexes to the nuclear speckle-like structures - the HIC bodies. These data indicate quite a pleiotropic role of HIC1...
|
|
Studium dynamiky makrocyklických inkluzních komplexů pomocí NMR spektroskopie
Vágnerová, Kateřina
Kalix[n]areny jsou pro své vynikající komplexační schopnosti a pro široké možnosti derivatizace často využívány v supramolekulární chemii. Thiakalix[4]aren vznikl nahrazením methylenové spojky mezi fenolickými jádry sírou, což v důsledku způsobilo větší kavitu v molekule a odlišné konformační chování. Thiakalix[4]aren zaujímá konickou konformaci stabilizovanou na spodním okraji polem čtyř vodíkových vazeb mezi hydroxylovými skupinami. Bylo prostudováno jeho dynamické chování v nepolárním rozpouštědle pomocí metod NMR spektroskopie zejména s využitím teplotně závislých měření 13C spinové relaxace. Rychlostní konstanta změny směru pole vodíkových vazeb byla stanovena měřením závislosti spektrálních intenzit na proměnném echo-čase v pulzní sekvenci CPMG. Byly stanoveny aktivační parametry této reakce. Dále byl stanoven korelační čas rotačního pohybu molekuly a jeho teplotní závislost s arrheniovským tvarem. Měření bylo porovnáno s podobným na "mateřském" kalix[4]arenu.
|
|
Průzkum spokojenosti zaměstnanců v sociálních službách
Slámečková, Marie ; Nováková, Kamila (oponent) ; Tureckiová, Michaela (vedoucí práce)
Pracovní spokojenost je rozsáhlá a komplikovaná sociálně psychologická kategorie. Je zkoumána od 30. let minulého století. Na míře pracovní spokojenosti jedince se podílí celá řada vnitřních a vnějších faktorů. Vnitřně určují míru spokojenosti např. věk, pohlaví, rodinný stav, vzdělání, délka pracovní kariéry, ale také profesionální úroveň, identifikace s obsahem práce, momentální životní situace, očekávání apod. Vnější faktory jsou finanční ocenění páce, atmosféra v pracovním kolektivu, styl vedení, fyzikální podmínky práce aj. Pracovní spokojenost vyjadřuje jednak míru celkové spokojenosti v práci a jednak míru spokojenosti s jednotlivými oblastmi práce. Pracovní spokojenost velmi úzce souvisí s dalšími pracovními aspekty, a to s motivací, stabilizací, s firemní kulturou. Těmito termíny se zabývá první kapitola. (...)
|
|
Superkomplexy respiračního řetězce v mitochondriích
Mikulová, Tereza ; Holzerová, Kristýna (oponent) ; Houštěk, Josef (vedoucí práce)
Mitochondrie jsou velmi důležitou organelou eukaryotní buňky. Probíhá v nich řada metabolických pochodů včetně oxidační fosforylace (OXPHOS). Je to proces, kterého se účastní enzymové komplexy umožňující oxidaci redukovaných molekul substrátu NADH a FADH2 spojenou s následným transportem protonů přes vnitřní mitochondriální membránu. Takto vzniklý elektrochemický potenciál je využíván ATP synthasou k syntéze ATP z fosfátu a ADP. Poslední výzkumy systému OXPHOS poukazují na existenci vyššího strukturního uspořádání komplexů do tzv. superkomplexů, které umožňují "substrate channeling". Hrají roli v sestavování a stabilitě komplexů a dokonce se zdá, že by mohli být i funkčním stavem dýchacího řetězce.
|
|
Dynamika mladých hvězd v jádru Galaxie
Haas, Jaroslav ; Šubr, Ladislav (vedoucí práce) ; Mayer, Pavel (oponent)
Pozorování nasvědčují tomu, že se v centru naší Galaxie v těsné blízkosti supermasivní černé díry nachází dvě na sebe téměř kolmé koherentně rotující struktury obsahující několik desítek mladých hvězd. V jedné z nich se pozoruje velmi hustá hvězdokupa, tzv. komplex IRS 13E. Spekuluje se o tom, že se v jeho centru nalézá středně masivní černá díra o hmotnosti řádu 103-104 M. Modelováním pohybu hvězd v dominantním potenciálu Sgr A* porušeném působením komplexu IRS 13E a sféricky symetrické hvězdokupy starých hvězd, na jejíž přítomnost v oblasti se z pozorování též usuzuje, jsem vymezil hmotnosti obou poruch, při kterých by neměly na pozorovanou konguraci destruktivní vliv. Ukázalo se, že přítomnost sféricky symetrické hvězdokupy má značně stabilizující účinek. Z výsledků totiž vyplývá, že pokud se její působení započítá, je horní odhad hmotnosti IRS 13E až o řád větší (6 × 104 M) než v případě, kdy se její působení zanedbá (4,5 × 103 M).
|
|
Komplexy 2,6-bis[(N-methylpiperazin-1-yl)methyl]-4-formyl fenolu
Marečková, Vendula ; Vojtíšek, Pavel (vedoucí práce) ; Kubíček, Vojtěch (oponent)
Byla připravena řada dvojjaderných komplexů ligandu 2,6-bis[(N-methylpiperazin- 1-yl)methyl]-4-formyl fenolu (L1) s mědí a palladiem. Vzniklé komplexy by měly obsahovat takový strukturní motiv, který umožňuje výměnu navázaného aniontu. Rentgenostrukturní analýzou byly určeny struktury komplexů mědi: [Cu2L1(CH3COO)2]ClO4, [Cu2L1(CF3COO)2(ClO4)][Cu2L1(CF3COO)2]ClO4; a palladia: [Pd2L1(CH3COO)3], [Pd2L1(CF3COO)3], [Pd2L1(Cl)4] a bylo zjištěno, že koordinační okolí Cu2+ je blízké tetragonální pyramidě. U komplexu [Cu2L1(CH3COO)2]ClO4 se podařilo "vyměnit" můstkové octanové anionty za anionty kyseliny fenylfosfinové a byla určena struktura vzniklého komplexu [Cu2L1(phPO2H)2]ClO4. Systémy ligand - kov - anion byly studovány v roztoku pomocí UV-VIS spektroskopie. Dále byla sledována interakce mezi ligandem a vybranými dvoumocnými kovy. Prokázána byla jenom interakce s Cu2+ . Byly stanoveny konstanty stability komplexů ligandu L1 s iontem Cu2+ v poměrech 4 : 3 a 4 : 6. Dále byla sledována interakce komplexu [Cu2L1(CH3COO)2]ClO4 se sodnými solemi některých jednoduchých aniontů.
|
|
Možnosti ovlivnění horního zkříženého syndromu posilováním ve fitness centru.
Stanovský, František ; Stackeová, Daniela (vedoucí práce) ; Kovář, Karel (oponent)
Název práce: Možnosti ovlivnění horního zkříženého syndromu posilováním ve fitness centru. Cíle práce: Vybrat skupinu rekreačních sportovců a sestavit přesná vyšetření, která budou použita k získávání informací o stavu pohybového systému sledovaných. Provést stanovená vstupní vyšetření a vyhodnotit je. Z výsledků aplikovaných vyšetření vytvořit program posilovacích a protahovacích cviků na následné vyrovnání svalových dysbalancí. Metoda: Diagnostická metoda -rozhovor - vyšetření aspekcí - specifická vyšetření zkrácených svalů - vyšetření pohybových stereotypů Posilovací metoda - izolované a komplexní posilování Analýza výsledků Výsledky: Při vyhodnocení získaných údajů jsem došel k následujícím závěrům. U cvičenců nastalo spoustu kladných změn na fyzické i psychické úrovni. Nastalo výrazné zlepšení svalové balance v kritických oblastech horního zkříženého syndromu. Na základě vyhodnocení výsledků stanovených cílů mohu prohlásit použité posilovací metody za správně zvolené a bezchybně realizované. Svou terapii hodnotím proto jako úspěšnou. . Klíčová slova: Svalová dysbalance, svalová nerovnováha, horní zkřížený syndrom, zkrácené a oslabené svalstvo, fitness, vyšetření, trénink, posilování, protahování
|
host ::
