| |
|
Kontrast v obraze získaném pomocí ionizačního detektoru ve VP SEM
Goroš, Pavel ; Čudek, Pavel (oponent) ; Jirák, Josef (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá problematikou zkoumání látek elektronovým paprskem. Zaměřuje se na zkoumání látek pomocí metody environmentální rastrovací elektronové mikroskopie (ESEM) a popisuje její zákonitosti. Přednosti ESEM vynikají především při studii nevodivých nebo vodu obsahujících, často biologických vzorků. Tyto vzorky nemusejí být, na rozdíl od klasického rastrovacího elektronového mikroskopu, nijak preparovány či fixovány a díky tomu je studována jejich přirozená povrchová struktura bez poškození vyschnutím. Základním zaměřením práce je stanovení kontrastu v obraze získaném pomocí ionizačního detektoru.
|
| |
|
DNA replication and chromatin: From 3D to function
Ligasová, Anna ; Koberna, Karel (vedoucí práce) ; Cmarko, Dušan (oponent) ; Nedvídek, Josef (oponent)
V první části jsme charakterizovali uspořádání replikačních míst u lidské buněčné linie HeLa. V souladu s dalšími studiemi jsme na světelně-mikroskopické úrovni detekovali v průběhu S fáze pět odlišných replikačních vzorů. Na elektron-mikroskopické úrovni jsme v časné S fázi pozorovali shluky postříbřených zlatých částic, které odpovídaly místům DNA replikace. V pozdějších částech S fáze jsme pozorovali velká uskupení částic, která byla složena z jejich menších shluků. Tyto shluky vykazovaly podobnou velikost jako shluky v časné S fázi. Rovněž jejich počet byl v časné a střední S fázi podobný. Mírný pokles jsme pozorovali až v pozdní S fázi. Pomocí tomografické analýzy jsme zjistili, že většina pozorovaných replikačních míst odpovídá jednotlivým replikonům. Naše výsledky rovněž ukázaly, že replisomy zůstávají v průběhu replikace replikonu těsně spojené. I když se naše výsledky týkají pouze lidské buněčné linie HeLa, podobný způsob uspořádání replisomů byl zjištěn i u prokaryot a kvasinky Saccharomyces cerevisiae. Proto předpokládáme, že toto uspořádání replisomů je pravděpodobně obecným rysem DNA replikace. Mimoto jsme navrhli model, ve kterém jsou ramena DNA smyčky vzniklé v průběhu replikace spojené a to pravděpodobně až do skončení replikace celého replikonu. Naše výsledky rovněž ukazují, že na úrovni...
|
| |
|
Experimentální výzkum transportu a depozice aerosolů v dýchacím traktu člověka
Lízal, František ; Janotková, Eva (oponent) ; Adamec, Vladimír (oponent) ; Jícha, Miroslav (vedoucí práce)
Vdechovaný aerosol má značný vliv na zdraví každého člověka. Pochopení mechanismů transportu a depozice aerosolu v lidských plicích je nutnou podmínkou jak pro lepší ochranu před toxickými účinky škodlivých částic, tak zejména pro efektivní použití inhalovaných terapeutických aerosolů. Smyslem této dizertační práce proto bylo získat nové poznatky v této oblasti na základě in vitro prováděných experimentů. Pro měření transportu aerosolu byla zvolena fázová Dopplerovská anemometrie, kterou byla měřena současně rychlost i velikost částic. Výsledky byly zpracovány metodami statistické a frekvenční analýzy. Depozice sférických aerosolových částic byla měřena pozitronovou emisní tomografií, fázově kontrastní mikroskopie kombinovaná s automatickou analýzou obrazů byla využita pro měření depozice vláknových částic. Všechny experimenty byly provedeny na fyzických modelech plic vytvořených na základě reálné geometrie. Výsledkem práce jsou poznatky o charakteristikách proudění, přechodu z laminárního do turbulentního režimu, vlivu režimu dýchání a velikosti částic na transport aerosolu a rozložení depozice aerosolu při různých režimech. Porovnáním depozice na realistickém a semirealistickém modelu s válcovými stěnami byl zjištěn zásadní vliv realistické ústní dutiny. Získané poznatky slouží nejen k rozšíření současných znalostí o chování aerosolu v plicích, ale mohou být použity i pro validaci numerických simulací.
|
| |
|
Experimentální výzkum transportu a depozice aerosolů v dýchacím traktu člověka
Lízal, František ; Jícha, Miroslav (vedoucí práce)
Vdechovaný aerosol má značný vliv na zdraví každého člověka. Pochopení mechanismů transportu a depozice aerosolu v lidských plicích je nutnou podmínkou jak pro lepší ochranu před toxickými účinky škodlivých částic, tak zejména pro efektivní použití inhalovaných terapeutických aerosolů. Smyslem této dizertační práce proto bylo získat nové poznatky v této oblasti na základě in vitro prováděných experimentů. Pro měření transportu aerosolu byla zvolena fázová Dopplerovská anemometrie, kterou byla měřena současně rychlost i velikost částic. Výsledky byly zpracovány metodami statistické a frekvenční analýzy. Depozice sférických aerosolových částic byla měřena pozitronovou emisní tomografií, fázově kontrastní mikroskopie kombinovaná s automatickou analýzou obrazů byla využita pro měření depozice vláknových částic. Všechny experimenty byly provedeny na fyzických modelech plic vytvořených na základě reálné geometrie. Výsledkem práce jsou poznatky o charakteristikách proudění, přechodu z laminárního do turbulentního režimu, vlivu režimu dýchání a velikosti částic na transport aerosolu a rozložení depozice aerosolu při různých režimech. Porovnáním depozice na realistickém a semirealistickém modelu s válcovými stěnami byl zjištěn zásadní vliv realistické ústní dutiny. Získané poznatky slouží nejen k rozšíření současných znalostí o chování aerosolu v plicích, ale mohou být použity i pro validaci numerických simulací.
|
|
Current Induced Magnetization Dynamics in Nanostructures
Uhlíř, Vojtěch ; Thiaville, André (oponent) ; Ravelosona, Dafiné (oponent) ; Šikola, Tomáš (vedoucí práce)
This thesis deals with the study of current-induced magnetization dynamics and domain wall (DW) motion in NiFe/Cu/Co nanowires, induced by the so-called spin-transfer torque effect. Prior to this work, transport measurements had proven that in this trilayer system, DWs in NiFe can be moved with relatively low current densities, suggesting a particularly high spin-torque efficiency. The aim of this study has been to use photoemission electron microscopy combined with x-ray magnetic circular dichroism at synchrotron radiation sources to observe directly the magnetic configurations in the trilayers and their evolution during and after the application of nanosecond current pulses. An important step of the work has been to optimize the growth of the NiFe/Cu/Co layers, in the view of increasing interface quality and minimize interlayer coupling. The process of nanowire patterning by e-beam lithography has also been optimized. Two kinds of measurements have been carried out: i) quasi static measurements, where the domain configuration is observed before and after the application of current pulses and ii) dynamic measurements, where the magnetic configuration has been observed during the application of current pulses. The first measurements have allowed us to study the statistical behaviour of DWs under the application of current pulses: on one hand, the domain wall velocities reach extremely high values for relatively low current densities (up to 600 m/s for 5x10^11 A/m^2). On the other hand, DW motion over distances larger than 2-3 microns is strongly hindered by pinning. Time-resolved measurements during the current pulses, carried out for the first time by our team, have allowed us to demonstrate that the NiFe magnetization is strongly tilted in the direction transverse to the nanowire direction, due to the presence of a transverse Oersted field. This effect might contribute to the enhancement of DW velocities in the NiFe layers.
|
|
Ultrastrukturní změny lidských neuronálních buněk po infekci virem klíšťové encefalitidy
TESAŘOVÁ, Martina
Virus klíštové encefalitidy (KE)je závažným patogenem, který způsobuje až 10.000 lidských infekcí v různých oblastech Evropy a Asie. Infekce buněk CNS hostitele virem KE vede k histopatologickým změnám, které byly zkoumány na ultrastrukturní úrovni pomocí elektronové mikroskopie. U lidských neuroblastů infikovaných virem KE byl studován intracelulární vývoj viru (replikace a maturace) uvnitř buněčné cytoplazmy. Neuroblasty byly zpracovány pomocí dvou rozdílných metod přípravy pro transmisní elektronovou mikroskopii (TEM): 1.chemickou cestou-fixace 2,5%glutaraldehydem; 2. kryofixací pomocí rychlého mražení tekutým dusíkem za vysokého tlaku, HPF). Metoda kryofixace výrazně zlepšila zachování ultrastruktury buněčných organel a membrán v porovnání s chemickou cestou přípravy (pozorované známky extrakce buněčného materiálu a agregační artefakty). Během vývoje viru KE se viriony vyskytovaly zpočátku uvnitř zvětšených cisteren RER, později se objevovaly v přechodném kompartmentu ERGIC-volně v cytoplazmě nebo v asociaci s mikrotubulárními vlákny, cisternách GA a trans-GA. Z pozorovaných výsledků vývoje viru KE uvnitř buněčné cytolazmy neuroblastů nemůžeme tedy proces maturace viru KE jednoznačně řadit k cis nebo trans typu. Morfologické změny projevující se na povrchu neuroblastů po infekci virem KE byly také studovány pomocí skenovací elektronové mikroskopie (SEM). Pomocí topografického kontrastu sekundárními elektrony byly zaznamenány povrchové a tvarové změny buněk, které můžeme shrnout do tzv. cytopatického efektu (CPE) produkovaného virem KE.
|
host ::
