|
|
Image database system for glaucoma diagnosis support
Peter, Roman ; Roleček, Jiří (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
This master thesis describes a conception of standard and advanced eye examination methods used for glaucoma diagnosis in its early stage. According to the theoretical knowledge, a web based information system for ophthalmologists with three main aims is implemented. The first aim is the possibility to share medical data of a concrete patient without sending his personal data through the Internet. The second aim is to create a patient account based on a complete eye examination procedure. The last aim is to improve the HRT diagnostic method with an image registration algorithm for the fundus and intensity images and create an optic nerve head web based 3D visualization. This master thesis is a part of project based on DAAD co-operation between Department of Biomedical Engineering, Brno University of Technology, Eye Clinic in Erlangen and Department of Computer Science, Friedrich-Alexander University, Erlangen-Nurnberg.
|
|
|
Detekce polohy optického disku ve snímcích sítnice
Jalůvková, Lenka ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Bakalářská práce práce je zaměřena na detekci optického disku ve snímcích sítnice s cílem implementovat a porovnat různé metody. Jedná se o Gaussovu filtraci, přizpůsobenou filtraci a detekci s využitím informací o směru cév. Pro testování byla použita databáze retinálních snímků DIARETDB1. Nejlepší výsledky poskytovala Gaussova filtrace a detekce pomocí směru cév, které dosahovaly úspěšnosti 81%. Výsledky jednotlivých algoritmů jsou podrobněji popsány a porovnány v této práci.
|
|
|
Pletysmografie pro zpracování retinálních sekvencí
Plavcová, Daniela ; Valterová, Eva (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Zrak je jedním z pěti lidských smyslů a je velmi důležitým pro zkoumání blízkého i vzdáleného okolí. Tomu ovšem brání různé oční vady, které mohou souviset s cévním systémem sítnice a pulzacemi, které jsou na ní pozorovatelné. Tato práce se zabývá zkoumáním souvislostí mezi zmíněnými pulzacemi a onemocnění glaukomem. Pro hledání spojitostí mezi těmito dvěma aspekty jsou použité videozáznamy ze sítnice, s jejíž pulzací je dál pracováno ve formě 1D signálu, a to především ve spektrální oblasti.
|
|
|
Segmentace optického disku v obrazových datech sítnice
Juráček, Radek ; Mézl, Martin (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce je zaměřena na algoritmus automatické detekce optického disku v retinálních snímcích. Stručně popisuje anatomii lidského oka a principy snímání očního pozadí. Dále jsou popsány metody segmentace optického disku. Vybrané metody jsou implementovány v prostředí MATLAB a optimalizovány pomocí genetického algoritmu. Celkem pět metod bylo představeno a optimalizováno na HRF datasetu a dvou experimentálních datasetech.
|
|
|
Metody hlubokého učení pro segmentaci cév a optického disku v oftalmologických sekvencích
Rozhoňová, Andrea ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Hesko, Branislav (vedoucí práce)
Cílem následující diplomové práce bylo studium problematiky segmentace optického disku a cév sítnice v oftalmologických sekvencích. Teoretická část práce shrnuje principy různých přístupů z oblasti hlubokého učení, které se v souvislosti s danou problematikou využívají. Na základě teoretické části jsou navrženy metody pro segmentaci optického disku a pro segmentaci cév sítnice založené na konvolučních neuronových sítích Linknet, PSPNet, Unet a MaskRCNN. Popisem jejich implementace a následným zhodnocením se zabývá praktická část diplomové práce.
|
|
|
Detekce optického disku ze sekvencí snímků fundus kamery
Juráček, Radek ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Hracho, Michal (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá detekci tvarů v obraze a využitím pro automatickou detekci optického disku v záznamu z fundus kamery. Popisuje základní vlastnosti lidského oka a onemocnění postihující sítnici. Dále přestavuje dostupné metody předzpracování, segmentace a zobecnělou Houghovu, za účelem detekce optického disku.Praktická část popisuje navrhnuté metody pro detekci optického disku zaležené založené na kruhové Houhovy transformaci a přizpůsobené filtrace. Metoda přizpůsobené filtrace dosáhla na testovaných snímcích mediánu 59.1% překryvu, metoda rychlé Houghovi transformace dosáhla mediánu 24.95% překryvu a metoda klasické Houghovi transformace dosáhla medianu 29.95% překryvu.
|
|
|
Detekce optického disku v retinálních video-sekvencích
Černohorská, Lucie ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Labounková, Ivana (vedoucí práce)
Tato práce je zaměřena na detekci optického disku z retinálních snímků pořízené experimentálním video-oftalmoskopem. Stručně popisuje anatomii zrakového aparátu, jeho onemocnění a také přehled zobrazovacích a diagnostických metod sítnice. V práci jsou popsány metody pro detekci optického disku. Praktická část je zaměřena na detekci optického disku pomocí Houghovy transformace. Navržený algoritmus je testován na 25 retinálních sekvencích. Úspěšnost detekce optického disku na statickém snímku je 71,10 %. V rámci práce je detekován pohyb OD a hodnocena úspěšnost této detekce za pomocí referenčního signálu pohybu.
|
|
|
Segmentace optického disku v obrazových datech sítnice
Nohel, Michal ; Drahanský, Martin (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá segmentací optického disku a cupu v obrazových datech sítnice. V teoretické části se práce zabývá popisem optického disku a cupu a její součástí je přehled současného stavu využití metod strojového učení pro segmentaci optického disku a cupu. Dále jsou popsány základní principy a bloky konvolučních neuronových sítí. Na vytvořených databázích byly natrénovány konvoluční neuronové sítě U-Net a její modifikace nnU-Net. Tyto modely byly testovány a dosažené výsledky byly diskutovány a srovnány s vybranými publikovanými metodami. Závěrem byly modely vyhodnoceny z~hlediska možnosti jejich praktického využití.
|
|
|
Vizualizace a analýza pulsačních jevů na sítnici
Plavcová, Daniela ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Prokrvení sítnice může být odrazem stavu cévní soustavy, ale také může vypovídat o změnách intrakraniálního tlaku. Z toho důvodu jsou snímány videosekvence ze sítnice, jejichž zpracováním lze tuto oblast prozkoumat. Tato práce se zabývá analýzou a vizualizací pulzací na sítnici, představujících změnu útlumu světla během jednoho srdečního cyklu a hledáním vhodných parametrů popisujících souvislosti a rozdíly mezi daty, ať už ve formě signálů, obrazů nebo videosekvencí.
|
|
|
Pokročilá registrace obrazových sekvencí z videooftalmoskopu
Dufková, Barbora ; Chmelík, Jiří (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se věnuje problematice registrace oftalmologických video sekvencí. Popisuje základní geometrické transformace, které lze k registraci využít. Jsou také uvedeny základní metody registrace obrazů, ze kterých je vybrána nejvhodnější varianta pro tuto aplikaci. Ta je poté implementována pomocí skriptu vytvořeného v prostředí MATLAB. Navržená metoda je dále objektivně vyhodnocena metodou jasového profilu, pomocí vzájemné informace a korelace a pomocí skeletonu sítnicových cév. V diskuzi je řešen vliv polynomiální transformace na registraci a možné optimalizace algoritmu.
|
host ::
RSS.