|
|
Exploration of the tick-Borrelia molecular interactions by employing the transcriptomic approaches
MAHMOOD, Sazzad
Along with climate change and increased sharing of habitat, ticks are coming into more frequent contact with humans. The hard tick Ixodes scapularis and Ixodes ricinus are known disease vectors in Northern America and Europe, respectively. Along with many other pathogenic microorganisms, these ticks spread Borrelia sp. by ectoparasitic blood feeding. Borrelia afzelii is the major European Lyme disease pathogen spread by I. ricinus. Our study focuses on differential gene expression in I. ricinus salivary gland and midgut, induced in the nymphal stage by B. afzelii infection. Tick genes upregulated by infection are considered to play essential roles for the acquisition, persistence, and transmission of Borrelia. We have determined 32,897 full length sequences of tick mRNA from B. afzelii infected/noninfected tick salivary glands and the whole body. In addition, we have obtained MACEseq (Massive Analysis of cDNA Ends) from both midgut and salivary glands while the nymphs were non-infected or infected with B. afzelii during three different phases of blood-feeding. From the MACE database, we obtained 250-500 bp 3'-end sequences with raw quantitative expression values. Total reads, unique sequences and protein coding tick genes from midgut samples were 38,199,641, 88,825 and 24,276, and from salivary gland were 74,651,134, 93,096 and 26,179, respectively. After filtering, using several criteria, expression was validated by qPCR. Hence, the validated genes may most likely interact with Borrelia in its acquisition, persistence, or transmission to the vertebrate host. In our study, RNA interference approaches and vaccination were implemented in order to investigate the impact of upregulated tick midgut and salivary gland genes on Borrelia transmission to C3H mice.
|
|
|
Borrelia - host interactions: zoom in on the big picture.
STRNAD, Martin
The thesis was written with the intention to bring together cutting-edge imaging methods and applications in order to illustrate how imaging can answer pathogenesis-related questions in Lyme disease at various resolution scale. Correlative light and electron microscopy, atomic force microscopy-based single-molecule force spectroscopy and solution nuclear magnetic resonance have been used to shed light on the underlying mechanisms associated with Lyme disease Borrelia infection. Specifically, the key molecular players and interactions responsible for the variance in the pathogenicity and disease outcome of Borrelia species have been studied. The rationale behind such studies was highlighted by review articles, which are part of the thesis.
|
|
|
Znalosti žáků středních škol v oblasti vybraných zoonóz
Svobodová, Barbora ; Pavlasová, Lenka (vedoucí práce) ; Říhová, Dagmar (oponent)
Diplomová práce se zabývá znalostmi žáků středních škol o zoonózách. Zoonózy jsou nemoci přenášené ze zvířete na člověka. Jsou jedním z aktuálních témat v současné biologii. Cílem diplomové práce je nejprve teoretické vymezení problematiky. K testování znalostí byly vybrány tyto čtyři nemoci: toxoplazmóza, lymeská borelióza, vzteklina a Creuzfeldt-Jakobova choroba. U nich je podrobně uveden ucelený soubor informací a to především v oblasti přenosu, šíření patogenu, průběhu onemocnění, léčby a prevence. Výzkumná část zjišťuje rozsah znalostí o vybraných zoonózách u žáků středních škol. Pro výzkum byla použita metoda kvantitativního výzkumu, kterou byl didaktický test. Na základě vyhodnocených výsledků lze říci, že znalosti žáků na zkoumaných školách jsou v oblasti vybraných zoonóz poměrně uspokojivé.
|
|
|
Znalosti žáků vybrané základní školy o nemocech přenášených klíšťaty
Michálková, Pavla ; Hanušová, Jaroslava (vedoucí práce) ; Thorovská, Alena (oponent)
Hlavní výzkumný problém práce se týká charakteristiky onemocnění přenášených klíšťaty a zjištění kvantity a kvality informací, které žáci získají v hodině výchovy ke zdraví či biologie o těchto onemocněních. Teoretická část se zabývá historií, etiologií, klinickým obrazem, diagnostikou, léčbou a prevencí klíšťové encefalitidy a lymeské boreliózy. Dále se věnuje obecné problematice klíštěte a dalším onemocněním, která klíšťata přenášejí a způsobují. Uvedeno je také zařazení problematiky onemocnění přenášených klíšťaty do Rámcového vzdělávacího programu. Část praktická se věnuje informovanosti žáků na základní škole a změnám v jejich znalostech o dané problematice v průběhu jejich základního vzdělávání. Cílem diplomové práce je zjistit, jak jsou žáci informováni o onemocněních přenášených klíšťaty, zejména potom o lymeské borrelióze a klíšťové encefalitidě. K tomu je využita metoda dotazníků, které obsahují otázky týkající se této problematiky. Ačkoli výsledky výzkumu ukazují určitou míru znalostí žáků na druhém stupni ZŠ, zvláště v některých ročnících je nevyhovující. Na základě výzkumu je tedy vytvořeno doporučení pro pedagogickou praxi. KLÍČOVÁ SLOVA: klíště, klíšťová encefalitida, lymeská borrelióza, znalosti, onemocnění, základní škola
|
|
|
Molecular Docking Study Of Potential Drug Candidates Against Borreliosis
Koščová, Pavlína
Lyme borreliosis is one of the most common tick-borne infections, for which there is an extensive need to find a new drug. For this purpose our in silico docking study was carried out to identify drug-likeness of chosen small molecules – potential borreliosis drugs. Its results revealed that BesA compound (C2 form) – a membrane fusion protein present in Borrelia burgdorferi, can play a significant role as a possible drug target compound and therefore it should be further examined in development of potential drugs for Lyme borreliosis treatment.
|
|
|
Metamorphoses of \kur{Borrelia burgdorferi} sensu lato spirochetes: from dormant to motile forms
MORÁVKOVÁ, Veronika
The aim of the study was to obtain and elaborate information focused on metamorphoses of Borrelia burgdorferi sensu lato (s.l.) spirochetes. The research included detection of various stress conditions for production of dormant forms of Borrelia burgdorferi s.l. spirochetes in vitro. Subsequently, metamorphoses from dormant to motile stages was observed under favourable conditions. Proper PCR method for primers aimed to detect dormant forms of Borrelia was delevoped. The infectious potential of dormant spirochetes of Borrelia burgdorferi sensu stricto (s.s.) complex was observed in vivo. Transformations of spirochetes have also been observed in real time and individual stages have been recorded.
|
|
| |
|
|
Comparative Analysis of Common and Unique Targets in Drug Resistant Strain of Borrelia Burgdorferi
Koščová, Pavlína
The number of drug-resistant strains of Borrelia burgdorferi necessitated the identification of potential drug targets specific to the strain of interest. The chromosomal and plasmid genes of B. burgdorferi strain B31 were compared with erythromycin-resistant B. burgdorferi strain N40 to find common (core) and unique (strain-specific) genes in present study. In silico analysis of genomic data showed total number of unique genes higher in strain N40. The presence of higher number of unique genes in N40 signifies their role in drug resistance mechanism. Furthermore, human proteome was compared with proteome of these strains to find target protein specific to the strain of interest and not present in host. In conclusion, identification of unique genes in these strains provided on differences in drug resistance potential.
|
|
| |
|
|
Gene expression and infectivity of \kur{Borrelia afzelii} in the course of tick feeding
POSPÍŠILOVÁ, Tereza
Borrelia afzelii differential gene expression in the course of tick blood-feeding, and during chronic infection in mice was studied. Temperature effect on B. afzelii gene expression and infectivity was investigated. Infection rates of mice immunized with B. afzelii tick gut antigen at various stages of tick blood-intake were analyzed. This work was funded by the Grant Agency of the Czech Republic, Project No. 17-27393S to Radek Šíma.
|
host ::
RSS.