|
| |
|
| |
|
| |
|
|
3D vizualizace velkých biologických vzorků nasnímaných konfokálním mikroskopem
Čapek, Martin ; Janáček, Jiří ; Karen, Petr ; Kubínová, Lucie ; Smrčka, P. ; Hána, K.
Objemová rekonstrukce je metoda sloužící k vizualizaci trojrozměrné struktury biologických vzorků, jejichž velikost může být větší než je horizontální či axiální zorné pole snímacího systému (v našem případě laserového konfokálního mikroskopu).Velké vzorky je nutné nařezat na tenké fyzické řezy. Pak se snímají všechny sousedící a překrývající se objemové obrazy v rámci jednotlivých fyzických řezů (kompenzace omezeného horizontálního zorného pole). Takové sousedící obrazy se dále získají pro všechny sériové fyzické řezy (kompenzace omezeného axiálního zorného pole).První krok objemové rekonstrukce představuje složení překrývajících se sousedních zorných polí téhož fyzického řezu. Složené objemové obrazy fyzických řezů je pak nutno složit ve výsledný objemový obraz reprezentující celý biologický vzorek. Výsledný digitální objem jsem vizualizovali s využitím karty VolumePro nabízející 3D zobrazení rastrových dat v reálném čase
|
|
| |
|
|
Stereologická metoda pro odhad povrchu tylakoidů chloroplastu
Kubínová, Lucie ; Kutík, J.
Stereologická metoda, využívající tzv. lokální vertikální okénka, je představena a použita k odhadu povrchu tylakoidů, vztaženého na objem chloroplastu, z mikrofotografií získaných ellektronovým mikroskopem. Metoda je demonstrována na studiu ultrastruktury chloroplastů v listech kukuřice, vyvíjející se v kontrolních a chladových podmínkách
|
|
| |
|
| |
|
|
Obrazová analýza řezů pórovitého materiálu
Hejtmánek, Vladimír ; Čapek, P.
Byly porovnávány dvě metody obrazové analýzy řezů pórovitého materiálu. Za tím účelem bylo použito lineární filtrace řezů rekurzivním Gausovým filtrem. Byl nalezen práh pro rozdělení plochy řezu na pevnou a pórovitou fázi. Z řezů byly segmentací odstraněny malé shluky pixelů v pevné i pórovité fázi. Lineární filtrace redukuje velikost specifického povrchu vyhlazováním stěn pórů a ponechává malé shluky v obraze. Segmentace malých shluků z obrazu zachovává hrubost stěn pórů.
|
|
| |
host ::
RSS.