|
|
Identifikace bakterií z pozitivních hemokultur pomocí metody hmotnostní spektrometrie
Jahnová, Aneta ; Paterová, Pavla (vedoucí práce) ; Scharfen, Josef (oponent)
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Kandidát: Bc. Aneta Jahnová Školitel: MUDr. Pavla Paterová, Ústav klinické mikrobiologie FN Hradec Králové Konzultant: primářka MUDr. Alena Ševčíková, Oddělení klinické mikrobiologie FN Brno Název diplomové práce: Identifikace bakterií z pozitivních hemokultur pomocí hmotnostní spektrometrie. Cíl: Při zpracovávání pozitivních hemokultur na Oddělení klinické mikrobiologie FN Brno se metoda MALDI-TOF MS používá pro rychlou a spolehlivou identifikaci bakterií z narostlých čistých kultur již po 5 až 6 hodinové kultivaci na krevním agaru. Cílem této práce bylo zhodnotit a srovnat metody přímé identifikace etiologického agens z pozitivních hemokultur pomocí kitu SepsiTyperTM a zkumavek s gelem, které by měly snížit čas potřebný pro získání výsledku. Metoda: V této práci bylo testováno 50 pozitivních BacT/ALERT hemokultivačních lahviček. Příprava mikrobiálních vzorků probíhala paralelně za použití kitu SepsiTyperTM a odběrových zkumavek s gelem. U obou metod byla provedena extrakce ethanolem/kyselinou mravenčí a analýza na přístroji Microflex LT. Výsledky: Z padesáti testovaných hemokultur kitem SepsiTyperTM bylo správně identifikováno 24 vzorků (48 %) na druhové úrovni a 7 vzorků (14 %) na úrovni rodu....
|
|
| |
|
|
Využití MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie i dalších metod při identifikaci mikroorganismů
Šafránková, Renáta ; Žemličková, Helena (vedoucí práce) ; Sedláček, Ivo (oponent) ; Scharfen, Josef (oponent)
Úvod Metoda MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie je relativně nová metoda identifikace mikroorganismů, založená na analýze části buněčného proteomu. V posledních letech prodělala prudký rozvoj a postupně doplnila a pak i částečně nahradila do té doby dlouhodobě ověřené rutinní biochemické metody. Stala se tak nedílnou součástí mnoha mikrobiologických laboratoří a s jejím rozšířením souvisí i včasné nasazení efektivní terapie a ve výsledku zkrácení doby léčby pacienta. V těch případech, kdy potřebujeme detailnější charakterizaci mikroorganismů, můžeme dnes využít celé spektrum dalších, především molekulárně- biologických metod, polymerázovou řetězovou reakcí (PCR) počínaje, přes RFLP (polymorfismus délky restrikčních fragmentů), sekvenační analýzu amplikonů části genu pro 16S rRNA (16S rRNA), až po celogenomovou sekvenaci. Cíl práce Pomocí metody MALDI-TOF MS i jiných metod (PCR, RFLP, rozšířená biochemická identifikace) charakterizovat a/nebo reidentifikovat vybrané čtyři skupiny infekčních agens (Campylobacter spp., Plesiomonas shigelloides, Citrobacter spp., Staphylococcus intermedius/Staphylococcus pseudintermedius). Zvolená agens byla klasickými metodami identifikace (morfologie, mikroskopie, biochemické testy) testována v letech 1950-2015; hlavním cílem disertační práce bylo porovnat efektivitu původních...
|
|
|
Identifikace bakterií z pozitivních hemokultur pomocí metody hmotnostní spektrometrie
Jahnová, Aneta ; Paterová, Pavla (vedoucí práce) ; Scharfen, Josef (oponent)
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Kandidát: Bc. Aneta Jahnová Školitel: MUDr. Pavla Paterová, Ústav klinické mikrobiologie FN Hradec Králové Konzultant: primářka MUDr. Alena Ševčíková, Oddělení klinické mikrobiologie FN Brno Název diplomové práce: Identifikace bakterií z pozitivních hemokultur pomocí hmotnostní spektrometrie. Cíl: Při zpracovávání pozitivních hemokultur na Oddělení klinické mikrobiologie FN Brno se metoda MALDI-TOF MS používá pro rychlou a spolehlivou identifikaci bakterií z narostlých čistých kultur již po 5 až 6 hodinové kultivaci na krevním agaru. Cílem této práce bylo zhodnotit a srovnat metody přímé identifikace etiologického agens z pozitivních hemokultur pomocí kitu SepsiTyperTM a zkumavek s gelem, které by měly snížit čas potřebný pro získání výsledku. Metoda: V této práci bylo testováno 50 pozitivních BacT/ALERT hemokultivačních lahviček. Příprava mikrobiálních vzorků probíhala paralelně za použití kitu SepsiTyperTM a odběrových zkumavek s gelem. U obou metod byla provedena extrakce ethanolem/kyselinou mravenčí a analýza na přístroji Microflex LT. Výsledky: Z padesáti testovaných hemokultur kitem SepsiTyperTM bylo správně identifikováno 24 vzorků (48 %) na druhové úrovni a 7 vzorků (14 %) na úrovni rodu....
|
|
|
Neoclassical Realism and the Dynamics of Power in Eastern Asia: U.S. foreign policy toward China
Scharfen, Josef ; Karlas, Jan (vedoucí práce) ; Drulák, Petr (oponent)
Diplomová práce "Neoclassical Realism and the Dynamics of Power in Eastern Asia: U.S. Foreign Policy toward China" testuje teoretické hypotézy neoklasického realismu na vývoji zahraniční politiky Spojených Států vůči Číně od roku 1950 po současnost. Tato jednopřípadová studie využívá metody kongruence a proces-tracingu k testování vlivu zprostředkujících proměnných na odchylky zahraniční politiky od neorealistických předpokladů. Práce hodnotí teoretickou funkčnost neoklasického realismu a na tomto základě analyzuje možný budoucí vývoj čínsko- amerických vztahů a ve stejném duchu dále předkládá návrh na efektivní zahraniční politiku USA.
|
host ::
RSS.