|
|
Vyhledávání exonů pomocí Fourierovy transformace
Rusina, Michal ; Škutková, Helena (oponent) ; Maděránková, Denisa (vedoucí práce)
V této bakalářské práci jsou popsány metody predikce exonů. První část práce je zaměřena na rozdíl mezi prokaryotickými a eukaryotickými organismy, popis struktury DNA a vysvětlení pojmů exon a intron. Druhý úsek teoretické části obsahuje čtyři metody predikce exonů a to dynamické programování, neuronové sítě, skryté Markovovy modely a diskrétní Fourierovu transformaci. V praktické části byl vytvořen program Predikce_exonu, který vyhledává exony v nukleotidových sekvencích a pracuje na principu Fourierovy transformace. Tento algoritmus spolu s třemi volně dostupnými programy byl testován na 25 sekvencích a úspěšnost jejich predikce byla popsána senzitivitou a specificitou.
|
|
|
Stanovení vlastností ultrazvukových sond
Rusina, Michal ; Mézl, Martin (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá měřením vlastností ultrazvukových sond. Ultrazvukové sondy a jejich parametry zásadně ovlivňuji kvalitu výsledného zobrazení. Hodnoty parametrů sond se mohou vlivem používání měnit, jelikož může docházet k jejich opotřebení nebo k poškození a výsledné zobrazení již nemusí být korektní. Z těchto důvodů je měření parametrů sond velice důležité. V práci jsou popsány a realizovány možnosti měření prostorového rozlišení, ohniskové zóny, citlivosti sondy a měření délky mrtvé zóny. Pro měření byly použity dva ultrazvukové fantomy. V praktické části byl vytvořen program Mereni_parametru, který umožňuje zjistit hodnoty čtyř uvedených parametrů z nasnímaných snímků fantomu. Dále jsou v práci uvedeny a popsány naměřené hodnoty pro pět ultrazvukových sond. Výsledky pro dvě z těchto sond jsou pak srovnány s parametry, které udávají výrobci.
|
|
|
Vyhledávání exonů pomocí Fourierovy transformace
Rusina, Michal ; Škutková, Helena (oponent) ; Maděránková, Denisa (vedoucí práce)
V této bakalářské práci jsou popsány metody predikce exonů. První část práce je zaměřena na rozdíl mezi prokaryotickými a eukaryotickými organismy, popis struktury DNA a vysvětlení pojmů exon a intron. Druhý úsek teoretické části obsahuje čtyři metody predikce exonů a to dynamické programování, neuronové sítě, skryté Markovovy modely a diskrétní Fourierovu transformaci. V praktické části byl vytvořen program Predikce_exonu, který vyhledává exony v nukleotidových sekvencích a pracuje na principu Fourierovy transformace. Tento algoritmus spolu s třemi volně dostupnými programy byl testován na 25 sekvencích a úspěšnost jejich predikce byla popsána senzitivitou a specificitou.
|
|
|
Stanovení vlastností ultrazvukových sond
Rusina, Michal ; Mézl, Martin (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá měřením vlastností ultrazvukových sond. Ultrazvukové sondy a jejich parametry zásadně ovlivňuji kvalitu výsledného zobrazení. Hodnoty parametrů sond se mohou vlivem používání měnit, jelikož může docházet k jejich opotřebení nebo k poškození a výsledné zobrazení již nemusí být korektní. Z těchto důvodů je měření parametrů sond velice důležité. V práci jsou popsány a realizovány možnosti měření prostorového rozlišení, ohniskové zóny, citlivosti sondy a měření délky mrtvé zóny. Pro měření byly použity dva ultrazvukové fantomy. V praktické části byl vytvořen program Mereni_parametru, který umožňuje zjistit hodnoty čtyř uvedených parametrů z nasnímaných snímků fantomu. Dále jsou v práci uvedeny a popsány naměřené hodnoty pro pět ultrazvukových sond. Výsledky pro dvě z těchto sond jsou pak srovnány s parametry, které udávají výrobci.
|
host ::
RSS.