|
|
Výskyt a význam konformace "molten-globule" v proteinech
Plutinský, Martin ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Martínek, Václav (oponent)
Součástí práce je literární rešerše na téma molten globule. Tento konformační stav vzniká obecně v roztocích některých bílkovin za použití mírných denaturačních podmínek jako termodynamicky stabilní stav. Někdy se pozoruje při zpětném sbalování meziprodukt taky s vlastnostmi molten globule. Předpokládá se, a u některých proteinů to bylo i prokázáno, že molten globule je identická při rozbalování a zpětném sbalení do nativního stavu. Druhá část práce se věnuje konformačním změnám ferricytochromu c z koňského srdce při pH v kyselé oblasti s i bez přídavku 0,5 M chloridu sodného. Cytochrom c je mitochondriální bílkovina sloužící jako mobilní přenašeč v dýchacím řetězci. Konformační změny jsem sledoval pomocí metody UV/VIS a derivační spektroskopie ve čtyřech oblastech absorpčního spektra cytochromu c - oblast absorpce aromatických aminokyselin, Soretův pás, Q pás a CT pás. Přítomnost chloridových aniontů (zvýšená iontová síla) stabilizuje pravděpodobně konformační stav molten globule v rozsahu pH 1,90-2,60. V roztocích bez přídavku soli jsem pozoroval změny polarity v okolí tyrosinových a tryptofanového zbytku (mezi pH 2,60 a 2,30) tak změny ve spinových stavech železa (kolem pH 2,10) v důsledku denaturace proteinu.
|
|
|
Konformační změny cytochromu c v kyselém prostředí
Plutinský, Martin ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Šulc, Miroslav (oponent)
Část mojí práce bola zaměřená na rešerši literatury o konformačních změnách cytochromu c. Hlavní cíl výzkumu o této bílkovině je objasnit důležitost a roli konformačních změn. Cytochrom c se váže na vnitřní mitochondriální membránu bojatou na kardiolipin. Předpokládá se, že konformační stavy podobné molten globule hrají zatím neobjasněnou roli při spuštění apoptosy. Cytochrom c je modelový protein pro studium sbalování bílkovin. Je to jednoduchý, malý protein, který lze lehce získat a je možné ho studovat pomocí široké škály experimentálních technik. Druhá část projektu přináší experimenty s koňským cytochromem c v kyselém prostředí s přídavkem anorganických solí. Konformační změny jsem měřil pomocí UV-VIS spektrofotometrie v čtyřech oblastech absorpčního spektra - oblast absorpce aromatických aminokyselin, Soretův pás, Q pás a CT pás. Použil jsem techniku derivačních spekter pro získaní dalších informací.
|
|
|
Konformační změny cytochromu c v kyselém prostředí
Plutinský, Martin ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Šulc, Miroslav (oponent)
Část mojí práce bola zaměřená na rešerši literatury o konformačních změnách cytochromu c. Hlavní cíl výzkumu o této bílkovině je objasnit důležitost a roli konformačních změn. Cytochrom c se váže na vnitřní mitochondriální membránu bojatou na kardiolipin. Předpokládá se, že konformační stavy podobné molten globule hrají zatím neobjasněnou roli při spuštění apoptosy. Cytochrom c je modelový protein pro studium sbalování bílkovin. Je to jednoduchý, malý protein, který lze lehce získat a je možné ho studovat pomocí široké škály experimentálních technik. Druhá část projektu přináší experimenty s koňským cytochromem c v kyselém prostředí s přídavkem anorganických solí. Konformační změny jsem měřil pomocí UV-VIS spektrofotometrie v čtyřech oblastech absorpčního spektra - oblast absorpce aromatických aminokyselin, Soretův pás, Q pás a CT pás. Použil jsem techniku derivačních spekter pro získaní dalších informací.
|
|
|
Výskyt a význam konformace "molten-globule" v proteinech
Plutinský, Martin ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Martínek, Václav (oponent)
Součástí práce je literární rešerše na téma molten globule. Tento konformační stav vzniká obecně v roztocích některých bílkovin za použití mírných denaturačních podmínek jako termodynamicky stabilní stav. Někdy se pozoruje při zpětném sbalování meziprodukt taky s vlastnostmi molten globule. Předpokládá se, a u některých proteinů to bylo i prokázáno, že molten globule je identická při rozbalování a zpětném sbalení do nativního stavu. Druhá část práce se věnuje konformačním změnám ferricytochromu c z koňského srdce při pH v kyselé oblasti s i bez přídavku 0,5 M chloridu sodného. Cytochrom c je mitochondriální bílkovina sloužící jako mobilní přenašeč v dýchacím řetězci. Konformační změny jsem sledoval pomocí metody UV/VIS a derivační spektroskopie ve čtyřech oblastech absorpčního spektra cytochromu c - oblast absorpce aromatických aminokyselin, Soretův pás, Q pás a CT pás. Přítomnost chloridových aniontů (zvýšená iontová síla) stabilizuje pravděpodobně konformační stav molten globule v rozsahu pH 1,90-2,60. V roztocích bez přídavku soli jsem pozoroval změny polarity v okolí tyrosinových a tryptofanového zbytku (mezi pH 2,60 a 2,30) tak změny ve spinových stavech železa (kolem pH 2,10) v důsledku denaturace proteinu.
|
host ::
RSS.