|
|
Noncovalent Interactions of Biologically Active Compounds
Osifová, Zuzana ; Dračínský, Martin (vedoucí práce) ; Lyčka, Antonín (oponent) ; Sýkora, Jan (oponent)
Předkládaná disertační práce se zabývá studiem nekovalentních interakcí biologicky aktivních molekul pomocí spektroskopie nukleární magnetické rezonance (NMR spektroskopie) a teoretických výpočtů. Teoretický úvod práce slouží jako základní přehled literatury vyzdvihující nejdůležitější spektroskopické studie nekovalentních interakcí. Současně tato část představuje NMR spektroskopii i širšímu publiku. Téměř učebnicový text o fyzikálních aspektech této metody tak čtenáři zajišťuje snazší orientaci v experimentální části. Obdobně jsou v práci představeny i základy výpočetní chemie. Cílem disertační práce bylo popsat roli nekovalentních interakcí v systémech biologicky aktivních molekul. Experimentální část práce se detailně zabývá vodíkovými vazbami modifikovaných nukleových bází, interakcemi ovlivňujícími keto-enol tautomerii farmakologicky aktivních molekul a vlivem primárních struktur v krátkých peptidových sekvencích na jejich schopnost adaptovat konformační motivy obdobné sekundárním strukturám proteinů. Methylace a oxidace se řadí mezi nejčastější přirozené modifikace nukleových bází. Jejich vlivem dochází ke změnám v základní schopnosti nukleových bází tvořit vodíkové vazby se svými partnery. V rámci disertační práce bylo například objeveno, že methylace dusíku aminoskupiny, která se v molekule...
|
|
|
Interakce materiálu očních protéz s proteiny
Osifová, Zuzana ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Martínek, Václav (oponent)
Tato bakalářská práce se zabývá tématikou očních protéz. Problematika je v práci široce rešeršně zpracována. Důraz je kladen na adsorpci proteinů na syntetický povrch. Experimentální část práce je zaměřena na adsorpci lysozymu na polymethylmethakrylátovou destičku. Adsorpce proteinu na materiál byla nižší než stanovený limit detekce. Podle experimentálních dat byla tato hodnota nižší než 5,37 μg/cm2 . V rámci práce bylo provedeno i orientační šetření ohledně znalostí studentů středních škol o problematice očních protéz. Z výsledků vyplývá nepatrně větší informovanost u studentů zaměřených spíše přírodovědným směrem.
|
|
|
Intermolecular Hydrogen Bonds Studied by NMR Spectroscopy
Osifová, Zuzana
N-methylace nukleových kyselin je jeden z nejdůležitějších epigenetických mechanismů v genomech organismů a virů. N-methylované nukleobáze jsou v lidském genomu registrovány ve spojitosti s fyziologickými i patologickými procesy. Například methylace adeninu vedoucí ke vzniku N6 -methyladeninu je spojována s rozvojem Alzheimerovy nemoci či obezity. Tyto systémy mohou být snadno studovány pomocí nízkoteplotní NMR spektroskopie, protože řád vazby mezi purinovým kruhem a jeho substituentem má částečně charakter násobné vazby. Díky omezené rotaci kolem této vazby lze jednotlivé rotamery odlišit v nízkoteplotních NMR spektrech jako dvě sady signálů. Tato diplomová práce je zaměřena na výzkum rotamerních rovnováh N- methylovaných nukleobází a na výzkum změn volné Gibbsovy energie spojené se vznikem jejich páru s komplementárním partnerem za pomoci jednoduché a přímé metody NMR spektroskopie. Touto metodou jsme prokázali, že rotamerní rovnováhy N-methylovaných derivátů adeninu jsou závislé na teplotě, rozpouštědle a na koncentraci komplementárního partnera. S pomocí námi nově vyvinuté metodiky založené na pozorování změn chemických posunů závislých na koncentraci vazebného partnera jsme získali nejen geometrie vznikajících párů komplementárních derivátů adeninu s thyminem, ale i změny Gibbsovy energie...
|
|
|
Intermolecular Hydrogen Bonds Studied by NMR Spectroscopy
Osifová, Zuzana ; Dračínský, Martin (vedoucí práce) ; Blahut, Jan (oponent)
N-methylace nukleových kyselin je jeden z nejdůležitějších epigenetických mechanismů v genomech organismů a virů. N-methylované nukleobáze jsou v lidském genomu registrovány ve spojitosti s fyziologickými i patologickými procesy. Například methylace adeninu vedoucí ke vzniku N6 -methyladeninu je spojována s rozvojem Alzheimerovy nemoci či obezity. Tyto systémy mohou být snadno studovány pomocí nízkoteplotní NMR spektroskopie, protože řád vazby mezi purinovým kruhem a jeho substituentem má částečně charakter násobné vazby. Díky omezené rotaci kolem této vazby lze jednotlivé rotamery odlišit v nízkoteplotních NMR spektrech jako dvě sady signálů. Tato diplomová práce je zaměřena na výzkum rotamerních rovnováh N- methylovaných nukleobází a na výzkum změn volné Gibbsovy energie spojené se vznikem jejich páru s komplementárním partnerem za pomoci jednoduché a přímé metody NMR spektroskopie. Touto metodou jsme prokázali, že rotamerní rovnováhy N-methylovaných derivátů adeninu jsou závislé na teplotě, rozpouštědle a na koncentraci komplementárního partnera. S pomocí námi nově vyvinuté metodiky založené na pozorování změn chemických posunů závislých na koncentraci vazebného partnera jsme získali nejen geometrie vznikajících párů komplementárních derivátů adeninu s thyminem, ale i změny Gibbsovy energie...
|
|
|
Interakce materiálu očních protéz s proteiny
Osifová, Zuzana ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Martínek, Václav (oponent)
Tato bakalářská práce se zabývá tématikou očních protéz. Problematika je v práci široce rešeršně zpracována. Důraz je kladen na adsorpci proteinů na syntetický povrch. Experimentální část práce je zaměřena na adsorpci lysozymu na polymethylmethakrylátovou destičku. Adsorpce proteinu na materiál byla nižší než stanovený limit detekce. Podle experimentálních dat byla tato hodnota nižší než 5,37 μg/cm2 . V rámci práce bylo provedeno i orientační šetření ohledně znalostí studentů středních škol o problematice očních protéz. Z výsledků vyplývá nepatrně větší informovanost u studentů zaměřených spíše přírodovědným směrem.
|
host ::
RSS.