|
| |
|
|
Ecophysiological characteristics of key members of Betaproteobacteria in freshwater bacterioplankton
KASALICKÝ, Vojtěch
This thesis primarily focuses on one segment of freshwater Betaproteobacteria, the Limnohabitans genus (including the RBT lineage). As opposed to other recent research directions, the major aim was to recover the members of the previously uncultured RBT lineage through their isolation from various freshwater habitats. However, the results presented in this thesis have also ambitions to go far beyond the taxonomic descriptions only; the dissertation intends to contribute significantly to unveiling of important ecophysiological characteristics of the studied lineage in a set of both laboratory and field research. Therefore, understanding of growth characteristics, mortality, diversity and life strategies of aquatic microbes is of highest importance regarding profound human impact on water quality and increasing need of drinking water supplies.
|
|
| |
|
|
Detekce mikroorganismů v půdě metodou CARD-FISH (Catalyzed Reporter Deposition - Fluorescence in situ Hybridization)
Krištůfek, Václav ; Kasalický, Vojtěch ; Chroňáková, Alica ; Elhottová, Dana ; Němec, Jan
Pro detekci půdních mikroorganismů byla na pracovišti Ústavu půdní biologie zavedena metoda CARD-FISH (Catalyzed Reporter Deposition - Fluorescence in situ Hybridization). CARD-FISH je relativně nová molekulární metoda pro zjištění podílu jednotlivých skupin mikroorganismů pomocí oligonukleotidových sond. Oproti klasické metodě FISH využívá enzymatické aktivity k zesílení signálu a tím umožňuje výrazně kvalitnější detekci mikroorganismů v půdě nebo organických substrátech. Metodou bylo poprvé sledováno složení bakteriálního společenstva datované vrstvy kupy netopýřího guána z jeskyně Domica (NP Slovenský kras). Bylo stanoveno procentické zastoupení těchto skupin mikroorganismů: bakterie (většina bakterií, .i.Planktomycetales, Verrucomicrobiales./i.), archaea, actinobacteria, proteobacteria, .i.Cytophaga-Flavobacter./i.-Bacteroidetes, sfingobacteria.
|
|
|
Fotosyntetické cirkadiální rytmy u mořské rozsivky Thalassiosira weissflogii v podmínkách dostatku a nedostaku dusíku
Kasalický, Vojtěch ; Rottnerová, K. ; Sciandra, A. ; Babin, M. ; Prášil, Ondřej
T. weissflogii byla pěstována v podmínkách dynamické ozářenosti (sinusoidní režim) a poté přenesa na konstantní světlo o nízké intenzitě. Buněčné charakteristiky (obsah pigmentů a nutrientů, velikost buněk) indikovaly synchronizaci řasové populace, dále byly pozorovány výrazné změny v aktivitě variabilní fluorescence, termoluminiscence a v expresi genů (rbcL, psbA, fcp)
|
host ::
RSS.