|
|
Detection of positive selection in reproductive genes of songbirds
Cakl, Lukáš ; Reifová, Radka (vedoucí práce) ; Těšický, Martin (oponent)
Předpokládá se, že geny ovlivňující reprodukci hrají důležitou roli jak v adaptivní evoluci, tak ve speciaci. U ptáků však zatím neexistuje mnoho informací o molekulární evoluci těchto genů. Tato práce se zabývá identifikací reprodukčních genů podléhajících pozitivní selekci v genomech pěvců a analýzou jejich funkcí. Ze 14 pub- likovaných genomů jsme nejdříve sestavili 12000 skupin ortologních genů a v 385 z nich existujícími metodami detekovali stopy dlouhodobé pozitivní selekce. Díky publikovaným proteomickým datům jsme celogenomový soubor genů mohli zúžit na geny exprimované ve spermiích a v tekutinách ze samičího pohlavního traktu. Ve spermiích pozitivní selekce působila na 22 z 940 exprimovaných genů, zatímco v samičích tekutínách jen na 6 z 529, což poukazuje na konzervativnější chování proteinů v samičích tekutinách. Následně jsme detekovali nadměrné zastoupení jednotlivých funkcí proteinů tak, jak jsou popsané v gene ontology. U spermií naše výsledky poukázaly na evoluční tlak působící zejména na je- jich cytoskelet, molekulární motory a energetický metabolismus, což naznačuje důležitost morfologie spermií a rychlosti jejich pohybu. Napříč celým genomem pak výsledky nejen potvrzovaly výsledky získané u spermií, ale též poukazovaly na pozitivní selekci procesů spjatých s mitózou a meiózou....
|
|
|
Detekce pozitivní selekce na molekulární úrovni
Cakl, Lukáš ; Reifová, Radka (vedoucí práce) ; Munclinger, Pavel (oponent)
Nárůst výpočetního výkonu a množství dostupných genomických dat nám v dnešní době umožňuje zkoumat stopy selekce na sekvencích nukleových kyselin. Abychom získali co nejrelevantnější výsledky, je třeba se zamyslet nad tím, jak tyto stopy vznikají, jaké vlastností mají, jak je detekovat a ve kterých případech používat které metody. V této bakalářské práci se budeme věnovat nejen samotným metodám detekce selekce a jejich principům, ale i teoretickým modelům umožňujícím jejich vznik, neutrálním teoriím, vůči kterým můžeme stopy selekce srovnávat, ale také oněm stopám samotným. Vzhledem k dynamice genomu jsou totiž pro volbu metody, krom dostupných dat, rozhodující právě vlastnosti těchto stop. Zejména, když vezmeme v potaz, že některé stopy vznikají v evolučním měřítku za poměrně krátkou dobu a brzy po selekci opět mizí, zatímco vznik jiných trvá velmi dlouhou dobu. Klíčová slova: darwinovská selekce, pozitivní selekce, statistické metody, detekce selekce, dna, molekulární data
|
|
|
Význam a chemické složení půdních humusových látek
Cakl, Lukáš
Bakalářská práce na téma Význam a chemické složení půdních humusových látek je zaměřena na kvalitativní charakteristiku půdních humusových látek. Bylo sledováno chemické složení půdních huminových kyselin izolovaných z hnědozemě oglejené (Lesonice) pomocí standardních metod. Výsledky byly porovnány s huminovými kyselinami izolovanými z jiných zdrojů např. z lignitu (Mikulčice) a kompostu (Náměšť nad Oslavou). Výsledky demonstrují, že huminové kyseliny izolované z různých zdrojů mají různý obsah elementárních prvků, aminokyselin, polyfenolů, tuků a peptidů.
|
|
|
Biochemické ukazatele vybraných půdních typů
Cakl, Lukáš
Diplomová práce se zabývá kvantitativní charakteristikou glomalinu na 3 lokalitách (Hrušky, Bošovice a Zástřizly). Stanovován byl takzvaný lehce extrahovatelný glomalin s využitím Bradfordovy metody. Provedenou analýzou jsme zjistili závislost množství glomalinu na pH a fyziologicky využitelném dusíku (N/B). Zjištěné hodnoty glomalinu byly relativně nízké, avšak vzhledem k tomu, že se jednalo o orné půdy je lze označit jako standardní. Dále byl prokázán také pokles obsahu glomalinu s hloubkou půdy. Všechny tyto výsledky korelují s jinými odbornými publikacemi. Naše výsledky ukazují, že obsah glomalinu je jedním z nejcitlivějších biologických atributů reagující na zásahy do půdy.
|
|
|
Význam LZS v péči o nemocného
Cakl, Lukáš ; Schneiderová, Michaela (vedoucí práce) ; Kupečková, Ivana (oponent) ; Klicperová, Zuzana (oponent)
75 ANOTACE Autor: Lukáš Cakl Instituce: Ústav sociálního léka ství LF UK v Hradci Králové. Odd lení ošet ovatelství Název práce: Význam LZS v péči o nemocného Vedoucí práce: Mgr. Michaela Schneiderová Počet stran: 104 Počet p íloh: 12 Rok obhajoby: 2010 Klíčová slova: LZS, léka , záchraná , nemocný, péče SOUHRN: Bakalá ská práce prezentuje Leteckou záchrannou službu jako d ležitý prvek v systému zdravotnické záchranné služby. Teoretická část mapuje historii, vývoj a p ibližuje práci všech člen Letecké záchranné služby. T žišt m práce je empirická část vzniklá na podklad kvantitativního výzkumu metodou nestandardizovaného dotazníkového šet ení. Hlavním význam je kladen na zmapování vzájemné spolupráce a náročnost péče o nemocného. Výzkumného šet ení se z častnilo v období b ezen - duben 2010, 25 respondent - léka a 25 respondent - záchraná pracující v Jihlav a Hradci Králové u Letecké záchranné služby.
|
host ::
RSS.