National Repository of Grey Literature 2 records found  Search took 0.01 seconds. 
Throughput optimization of a multistage data visualisation pipeline
Molnárová, Soňa ; Šmelko, Adam (advisor) ; Nečaský, Martin (referee)
Recent technological advances allowed vast increases of the size of datasets acquired by flow cytometry. With more cells and features captured, manual exploration and analysis of the data become challenging; multiple unsuper- vised methods were thus created to simplify the task. This thesis describes BlosSOM, a software that further improves the analysis possibilities by allow- ing interactive CUDA-accelerated supervision of the most common analysis approaches - dimensionality reduction, clustering, and annotation. The thesis overviews the features of BlosSOM implemented by the thesis author for the previous research project and details new developments, mainly a new dynamic workload balancing approach that allows BlosSOM to easily scale to very complex datasets while maintaining interactive framerate. To- gether with other improvements, BlosSOM is a production-ready software that offers all essential tools to analyze the flow cytometry data.
Interactive environment for flow-cytometry data analysis
Molnárová, Soňa ; Kratochvíl, Miroslav (advisor) ; Pacovský, Jan (referee)
Pr·toková cytometrie je metoda pro měření chemických vlastností jed- notlivých buněk v roztoku, s aplikacemi v biologickém a klinickém výzkumu. Nedávny pokrok technologií pr·tokové cytometrie umožňuje mimořádně snadně vyrobit větší soubory dat, které popisují další zajímavé jevy, které vytváří nové výzvy pro zpracování dat a softwaru pro analýzu. Tato práce popisuje a implementuje prototyp softwaru, který zjednodušuje zpracování dat im- plementací interaktivního pipeline editoru pro analýzu, který je navržen tak, aby efektivně zpracovával obrovské soubory dat. Funkcionalita soft- waru je demonstrována implementací nejnovějšího algoritmu analýzy dat a porovnáním efektivity zdroj· s typickým nástrojem pro analýzu v pro- gramu R. Budoucí využití softwaru biology a lékaři je usnadněno poskytnutím jednoduchého rozhraní pro přidávání nových algoritm·, čímž se rozšiřuje funkčnost. 1

Interested in being notified about new results for this query?
Subscribe to the RSS feed.