|
|
Fluorescence correlation spectroscopy in colloid systems
Janíček, Tomáš ; Smilek, Jiří (referee) ; Mravec, Filip (advisor)
This work is focused on studying of stability and interaction in colloidal systems created by micelles of surfactant CTAB in solution of hyaluronic acid and water. As method chose for this work was selected fluorescence correlation spectroscopy. As dye was used Nile red. Measurements were divided firstly by size of polymeric chain and secondly by concentration of hyaluronic acid. Purpose of this work was to find out how will CTAB particles react with different sizes and concentration of hyaluronic acid. For comparison to hyaluronic acid was used Poly(sodium-4-styrenesulfonate).
|
|
|
Influence of a composition of hybridization mixtures on fluorescence intensity during the in-situ hybridization
Janíček, Tomáš ; Kejík, Lukáš (referee) ; Vojtěch,, Hudzieczek (advisor)
Fluorescenční in situ hybridizace (FISH) je široce používaná metoda pro detekci určité sekvence DNA na chromozomech. Cílem práce je porovnání tří různých chemických sloučenin (formamidu, ethylenkarbonátu a sodných kationtů) používaných ve směsích pro in situ hybridizaci. Složení těchto směsí ovlivňuje renaturaci DNA a je důležité porovnat jejich fyzikální vlastnosti. Práce je rozdělena do dvou hlavních částí. První část se zabývá otázkou termodynamických parametrů používaných pro experimenty FISH, jako je teplota tání, entalpie přechodu DNA ze dvoušroubovice na vlákno nám dává přehled o energii potřebné k tomto přechodu a interakcích mezi bázemi a každou složkou směsi. Kromě toho hodnoty entropie určují poř uvnitř směsi - systém DNA. Druhá část porovnává intenzitu fluorescenčního signálu při optimalizovaných teplotách tání sondy použité pro in situ hybridizaci. Jako sonda byla použita sub-telomerní repetice X43.1, která je umístěna na Y chromozomu rostlinného modelového organismu Silene latifolia. Směs obsahující formamid má nejlepší výkon při delším postupu hybridizace, zatímco ethylenkarbonát poskytuje vyšší intenzitu signálu, a proto je vhodnější pro rychlé FISH protokoly.
|
|
|
Influence of a composition of hybridization mixtures on fluorescence intensity during the in-situ hybridization
Janíček, Tomáš ; Kejík, Lukáš (referee) ; Vojtěch,, Hudzieczek (advisor)
Fluorescenční in situ hybridizace (FISH) je široce používaná metoda pro detekci určité sekvence DNA na chromozomech. Cílem práce je porovnání tří různých chemických sloučenin (formamidu, ethylenkarbonátu a sodných kationtů) používaných ve směsích pro in situ hybridizaci. Složení těchto směsí ovlivňuje renaturaci DNA a je důležité porovnat jejich fyzikální vlastnosti. Práce je rozdělena do dvou hlavních částí. První část se zabývá otázkou termodynamických parametrů používaných pro experimenty FISH, jako je teplota tání, entalpie přechodu DNA ze dvoušroubovice na vlákno nám dává přehled o energii potřebné k tomto přechodu a interakcích mezi bázemi a každou složkou směsi. Kromě toho hodnoty entropie určují poř uvnitř směsi - systém DNA. Druhá část porovnává intenzitu fluorescenčního signálu při optimalizovaných teplotách tání sondy použité pro in situ hybridizaci. Jako sonda byla použita sub-telomerní repetice X43.1, která je umístěna na Y chromozomu rostlinného modelového organismu Silene latifolia. Směs obsahující formamid má nejlepší výkon při delším postupu hybridizace, zatímco ethylenkarbonát poskytuje vyšší intenzitu signálu, a proto je vhodnější pro rychlé FISH protokoly.
|
|
|
The effect of selected sesquiterpenes on antioxidant enzymes in Caco-2 cell line
Janíček, Tomáš ; Svobodová, Hana (advisor) ; Raisová Stuchlíková, Lucie (referee)
Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Tomáš Janíček Supervisor: PharmDr. Hana Svobodová, Ph.D. Title of diploma thesis: The effect of selected sesquiterpenes on antioxidant enzymes in Caco-2 cell line Colorectal carcinoma is a very frequent type of malignant neoplasms, while the Czech Republic has the sixth highest incidence of this disease globally. Current chemotherapy is often not an ideal option, and there is an effort to find substances that could replace it or reduce its dosage, and therefore its adverse effects. A promising source of natural substances is the Chinese tree Myrica rubra, whose extracts have inhibited the proliferation of many tumour cell lines. Also, in several colon carcinoma cell lines, the growth inhibition was observed after their cultivation with the essential oil from the M. rubra's leaves (SMR), with the Caco-2 line being the most sensitive. The main sesquiterpenes of SMR β-caryophyllene, α-humulene (α-HUM), trans-nerolidol (t-NER) and valencene proved the antiproliferative effects on this cell line too. α-HUM and t-NER showed the formation of reactive oxygen species (ROS) on colon carcinoma cells. The aim of our work was to find out how SMR, α-HUM and t-NER at concentrations of 25 and 50 μg/ml, influence...
|
|
|
The effect of selected sesquiterpenes on antioxidant enzymes in Caco-2 cell line
Janíček, Tomáš ; Svobodová, Hana (advisor) ; Raisová Stuchlíková, Lucie (referee)
Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Tomáš Janíček Supervisor: PharmDr. Hana Svobodová, Ph.D. Title of diploma thesis: The effect of selected sesquiterpenes on antioxidant enzymes in Caco-2 cell line Colorectal carcinoma is a very frequent type of malignant neoplasms, while the Czech Republic has the sixth highest incidence of this disease globally. Current chemotherapy is often not an ideal option, and there is an effort to find substances that could replace it or reduce its dosage, and therefore its adverse effects. A promising source of natural substances is the Chinese tree Myrica rubra, whose extracts have inhibited the proliferation of many tumour cell lines. Also, in several colon carcinoma cell lines, the growth inhibition was observed after their cultivation with the essential oil from the M. rubra's leaves (SMR), with the Caco-2 line being the most sensitive. The main sesquiterpenes of SMR β-caryophyllene, α-humulene (α-HUM), trans-nerolidol (t-NER) and valencene proved the antiproliferative effects on this cell line too. α-HUM and t-NER showed the formation of reactive oxygen species (ROS) on colon carcinoma cells. The aim of our work was to find out how SMR, α-HUM and t-NER at concentrations of 25 and 50 μg/ml, influence...
|
|
|
Fluorescence correlation spectroscopy in colloid systems
Janíček, Tomáš ; Smilek, Jiří (referee) ; Mravec, Filip (advisor)
This work is focused on studying of stability and interaction in colloidal systems created by micelles of surfactant CTAB in solution of hyaluronic acid and water. As method chose for this work was selected fluorescence correlation spectroscopy. As dye was used Nile red. Measurements were divided firstly by size of polymeric chain and secondly by concentration of hyaluronic acid. Purpose of this work was to find out how will CTAB particles react with different sizes and concentration of hyaluronic acid. For comparison to hyaluronic acid was used Poly(sodium-4-styrenesulfonate).
|
guest ::
