|
|
Molekulární mechanismus regulace funkce kaspasy-2 pomocí proteinů 14-3-3
Kalábová, Dana ; Obšilová, Veronika (vedoucí práce) ; Pavlíček, Jiří (oponent) ; Žáková, Lenka (oponent)
Molekulární mechanismus regulace funkce kaspasy-2 pomocí proteinů 14-3-3 Abstrakt Kaspasa-2 je proteasa stojící apikálně v kaskádě dějů vedoucích k apoptose. Správně vedený proces apoptosy likviduje poškozené buňky, autoreaktivní lymfocyty či nadbytečné skupiny buněk v ontogenezi. Proces aktivace kaspasy-2 musí být přesně regulovaný. Jedním z popsaných způsobů regulace kaspasy-2 způsobující její inhibici je posttranslační modifikace fosforylace spojená s následnou vazbou regulačního skafoldového proteinu 14-3-3. Cílem disertační práce je vysvětlit molekulární mechanismus této regulace. Pro porozumění interakce mezi proteiny bylo nezbytné nejprve určit fosforylační místa v molekule kaspasy-2 rozpoznávaná proteinem 14-3-3 a poté popsat detailní strukturu vazebného komplexu. Struktura byla popsána řadou biochemických a biofyzikálních metod, jako je analytická centrifugace, nativní elektroforesa v TBE pufru, polarizačně fluorescenční esej, vodík/deuteriová výměna spojená s hmotnostní spektrometrií či krystalizace, a výsledky vedly k podnětným závěrům. Aktivace kaspasy-2 začíná její vazbou na adaptorové proteiny, štěpením a dimerizací katalytických podjednotek. Z výsledků vyplynulo, že protein 14-3-3 může svou vazbou inhibovat aktivaci kaspasy-2 skrze blokování sekvencí nezbytných pro dimerizaci a/nebo vazbu...
|
|
|
Odhalení molekulárních mechanismů opravy abazického meziřetězcového spojení DNA
Hušková, Andrea ; Šilhán, Jan (vedoucí práce) ; Bařinka, Cyril (oponent) ; Pavlíček, Jiří (oponent)
3 Abstrakt DNA jako primární nositelka genetické informace zaručuje organismům žít, růst, rozvíjet se a množit. Tato nejpodstatnější molekula v buňce však podléhá každou chvíli rozličným poškozením. Pokud není opraveno, buňka a organismus nakonec podlehne nevyhnutelné destrukci. Jedno z nejzávažnějších poškození je meziřetězcové kovalentní spojení DNA vycházející z abazického místa (Ap-ICL, z angl. Abasic site interstrand crosslink). Ap-ICL se tvoří spontánně z abazického místa kovalentní vazbou s adeninem na opačném řetězci. Nedostatek informací o opravných mechanismech, vlivu lokální sekvence a jeho stabilitě vede k otázkám ohledně osudu, toxicitě a výskytu těchto lézí v buňkách. Evoluce vytvořila několik mechanismů jak tato a další jiná poškození opravit a zajistit organismu jeho přetrvání. Nedávno objevená dráha známa pro opravu Ap-ICL dostala název po glykosylase zodpovědné za odstranění Ap-ICL. DNA glykosylasa NEIL3 je k Ap-ICL přivolána ubiquitylací DNA helikasy, která je součástí komplexu zodpovědného za replikaci DNA. Glykosylasa NEIL3 obsahuje několik domén s motivem zinkového prstu, které se vážou k poškozené DNA a zajišťují její katalytickou funkci. Momentálně není znám molekulární mechanismus opravného procesu glykosylasy NEIL3. S cílem odpovědět na zmíněné neznámé byla v předložené práci...
|
|
|
Bytový dům
Pavlíček, Jiří ; Dohnal, Jakub (oponent) ; Pěnčík, Jan (vedoucí práce)
Předmětem bakalářské práce je vypracování projektové dokumentace pro provádění stavby bytového domu. Jedná se o samostatně stojící podsklepenou budovu, která je umístěna na obdélníkovém pozemku s rovinným terénem. Objekt je navržen se čtyřmi nadzemními podlažími a jedním podzemním podlažím. Novostavba je vybavena přepravním výtahem pro 8 osob. V podzemním podlaží se nachází technické zázemí objektu a skladovací sklepní kóje pro jednotlivé byty. V nadzemních podlažích je navrženo celkem 12 bytů s odlišností dispozic a velikostí podlahových ploch. Nosný konstrukční systém je stěnový příčný. Spodní stavba je navržena z vodonepropustného betonu tzv. „bílé vany“ tvoří ji železobetonová základová deska a železobetonové suterénní stěny. Horní stavba je vystavěna ze systému Porotherm, který je zateplen fasádním kontaktním systémem ETICS s izolačními deskami z čedičové vlny. Stropní konstrukce jsou řešeny jako monolitické železobetonové desky, schodiště je železobetonové monolitické tříramenné. Fasáda je tvarově členitá v závislosti na navržených částečně otevřených lodžiích. Poslední podlaží ustupuje od líce budovy a vytváří prostorné terasy. Otvory jsou vyplněny dřevěnými okny. Zastřešení bytového domu je řešeno jednoplášťovou plochou střechou s klasickým pořadím vrstev a hydroizolačním souvrstvím ze dvou asfaltových pásů.
|
|
|
Autosalon se servisem
Pavlíček, Jiří ; Nespěšný, Ondřej (oponent) ; Pěnčík, Jan (vedoucí práce)
Předmětem této diplomové práce je vypracování projektové dokumentace pro provádění stavby autosalonu se servisem. Novostavba je umístěna v Brně v katastrálním území městské části Královo Pole. Jedná se o samostatně stojící nepodsklepený objekt, který je umístěn na lichoběžníkovém pozemku s rovinným terénem. Objekt je rozdělen na dvě části, a to na část autosalonu a servisu. Obě tyto části jsou spolu stavebně i provozně propojeny. Objekt autosalonu je navržen jako dvoupodlažní objekt, sloužící pro výstavu osobních automobilů a tvoří technické a hygienické zázemí, a především administrativní část obou objektů. Objekt servisu je navržen jako jednopodlažní nepodsklepený objekt, ve kterém jsou umístěny pracovní prostory servisu a potřebné sklady. Nosný konstrukční systém autosalonu tvoří železobetonové sloupy společně s keramickým zdivem, u objektu servisu to jsou železobetonové sloupy s lehkým sendvičovým panelem. Základy objektu tvoří prefabrikované kalichové patky v kombinací s železobetonovými prefabrikovanými prahy, a základová podkladní deska s pasy z prostého betonu. Zateplení objektu autosalonu je pomocí izolačních desek z čedičové vlny opláštěnou provětrávanou fasádou s profilovaným obkladem z tahokovu. Proslunění v místnosti showroomu zajišťuje prosklená sloupko-příčková fasáda v kombinaci s plastovými okny a dveřmi. Stropní konstrukce jsou řešeny pomocí předem předpjatých stropních panelů Spiroll. Nosnou konstrukci střechy u obou objektů zajišťují předem předpjaté železobetonové vazníky v kombinací s trapézovými plechy a izolací z minerální vlny a PIR desek. Zastřešení objektů tvoří plochá střecha s klasickým pořadím vrstev s hydroizolační vrstvou z měkčeného PVC.
|
|
|
Vizualizace a vzdálené řízení systémové elektroinstalace Foxtrot s rozhraním DALI
Pavlíček, Jiří ; Macháček, Jan (oponent) ; Bátora, Branislav (vedoucí práce)
Práce se zabývá systémovou elektroinstalací Foxtrot a jejím využití v oblasti osvětlení. V teoretické části je porovnání klasické a systémové elektroinstalace, také je zde uveden přehled nejpoužívanějších sběrnicových systému pro řízení budov na našem trhu. Dále se pak práce věnuje popisu částí systému Foxtrot a vývojovému prostředí mosaic. V prostředí mosaic je vytvořen program pro řízení osvětlení na rozhraní DALI. Využitím nástroje WebMaker je provedena vizualizace programu a je umožněno jeho vzdálené řízení. Výstupem praktické části je laboratorní návod.
|
|
|
Realizace zastřešení stáje pro skot ve Studenci
Pavlíček, Jiří ; Bříza, Lukáš (oponent) ; Mohapl, Martin (vedoucí práce)
Tématem bakalářské práce je zpracování stavebně technologického projektu pro zastřešení stáje pro skot ve Studenci. Práce obsahuje technickou zprávu se zaměřením na montáž střešní konstrukce, situaci stavby se širšími vztahy dopravních tras, technologicky předpis pro etapu zastřešení objektu, položkovy rozpočet s vykazem vyměr, návrh zařízení staveniště s technickou zprávou zařízení staveniště, časovy harmonogram, návrh strojní sestavy. Dále je v práci řešen kontrolní a zkušební plán, bezpečnost práce. Poslední bod práce pojednává o realizaci zastřešení objektů s větším rozponem.
|
|
|
Trofeje
Pavlíček, Jiří ; Sobotka, Jiří (oponent) ; Mikyta, Svätopluk (vedoucí práce)
18 metrů dlouhá kresba na plátně, zachycující můj vlastní šestiletý příběh života na vysoké škole i mimo ni. Do kresby prosakuje i tématika trofeje a graduje výběrem této tématiky pro moji teoretickou i praktickou diplomovou práci. Plátno je navinuto v dřevěném přístroji a pomocí klik jej lze prohlížet. Práci také doprovází instalace vlastních trofejí a přírodnin.
|
|
| |
|
|
Možnosti regulace obnovitelných zdrojů elektrické energie
Pavlíček, Jiří ; Morávek, Jan (oponent) ; Pěcha, Jiří (vedoucí práce)
Práce se zabývá možnostmi regulace obnovitelných zdrojů energie. Zaměřuje se na způsoby řízení obnovitelných zdrojů a možnosti jejich regulace. Udává podíl jednotlivých druhů obnovitelných zdrojů energie na výrobě elektrické energie a jejich zastoupení v diagramu zatížení. Dále práce popisuje jednotlivé akumulační systémy, které se dají využít pro stabilizaci nestálých obnovitelných zdrojů energie. Vyhodnocuje použitelnost uvedených akumulačních systému v energetice.
|
|
|
Structural studies of selected protein complexes involved in signal transduction
Honzejková, Karolína ; Obšil, Tomáš (vedoucí práce) ; Bouřa, Evžen (oponent) ; Pavlíček, Jiří (oponent)
Protein-proteinové interakce jsou klíčové pro většinu fyziologických i patofyziologických dějů. Detailní charakterizace těchto interakcí je proto nezbytná nejen k porozumění podstaty těchto dějů, ale i pro návrh strategií, jak tyto interakce cíleně ovlivňovat. Tato práce se zaměřuje na studium struktury a interakcí několika proteinů a jejich komplexů. ASK1 (z anglického "apoptosis signal-regulating kinase 1") je mitogeny aktivovaná proteinkinasa kinasa kinasa (MAP3K), která aktivuje dráhy proteinkinas p38/JNK, čímž směruje buňky k zánětlivé reakci nebo apoptóze. ASK1 interaguje s thioredoxinem (TRX), malou dithioloxidoreduktasou, která inhibuje ASK1, nicméně mechanismus této inhibice je nejasný. CaMKK1 a CaMKK2 jsou Ca2+ /kalmodulin (CaM)- dependentní proteinkinasy, které regulují např. energetickou rovnováhu buňky, paměť či zánět. Obě jsou inhibovány proteiny 14-3-3, ale navzdory svým doménovým a sekvenčním podobnostem je rozsah inhibice zprostředkovaný proteiny 14-3-3 odlišný. Estrogenový receptor alfa (ERα) je jaderný receptor, který se podílí na vzniku rakoviny prsu. Pro léčbu tohoto onemocnění se používá tamoxifen, antagonista ERα, který však často způsobuje vznik rezistence. Proteiny 14-3-3 interagují s ERα a inhibují jeho transkripční aktivitu, povaha této interakce je však stále nejasná....
|
host ::
RSS.