|
|
Delineating pain and fear engrams in the prefrontal cortex
Ludínová, Kristýna ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Herink, Josef (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Kristýna Ludínová Školitel: PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Externí školitelé: Dr. Manfred Oswald, Prof. Dr. Rohini Kuner Název diplomové práce: Vymezení bolesti a paměťových stop strachu v prefrontální kůře Bolest je komplexní proces zahrnující aktivaci různých mozkových center. Dle dostupných výsledků ze zobrazovacích metod na lidech a hlodavcích, mediální prefrontální kůra , patří mezi oblast, která je konstitutivně aktivovaná během bolesti. Mediální prefrontální kůra zpracovává funkčně rozdílné procesy jako bolest, emoce, rozhodování, pozornost, avšak její přesná role a souvislost ve vnímání bolesti a jiných procesech není známa. Naším cílem bylo vymezení, jak se strach (emoce) a bolest manifestují na buněčné úrovni. S použitím značení závislého na aktivitě jsme testovali, zda jsou soubory buněk v mediální prefrontální kůře aktivované bolestí odlišné od souborů buněk aktivovaných strachem. Zkoumali jsme potenciální využití DREADDs (konstruované receptory výhradně aktivované konstruovaným aktivátorem) pro testovaní funkční role prefrontální kůry v bolesti a ve strachu. Naše výsledky umožňují orientačně nahlédnout na to, jak je prefrontální kůra aktivovaná v bolesti a ve strachu a...
|
|
|
Molekulárně modelovací studie potenciálních inhibitorů mykobakteriální enoyl-reduktasy
Slovák, František ; Holas, Ondřej (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Pracoviště: Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Diplomant: František Slovák Vedoucí práce: PharmDr. Ondřej Holas, Ph.D. Název diplomové práce: Molekulárně modelovací studie potenciálních inhibitorů mykobakteriální enoyl-reduktasy. Tuberkulóza je celosvětově rozšířené infekční onemocnění. Největším problémem dnešní doby jsou multi a kompletně rezistentní kmeny Mycobacterium tuberculosis, které nereagují na žádná dosud známá léčiva. Hlavním důvodem vysoké odolnosti a lékové rezistence bacila je složení jeho buněčné stěny. Ta obsahuje vysoký podíl mykolových kyselin. Syntéza mykolových kyselin probíhá v několika krocích. Finálním krokem je katalytická redukce enzymem enoyl ACP-reduktázou (InhA). Tato práce byla zaměřena na hledání nových potenciálních látek, které by byly schopné tento enzym inhibovat. K hledání těchto látek bylo použito metod výpočetní technologie a molekulového modelování. Úprava krystalografických struktur proběhla v programu Maestro a dockování v programu MOE. Pomocí molekulového dockingu bylo na 3 krystalografických strukturách enzymu InhA otestováno přes 30 000 molekul z databáze ZND (Zink natural derivates). Z tohoto počtu bylo vybráno 8 molekul, jejichž výsledky po provedení dockingu nasvědčovaly...
|
|
|
Alkylaminoderiváty pyrazinamidu jako potenciální antituberkulotika
Mlčoch, Michal ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Musílek, Kamil (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Řešitel: Mgr. Michal Mlčoch Školitel: Mgr. Jan Zitko, Ph.D. Název rigorózní práce: Alkylaminoderiváty pyrazinamidu jako potenciální antituberkulotika Tato práce je výsledkem snahy připravit potenciální účinné struktury odvozené od pyrazinamidu (PZA). Její výsledky přispívají k obohacení výzkumu nových antituberkulotik (antiTBC), který již řadu let probíhá na katedře Farmacetutické chemie a kontroly léčiv Farmaceutické fakulty v Hradci Králové. Výzkumný záměr připravit nová účinná antiTBC je podpořen současnou situací tuberkulózy ve světě, jež je zde podrobně popsána. Přestože počet případů této nebezpečné infekční nemoci ve všech regionech WHO mírně klesá, pořád není šíření nemoci v některých oblastech zcela pod kontrolou. Důvodem je zejména vznik rezistence nových mykobakteriálních kmenů, jež jsou původci závažných, mnohdy těžko léčitelných případů. Připravené látky vycházejí ze struktury molekuly PZA, jež má uplatnění jako jedno z nejdůležitějších dostupných antiTBC první linie. V posledních letech proběhla u této molekuly revize mechanismu účinku. Všechny nové dostupné informace byly proto v této práci uvedeny. Dále jsou zde předloženy některé nové systémy pro transport...
|
|
| |
|
|
Deriváty pyrazinkarboxylové kyseliny jako potenciální antituberkulotika (příprava a studium biologických vlastností)
Zitko, Jan ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Vinšová, Jarmila (oponent) ; Csöllei, Jozef (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Kandidát: Mgr. Jan Zitko Školitel: Prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. Název disertační práce:Deriváty pyrazinkarboxylové kyseliny jako potencionální antituberkulotika (příprava a studium biologických vlastností) Tato práce se zabývá deriváty kyseliny pyrazin-2-karboxylové (POA) s potencionálním antimykobakteriálním účinkem. V teoretické části práce je kromě stručného popisu tuberkulózy (TBC) jako nemoci popsána epidemiologická situace TBC v celosvětovém měřítku a přidružené rizikové faktory této nemoci v podobě rostoucí rezistence k antituberkulotikům první linie a koinfekce s virem HIV. Dále jsou popsána v současnosti klinicky používaná antituberkulotika a podán přehled nových antituberkulotik v klinické fázi testování. Zvláštní pozornost je věnována pyrazinamidu (PZA), který se uplatňuje jako jedno z nejdůležitějších antituberkulotik první linie. Práce rovněž popisuje současné teorie mechanismu účinku PZA (POA). Důležitou částí této práce je přehled strukturních obměn PZA/POA prováděných v minulosti ve snaze o přípravu nových látek s antimykobakteriálním účinkem a zhodnocení prospěšnosti a významu těchto obměn. V rámci praktické části této práce bylo připraveno celkem 76...
|
|
|
Deriváty pyrazinamidu jako potenciální antimikrobní látky
Čečetková, Martina ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Kučerová, Marta (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Pracoviště: Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Diplomant: Martina Čečetková Vedoucí práce: PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Název diplomové práce: Deriváty pyrazinamidu jako potenciální antimikrobní látky Dokonce i ve 21. století představuje tuberkulóza stále vážné globální ohrožení. Patří mezi jednu z deseti nejčastějších příčin úmrtí. Nejvíce zatěžuje rozvojové země, ale celosvětově je touto nemocí nakažena až 1/3 obyvatelstva. Díky neefektivní terapii tuberkulózy v rozvojových zemích narůstá prevalence tuberkulózy, která již nereaguje na zavedenou léčbu. Je potřeba vyvíjet nová léčiva, která budou účinná proti multirezistentní tuberkulóze a tak zabrání dalšímu šíření nemoci. Předlohou pro sérii sloučenin připravených v rámci této diplomové práce je 6- chlor-N-(4-(4-fluorfenyl)thiazol-2-yl)pyrazin-2-karboxamid, jehož struktura vychází z antituberkulotika 1. linie pyrazinamidu a fragmentu 4-arylthiazol-2-aminu, u kterého byla dříve popsána antimykobakteriální aktivita. Předlohová sloučenina vykazuje vysokou účinnost proti M. tuberculosis popsanou MIC = 0,78 µg/mL a nízkou cytotoxicitu. Cílem této práce bylo zjistit vliv substituce chloru v poloze 6 pyrazinového kruhu za alkylaminový zbytek. Jako potenciální cíl těchto sloučenin...
|
|
|
Syntéza a in vitro testování takrin-troloxových derivátů jako potenciálních inhibitorů acetylcholinesterasy
Ondřejíček, Aleš ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Student: Aleš Ondřejíček Školitel: prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. Školitel specialista: PharmDr. Jan Korábečný, Ph.D. Název práce: Syntéza a in vitro testování takrin - troloxových derivátů jako potenciálních inhibitorů acetylcholinesterasy Alzheimerova choroba (AD) je komplexní neurodegenerativní onemocnění, které se projevuje postupnou ztrátou krátkodobé epizodické paměti a poruchami kognitivních funkcí. Charakteristickými histopatologickými znaky AD jsou přítomnost neuritických plaků a neurofibrilárních klubek v mozkové tkáni a porucha cholinergní neurotransmise. V současné době se v terapii AD používají pouze dvě skupiny léčiv. První skupinu tvoří inhibitory acetylcholinesterasy (AChEI) a do druhé se řadí memantin, antagonista NMDA receptorů. Cílem diplomové práce bylo připravit tři série takrin - troloxových derivátů. Konkrétně se jednalo o deriváty troloxu s takrinem, 7-methoxytakrinem a 6-chlortakrinem, které byly spojeny různě dlouhými spojovacími řetězci. K porovnání účinnosti nově připravených sloučenin byla použita Ellmanova metoda s takrinem, 7-methoxytakrinem a 6-chlortakrinem jako standardních látek. Antioxidační aktivita nových derivátů byla stanovena za použití DPPH...
|
|
|
Compounds combining pyrazinamide and 4-aminobenzoic acid fragments as potential antituberculars
Žecová, Jana ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chémie a farmaceutické analýzy Riešiteľ: Jana Žecová Vedúci diplomovej práce: PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Názov diplomovej práce: Zlúčeniny kombinujúce fragment pyrazínamidu a 4-aminobenzoovej kyseliny ako potencionálne antituberkulotiká Tuberkulóza je závažné infekčné ochorenie, ktoré po storočia sužuje ľudskú svetovú populáciu. Jej stále zastúpenie v rebríčku najsmrteľnejších ochorení, rovnako tak ako výskyt foriem rezistentných na terapiu, naďalej vyžaduje seriózny prístup k tejto problematike a nájdení nových terapeutických možností. V škále liečiv súčasné terapie TBC sa vyskytujú dve látky, PZA a PAS. Pyrazínamid je liečivo 1. línie, jeho derivátmi sa roky zaoberá výskum na Katedre farmaceutickej chémie a farmaceutickej analýzy. Štruktúrne podobná 4-aminobenzoovej kyseline, PAS je antituberkulotikom 2. línie, ktoré sa po rokoch znovu stáva aktuálnym v liečbe rezistentných foriem M. tbc. Táto diplomová práca sa zaoberá možnosťami využitia zlúčenín zložených z fragmentu PZA a 4-aminobenzoovej kyseliny ako potencionálnych antituberkulotík. Práca naďalej zhodnocuje vplyv fragmentu PAS v derivátoch pripravovaných s antimykobakteriálnym účelom. Teoretická časť práce popisuje súčasný svetový stav tuberkulózy, jej...
|
|
|
Podmínky pro konvergenci restartované a rozšířené metody GMRES
Nádhera, David ; Zítko, Jan (vedoucí práce) ; Strakoš, Zdeněk (oponent)
The GMRES method is one of the most useful methods for solving a system of linear algebraic equations with nonsymmetric matrix. So on, many bounds for the residual norm have been derived, that can give us information about the convergence or possible stagnation of the method. A generalization of the GMRES method is the augmented GMRES method. In this paper we will analyze the implementation of augmented GMRES method proposed by Morgan. In these consequences we will be interested in how precise harmonic Ritz vectors approximate the eigenvectors belonging to the smallest in magnitude eigenvalues. We generalize some previous results concerning the convergence of restarted GMRES method for the case of augmented GMRES method. This is the rst contribution of the work. Another main point will be numerical testing and comparing of the bounds for restarted and augmented GMRES and an attempt to state a criterion, when it is suitable to stop the improvement of augmenting vectors, i. e. apply the augmented GMRES method without additional computations.
|
|
|
Transformace Sylvestrovy matice a výpočet největšího společného dělitele dvou polynomů
Eckstein, Jiří ; Zítko, Jan (vedoucí práce) ; Tůma, Miroslav (oponent)
V této diplomové práci se zabýváme výpočtem největšího společného dělitele dvou polynomů. V první řadě studujeme vlastnosti Sylvestrových matic a jakým způsobem je lze využít pro daný záměr. Dále si všimneme, že výsledky lze přirozeně zobecnit i pro více polynomů. V předposlední části se zabýváme využitím Bézoutových matic ke stejnému účelu, abychom získali srovnání s maticemi Sylvestrovými. I zde výsledek rozšíříme pro víc než dva polynomy. Ke všem přístupům jsou prezentovány algoritmy. Na závěr algoritmy implementujeme v prostředí MATLAB a jednotlivé algoritmy porovnáme v numerických experimentech. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
host ::
RSS.