|
|
Identification of hereditary factors influencing the formation of a pancreatic carcinoma and other solid tumours
Král, Jan ; Janatová, Markéta (advisor) ; Hojný, Jan (referee) ; Šeborová, Karolína (referee)
Pancreatic adenocarcinoma (PDAC) has one of the worst prognoses out of all cancers worldwide. Endometrial carcinoma (EC) is the most common gynecological cancer. Genetic background of tumors is highly heterogenous and differs among populations. We have analyzed DNA of 226 PDAC patients and 527 EC patients using panel next- generation sequencing. Targeted genes were divided into main predisposition genes (11 for PDAC, 19 for EC) and other candidate genes. EC patients were categorized based on meeting the indication criteria for germline genetic testing. Two sets of population-matched controls were used (controls with negative cancer history, and general population controls). Germline pathogenic variants (PV) in main predisposition genes were identified in 18 (8.0%) PDAC patients. The most mutated gene was BRCA2 (50% of carriers). PDAC risk was significantly elevated in carriers of PV in BRCA1 (OR = 10.4, p = 0.04), BRCA2 (OR = 6.4, p = 0.0009), and CHEK2 (OR = 17.5, p = 0.003). Germline mutations in genes participating in homologous recombination processes were associated with improved overall survival of patients. Among EC patients there were 60 (11.4%) carriers of PV in main predisposition genes. Carriers of PV in Lynch syndrome (LS) genes had markedly elevated risk of developing EC (OR = 22.4, p...
|
|
|
Digital Predistorters with Low-Complexity Adaptation
Král, Jan ; Springer, Andreas (referee) ; Roblin, Patrick (referee) ; Götthans, Tomáš (advisor)
Moderní komunikační systémy často vyžadují digitální předzkreslovače (DPD), jednotky pokročilého zpracování signálu, ke splnění požadavků na linearitu a účinnost vysílačů. Nicméně DPD výrazně zvyšují hardwarovou a výpočetní složitost vysílačů, což vede ke zvýšení spotřeby a nákladů. Z toho důvodu představujeme metody k dosažení nižší hardwarové a výpočetní složitosti adaptace DPD. Metoda zpětnovazebních vzorků s reálnou hodnotou vyžaduje pouze jeden ze dvou původně potřebných zpětnovazebních analogově-digitálních převodníků (ADC), což vede ke snížení složitosti vysílače a spotřeby energie. Hardwarovou a výpočetní složitost lze více snížit, pokud je zpětnovazební signál pro adaptaci DPD podvzorkován a jsou vybrány pouze vhodné vzorky. Navrhované techniky vybírají vzorky dle histogramu a mohou snížit potřebný počet vzorků zpětné vazby na několik desítek. Provedené analýzy ukazují přibližně 400násobné snížení výpočetní náročnosti dosažené výběrem vzorků a 40násobné snížení spotřeby energie díky podvzorkování zpětné vazby DPD. Metody zpětné vazby s reálnými hodnotami, její podvzorkování a výběr vzorků tvoří základ navrhované adaptace DPD využívající ADC s detekcí jedné úrovně, který je realizován jednoduchým komparátorem. Nahrazení běžných zpětnovazebních ADC jednoduchým komparátorem výrazně snižuje složitost návrhu a spotřebu energie. Všechny navržené a popsané techniky jsou doprovozeny simulacemi, obvykle i měřením na reálném hardwaru a porovnány s dostupnými metodami. Závěrečný rozbor řeší použitelnost a omezení jednotlivých metod. Ukazuje se, že snížení složitosti nemusí být univerzálně dosažitelné a je třeba pečlivě posoudit všechna specifika daného návrhu.
|
|
|
Implementation of offensive standard situations in football at various performance levels
Král, Jan ; Pokorný, Ladislav (advisor) ; Krejča, Filip (referee)
The diploma thesis focuses on the implementation of offensive standard situations in football. Specifically in the competitions: division group B, third league group A and the highest competition, ie the first league. The analysis of the work is based on watching football matches from the record. The diploma thesis consists of two main sections, namely the theoretical and research section. The theoretical section is focused on theoretical concepts such as game systems, game combinations, game activities and standard situations. The research section contains the following research situations: how teams most often play offensive standard situations, from which place most offensive standard situations take place, which player most often plays offensive standard situations, from which area players most often end offensive standard situations, which player most often ends offensive standard situations, ending offensive standard situations on goal or out of goal in selected Czech football competitions, which I mentioned above. The information from the diploma thesis can be a support for coaches in the analysis of offensive standard situations of individual teams, and coaches will then be able to appropriately choose tactics in defending offensive standard situations. Keywords football, standard...
|
|
| |
|
| |
|
|
Groundwater aggression and the impact of geological environment
Štěpán, Jiří ; Král, Jan (advisor) ; Malát, Richard (referee)
This bachelor thesis deals with groundwater aggressiveness on two sheets of detailed engineering geology maps of Prague 1:5000. The aim of this thesis is an effort to verify how much geological environment of inner Prague participates in chemical composition of groundwater. The chemical analysis were evaluated using limit values stated in valid norm ČSN EN 206 Concrete - Specification, performance, production and conformity. The chemical analysis that analyzed aggressive components (SO4 2- , CO2 a pH) and total dissolved solids discovered that the geological environment affect the chemical composition of groundwater very strongly. Groundwater in Ordovician shale commonly contains high amount of dissolved solids with a lot of sulphate. In geological environment containing quartzite, greywacke, quartz and greywacke sandstone the groundwater has small amount of dissolved solids and no aggressive component is dominant as well as too high compared to the shale.
|
|
| |
|
|
Engineering geology conditions of a motorway bridge over Vltava river in Prague
Polák, Zdeněk ; Král, Jan (advisor) ; Havelka, Jaroslav (referee)
Tato diplomová práce se zabývá zhodnocením inženýrskogeologických poměrů mostu na stavbě č. 519 silničního okruhu kolem Prahy včetně vyšetření stability skalních svahů v místě předpokládané výstavby. Jedná se o přemostění hlubokého erozního údolí Vltavy, na jehož svazích vystupují na povrch horniny svrchnoproterozoického stáří. Na lokalitě byly zhodnoceny pomocí rešerše archivních podkladů, vlastní rekognoskace a laboratorních zkoušek, geologické, hydrogeologické a inženýrskogeologické poměry, které jsou přehledně uvedeny v inženýrskogeologické mapě v měřítku 1:2000 a řezu 1:500. Jako podklad pro vyhodnocení stability skalních svahů sloužila podrobná dokumentace skalních výchozů. Samotné vyšetření stability proběhlo pomocí klasifikace Slope Mass Ratting a Marklandova testu pro stereografickou projekci. Na výstupech práce je souhrnně popsán horninový masiv včetně mapy stability skalních svahů v měřítku 1:500 a popsány základové poměry uvažovaného mostu.
|
|
|
Diagnostic and prognostic impact of miR-122 and miR-142 in colorectal cancer
Kalkušová, Kateřina ; Červená, Klára (advisor) ; Král, Jan (referee)
Colorectal carcinoma is one of the most frequent cancers and it is also one of the most common causes of cancer related death. It is often diagnosed at a late stage which is associated with a worse prognosis. Therefore, there is an effort to identify new biomarkers that allow earlier diagnosis. These biomarkers could predict prognosis of disease and patient's response to treatment. Short noncoding RNAs - microRNA - appears to be promising candidates, these molecules are involved in many cellular processes through RNA interference. The aim of this thesis is to summarize knowledge about application of miR-122 and miR-142 as diagnostic and prognostic biomarkers for colorectal cancer. Keywords: microRNA, biomarkers, colorectal cancer, diagnostics, prognosis
|
|
|
Possible approaches to the treatment of cystic fibrosis
Král, Jan ; Bořek Dohalská, Lucie (advisor) ; Nosková, Libuše (referee)
Cystic fibrosis is a genetic disease caused by a mutation in the CFTR gene. This leads to an absence or a malfunction of CFTR chloride channel, which is also a crutial regulator of other ion channels. This thesis was aimed at gene therapy of cystic fibrosis using CFTR- mRNA gene transfer. To determine the expression of CFTR protein, methods of indirect immunofluorescence and Western blot immunodetection were utilized. Also relative gene expression levels of CFTR gene were assessed by quantitative PCR. Experiments were carried out on a healthy lung epithelial cell line (NuLi-1), a lung epithelial cell line with F508del mutation (CuFi-1) and an embryonic kidney epithelial cell line (HEK293S). CFTR protein was visualized by previously mentioned methods using six primary antiobodies (432, 450, 570, 596, 769, CF3). Primary antibodies 570 a CF3 were found as optimal for the detection of CFTR protein by the method of indirect immunofluorescence, whereas for the detection of this protein by the method of Western blot only the CF3 antibody was suitable. It was also determined that CFTR gene is expressed in overall small levels. Its relative gene expression in the CuFi-1 cell line was approximately six times higher than in the NuLi-1 cell line. The efficiency of transfection of CuFi-1 cell line by CFTR-mRNA...
|
guest ::
RSS feed.