|
Analýza změn fenotypu nádorových buněk navozených migrastatiky v kvantitativním fázovém zobrazení
Kolínková, Veronika ; Netíková,, Irena Štenglová (oponent) ; Veselý, Pavel (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zaměřuje na pozorování živých buněk pomocí neinvazivní metody kvantitativního fázového zobrazování (hiQPI). Takové zobrazení je umožněno pomocí koherencí řízeného holografického mikroskopu (CCHM) vyvinutého v laboratoři experimentální biofotoniky na VUT. Pomocí této zobrazovací technologie jsou v rámci experimentální části práce vyhodnoceny morfologické změny nádorových buněk A549 a MCF7 po aplikaci potenciálních migrastatik. Jako migrastatika jsou označována již schválená léčiva, která by mohla zamezit migraci nádorových buněk z primárního nádoru a tím předejít vzniku metastáz. Pro posouzení jejich účinku na nádorové buňky byla zvolena metoda RAC-GM (Rychlé vyšetření růstu a migrace buněk in vitro).
|
|
Postupy pro dosažení vyšší povrchové jakosti ocelových odlitků
Tomková, Jana ; Veselý, Pavel (oponent) ; Záděra, Antonín (vedoucí práce)
Předmětem této diplomové práce je ověřit účinky hliníkového prášku v základním žáruvzdorném nátěru určeného pro odlévání ocelových odlitků do organicky pojených forem. Přítomnost hliníkového prášku v základním nátěru byla posuzována jednak z hle-diska nátěru jako takového, tj. odolnost proti tepelnému šoku, penetrace apod., jednak z hlediska vlivu na tvorbu povrchových vad. Výstupem práce jsou: stanovení optimálního obsahu hliníkového prášku v základním nátěru a statisticky podložená analýza o účincích modifikovaného nátěru z hlediska tvorby vad.
|
|
Efficient representation of k-mer sets
Milyutina, Ekaterina ; Veselý, Pavel (vedoucí práce) ; Kolman, Petr (oponent)
In this thesis we explore and compare various methods for efficient k-mer set representation. We evaluate traditional de Bruijn graph representation techniques against greedy approximation algorithms for the Shortest Superstring Problem. We describe the linear- time implementation of the well-known Greedy algorithm by Ukkonen [1990] and extend it to another related algorithm, called TGreedy. In addition, we test selected algorithms on a bacterial genome and pangenome to highlight the differences in the size of their output representation and the computational resources used, providing an insight into their respective efficiencies.
|
|
Znalosti žáků vybrané střední odborné školy z oblasti první pomoci
Veselý, Pavel
Cílem bakalářské práce je získat informace o teoretických znalostech žáků Střední odborné školy a Středního odborného učiliště André Citroëna v Boskovicích z oblasti první pomoci v souvislosti s výukou předmětu Řízení motorových vozidel. Ba-kalářská práce se skládá z teoretické a praktické části. Teoretická část je zpracována na základě odborné literatury s použitím metod kompilace, deskripce, analýzy a synté-zy. Praktická část se zabývá průzkumem provedeným na Střední odborné škole a Středním odborném učiliště André Citroëna v Boskovicích. Metodou průzkumu je di-daktický test, který je určen žákům 3. ročníku. V závěru bakalářské práce je provedeno zhodnocení znalostí žáků v oblasti první pomoci a navrhnuto doporučení pro pedago-gickou praxi.
|
| |
|
Studium vlivu migrastatik na dynamiku migrace nádorových buněk pomocí koherencí řízeného holografického mikroskopu
Muchová, Nikola ; Netíková,, Irena Štenglová (oponent) ; Veselý, Pavel (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá propojením koherencí řízeného holografického mikroskopu s výzkumem vlivu migrastatik na dynamiku migrace rakovinných buněk. Teoretická část stručně popisuje historii holografické mikroskopie a vývoj holografického mikroskopu na FSI VUT v Brně ve spolupráci s firmou Telight. Zahrnuje náhled do konstrukce a principu funkce koherencí řízeného holografického mikroskopu. Následně se zabývá stručným popisem současné onkologické léčby a představením kandidátů na nová léčiva označená jako migrastatika. Stěžejní částí je navržení experimentálního postupu pozorování, zaznamenání a zpracování obrazových dat pomocí techniky hiQPI. V poslední části diplomové práce je následná analýza vlivu vybraných léčiv na rakovinné buňky a porovnání získaných výsledků s již existujícími studiemi. Pro zahájení protokolu „Rychlé vyšetření růstu a migrace buňky in vitro“ byla porovnána vhodnost objektivů se zvětšením 4x a 10x.
|
|
Identifikace změn chování nádorových buněk v nízkých koncentracích migrastatik koherencí řízeným holografickým mikroskopem
Zábranská, Magdaléna ; Netíková,, Irena Štenglová (oponent) ; Veselý, Pavel (vedoucí práce)
Předmětem diplomové práce bylo použití koherencí řízeného holografického mikroskopu ve výzkumu vlivu migrastatik v různých koncentracích na nádorové buňky a interpretace dat kvantitativního fázového zobrazení. Teoretický úvod je rozdělen na dvě části. První část je věnována CCHM, kde je stručně popsána historie holografické mikroskopie, princip a detailní popis hlavních částí mikroskopu. Druhou částí je úvod do problematiky nádorové léčby a představení migrastatických léčiv. Experimentální částí práce je analýza vlivu migrastatik na dvě nádorové linie (H1299 a HT1080) z naměřených časosběrných záznamů pořízených holografickým mikroskopem. Vliv léčiv byl vyhodnocen pomocí charakteristik popisující morfologické a dynamické změny buněk v softwaru SophiQ. Data byla následně graficky a statisticky zpracována s cílem srovnání a vyhodnocení účinku migrastatik v nízkých koncentracích. V závěru práce byly shrnuty získané poznatky a navrhnuty vybrané charakteristiky k analýze vlivu migrastatik.
|
|
Analýza změn fenotypu nádorových buněk navozených migrastatiky v kvantitativním fázovém zobrazení
Kolínková, Veronika ; Netíková,, Irena Štenglová (oponent) ; Veselý, Pavel (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zaměřuje na pozorování živých buněk pomocí neinvazivní metody kvantitativního fázového zobrazování (hiQPI). Takové zobrazení je umožněno pomocí koherencí řízeného holografického mikroskopu (CCHM) vyvinutého v laboratoři experimentální biofotoniky na VUT. Pomocí této zobrazovací technologie jsou v rámci experimentální části práce vyhodnoceny morfologické změny nádorových buněk A549 a MCF7 po aplikaci potenciálních migrastatik. Jako migrastatika jsou označována již schválená léčiva, která by mohla zamezit migraci nádorových buněk z primárního nádoru a tím předejít vzniku metastáz. Pro posouzení jejich účinku na nádorové buňky byla zvolena metoda RAC-GM (Rychlé vyšetření růstu a migrace buněk in vitro).
|
|
Molekulární podstata etiologie toxického působení fluoropyrimidinů se zaměřením na palmární-plantární erytrhodysesthesii a použití potenciálních antidot
Hartinger, Jan ; Veselý, Pavel (vedoucí práce) ; Květina, Jaroslav (oponent) ; Brábek, Jan (oponent)
(teze): Palmární-plantární erythrodysesthesie (PPE) je nežádoucí účinek doprovázející antineoplastickou terapii při podávání 5-fluorouracilu formou kontinuální infuse, případně při dlouhodobé terapii kapecitabinem (proléčivo 5-FU). V nejzávažnějších případech PPE znemožňuje další pokračování v potřebné terapii. V léčbě a prevenci tohoto nežádoucího účinku je používána lokální aplikace uridinu ve formě 10 % masti, nicméně tento postup nebyl dosud ověřen randomizovanými studiemi a není všeobecně přijímán. PPE je způsobena s největší pravděpodobností přímým vlivem cytostatika na kůži dlaní a plosek nohou. Toxicita 5-FU je zprostředkována především jeho inkorporací do RNA a inhibicí thymidylát synthasy (TS), která vyústí v poruchu synthesy DNA. U odlišných typů buněk mají tyto mechanismy pro rozvoj toxicity 5-FU různý význam. Při hledání specifického antidota v terapii PPE je proto nezbytné zjistit jaký molekulární mechanismus toxicity 5-FU se uplatňuje u keratinocytů. Jako nejvhodnější látky pro použití v lokální terapii PPE jsme vybrali pyrimidinové nukleosidy, především uridin, který je ve formě 10 % uridinové masti v této indikaci využíván v několika onkologických centrech ve Střední Evropě. Jako prostředek pro zjištění mechanismu působení 5-FU jsme dále testovali účinek kalciumfolinátu (CF), který...
|
| |