|
|
Molekulárně modelovací studie potenciálních inhibitorů mykobakteriální enoyl-reduktasy
Slovák, František ; Holas, Ondřej (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Pracoviště: Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Diplomant: František Slovák Vedoucí práce: PharmDr. Ondřej Holas, Ph.D. Název diplomové práce: Molekulárně modelovací studie potenciálních inhibitorů mykobakteriální enoyl-reduktasy. Tuberkulóza je celosvětově rozšířené infekční onemocnění. Největším problémem dnešní doby jsou multi a kompletně rezistentní kmeny Mycobacterium tuberculosis, které nereagují na žádná dosud známá léčiva. Hlavním důvodem vysoké odolnosti a lékové rezistence bacila je složení jeho buněčné stěny. Ta obsahuje vysoký podíl mykolových kyselin. Syntéza mykolových kyselin probíhá v několika krocích. Finálním krokem je katalytická redukce enzymem enoyl ACP-reduktázou (InhA). Tato práce byla zaměřena na hledání nových potenciálních látek, které by byly schopné tento enzym inhibovat. K hledání těchto látek bylo použito metod výpočetní technologie a molekulového modelování. Úprava krystalografických struktur proběhla v programu Maestro a dockování v programu MOE. Pomocí molekulového dockingu bylo na 3 krystalografických strukturách enzymu InhA otestováno přes 30 000 molekul z databáze ZND (Zink natural derivates). Z tohoto počtu bylo vybráno 8 molekul, jejichž výsledky po provedení dockingu nasvědčovaly...
|
|
|
Syntéza arylsulfanyl ftalocyaninů a jejich aza-analogů
Málková, Anna ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
7 2. ABSTRAKT Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Kandidát: Anna Málková Školitel: doc. PharmDr. Petr Zimčík, Ph.D. Téma práce: Syntéza arylsulfanyl ftalocyaninů a jejich aza-analogů. Ftalocyaniny (Pc) a jejich aza-analogy (AzaPc) jsou sloučeniny využívající se v rámci fotodynamické terapie. Jsou charakterizovány rozličnými fotofyzikálními vlastnostmi, které se různí v závislosti na charakteru periferních substituentů. Například součet kvantových výtěžků singletového kyslíku a fluorescence dosahuje běžně hodnot okolo 1 u komplexů s centrálními kationty kovů (např. Mg2+ , Zn2+ ), zatímco bezkovové deriváty se v těchto výsledcích liší, jejich hodnoty jsou nižší. Předpokládáme, že toto chování by mohlo souviset s velikostí periferních substituentů. Cílem této práce byla syntéza různých komplexů ftalocyaninů a jeho aza-analogů substituovaných objemným 2,6-difenylfenylsulfanylovým substituentem jako látek určených pro studium fotofyzikálních vlastností. Syntéza začínala komerčně dostupným 2,6-difenylfenolem, který byl pomocí dimethylkarbamoylchloridu převeden na příslušný O-karbamothioát. Použitím Newman- Kwartova přesmyku za vysokých teplot se podařilo získat isomerní S-karbamothioát, a ten zredukovat pomocí LiAlH4 na...
|
|
|
Transformace Sylvestrovy matice a výpočet největšího společného dělitele dvou polynomů
Eckstein, Jiří ; Zítko, Jan (vedoucí práce) ; Tůma, Miroslav (oponent)
V této diplomové práci se zabýváme výpočtem největšího společného dělitele dvou polynomů. V první řadě studujeme vlastnosti Sylvestrových matic a jakým způsobem je lze využít pro daný záměr. Dále si všimneme, že výsledky lze přirozeně zobecnit i pro více polynomů. V předposlední části se zabýváme využitím Bézoutových matic ke stejnému účelu, abychom získali srovnání s maticemi Sylvestrovými. I zde výsledek rozšíříme pro víc než dva polynomy. Ke všem přístupům jsou prezentovány algoritmy. Na závěr algoritmy implementujeme v prostředí MATLAB a jednotlivé algoritmy porovnáme v numerických experimentech. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
|
Deriváty pyrazinu jako potenciální léčiva IV
Janoutová, Alena ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Kučerová, Marta (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Řešitel: Alena Janoutová Vedoucí diplomové práce: PharmDr. Jan Zitko, PhD. Název diplomové práce: Deriváty pyrazinu jako potenciální antituberkulotika IV Výzkum léčiv, potenciálně účinných proti tuberkulóze, probíhá na katedře Farmaceutické chemie a kontroly léčiv Farmaceutické fakulty v Hradci Králové již několik let. V této práci jsem se zaměřila na nové deriváty pyrazimanidu syntetizované jako potenciální antituberkuloticky účinná léčiva. Samotný pyrazinamid je antituberkulotikem 1. linie a je součástí všech léčebných programů. Předlohou pro konečné sloučeniny byl již dříve připravený 5-alkylamino-N-fenylpyrazin-2-karboxamid, který vykázal slibnou in vitro antibakteriální aktivitu s hodnotami MIC v rozmezí od 0,78 do 3,13 µg/ml. Cílem mé práce bylo ověřit účinnost derivátů s modifikovaným postranním řetězcem, které obsahují fenylalkylamino-, hydroxyalkylamino- či methoxyalkylaminový substituent. Konečné sloučeniny byly připraveny nukleofilní substitucí chloridu příslušnými aminy v prostředí ethanolu. Po všech čistících krocích se výtěžky reakcí pohybovaly v rozmezí 43-87 %. Všechny látky byly charakterizovány pomocí 1 H, 13 C NMR, IČ spekter, elementární analýzou a teplotou tání....
|
|
|
Pharmacological characterization of the MAS-Related G Protein-Coupled Receptor D
Navrátilová, Michaela ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Trejtnar, František (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Kandidát: Michaela Navrátilová Školitel: Dr. Kristina Hoffmann PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Název diplomové práce: Farmakologická charakterizace MRGPRD MRGPRD (Mas-příbuzný receptor spřažený s G proteinem) patří do velké skupiny GPCR (Receptory spřažené s G proteinem). Signální dráhy zprostředkované GPCRs regulují velký počet životních funkcí lidského těla a zhruba 30 % všech moderních klinicky používaných léčiv cílí právě na tyto receptory (Overington et al., 2006). MRGPR podskupina byla objevena před deseti lety, je stále do velké míry neprobádána a označena za "sirotčí". (Solinski et al., 2014). Několik ligandů jako β-alanin, GABA, β-aminobutyrová kyselina (Shinohara et al., 2004; Ajit et al., 2010; Uno et al., 2012), angiotensin a almandin (Gembardt et al., 2008; Lautner et al., 2013) mají schopnost se vázat na lidský MRGPRD. MRGPRD je specificky exprimován pouze v neuronech primárních senzorických trojklaných ganglií. Aktivace tohoto receptoru β-alaninem způsobila snížení pruritogenní citlivosti a přispěla k normalizaci prahu pro vnímání mechanických a tepelných stimulů. Fakt že se MRGPRD nacházejí v rámci centrálního systému pouze v periferních gangliích spolu s faktem, že jejich vazebné místo je...
|
|
|
Syntéza a in vitro testování takrin-troloxových derivátů jako potenciálních inhibitorů acetylcholinesterasy
Ondřejíček, Aleš ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Student: Aleš Ondřejíček Školitel: prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. Školitel specialista: PharmDr. Jan Korábečný, Ph.D. Název práce: Syntéza a in vitro testování takrin - troloxových derivátů jako potenciálních inhibitorů acetylcholinesterasy Alzheimerova choroba (AD) je komplexní neurodegenerativní onemocnění, které se projevuje postupnou ztrátou krátkodobé epizodické paměti a poruchami kognitivních funkcí. Charakteristickými histopatologickými znaky AD jsou přítomnost neuritických plaků a neurofibrilárních klubek v mozkové tkáni a porucha cholinergní neurotransmise. V současné době se v terapii AD používají pouze dvě skupiny léčiv. První skupinu tvoří inhibitory acetylcholinesterasy (AChEI) a do druhé se řadí memantin, antagonista NMDA receptorů. Cílem diplomové práce bylo připravit tři série takrin - troloxových derivátů. Konkrétně se jednalo o deriváty troloxu s takrinem, 7-methoxytakrinem a 6-chlortakrinem, které byly spojeny různě dlouhými spojovacími řetězci. K porovnání účinnosti nově připravených sloučenin byla použita Ellmanova metoda s takrinem, 7-methoxytakrinem a 6-chlortakrinem jako standardních látek. Antioxidační aktivita nových derivátů byla stanovena za použití DPPH...
|
|
|
Regularizační metody založené na metodách nejmenších čtverců
Michenková, Marie ; Hnětynková, Iveta (vedoucí práce) ; Zítko, Jan (oponent)
Název práce: Regularizační metody založené na metodách nejmenších čtverců Autor: Marie Michenková Katedra: Katedra numerické matematiky Vedoucí diplomové práce: RNDr. Iveta Hnětynková, Ph.D. Abstrakt: V této práci se zabýváme lineárními inverzními problémy Ax ≈ b, kde A je zhlazující lineární opearátor a b reprezentuje vektor pozorování zatížený neznámým šumem. V práci [Hnětynková, Plešinger, Strakoš, 2009] bylo ukázáno, že vysokofrekvenční šum se během Golubovy-Kahanovy iterační bidiagonalizace vyjevuje v levých bidiagonalizačních vektorech. V práci navrhujeme metodu, která identifikuje iteraci s maximálním vyjevením šumu a redukuje vysokofrekvenční šum odečtením příslušného (škálovaného) bidiagonalizačního vektoru od vektoru b. Tato metoda je následně testována pro různé typy šumu. Dále Hnětynková, Plešinger a Strakoš odvodili metodu k odhadování hladiny šumu v datech. V práci navrhujeme modifikaci této metody založenou na znalosti bodu maximalního vyjevení šumu. Klíčová slova: ill-posed problémy, regularizace, Golubova-Kahanova iterační bidiagonalizace, vyjevení šumu, odhad šumu, odšumování 1
|
|
|
Alkylaminoderiváty pyrazinamidu jako potenciální antituberkulotika
Mlčoch, Michal ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Musílek, Kamil (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Řešitel: Mgr. Michal Mlčoch Školitel: Mgr. Jan Zitko, Ph.D. Název rigorózní práce: Alkylaminoderiváty pyrazinamidu jako potenciální antituberkulotika Tato práce je výsledkem snahy připravit potenciální účinné struktury odvozené od pyrazinamidu (PZA). Její výsledky přispívají k obohacení výzkumu nových antituberkulotik (antiTBC), který již řadu let probíhá na katedře Farmacetutické chemie a kontroly léčiv Farmaceutické fakulty v Hradci Králové. Výzkumný záměr připravit nová účinná antiTBC je podpořen současnou situací tuberkulózy ve světě, jež je zde podrobně popsána. Přestože počet případů této nebezpečné infekční nemoci ve všech regionech WHO mírně klesá, pořád není šíření nemoci v některých oblastech zcela pod kontrolou. Důvodem je zejména vznik rezistence nových mykobakteriálních kmenů, jež jsou původci závažných, mnohdy těžko léčitelných případů. Připravené látky vycházejí ze struktury molekuly PZA, jež má uplatnění jako jedno z nejdůležitějších dostupných antiTBC první linie. V posledních letech proběhla u této molekuly revize mechanismu účinku. Všechny nové dostupné informace byly proto v této práci uvedeny. Dále jsou zde předloženy některé nové systémy pro transport...
|
|
|
Kationické tenzidy jako hydrolytické micelární katalyzátory
Janošcová, Petra ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
Souhrn Kationické tenzidy jako hydrolytické micelární katalyzátory Petra Janošcová Byla testována hydrolytická účinnost řady kationických tenzidů při rozkladu organofosforového pesticidu fenitrothionu. Všechny testované tenzidy zvyšovaly rychlost rozkladu fenitrothionu, což bylo důkazem probíhající micelární katalýzy. U některých látek byl patrný pokles rychlosti hydrolýzy při nejvyšších koncentracích, což bylo důsledkem jevu nazývaného efekt prázdných micel. Nejvyšší hydrolytické výkonnosti bylo dosaženo u tenzidů, které v molekule obsahovaly ionizovatelné hydroxylové skupiny. Zcela kromobyčejnou výkonnost vykazoval farmaceuticky významný tenzid benzoxonium.
|
|
|
Deriváty pyrazinkarboxylové kyseliny jako potenciální antituberkulotika (příprava a studium biologických vlastností)
Zitko, Jan ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Vinšová, Jarmila (oponent) ; Csöllei, Jozef (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Kandidát: Mgr. Jan Zitko Školitel: Prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. Název disertační práce:Deriváty pyrazinkarboxylové kyseliny jako potencionální antituberkulotika (příprava a studium biologických vlastností) Tato práce se zabývá deriváty kyseliny pyrazin-2-karboxylové (POA) s potencionálním antimykobakteriálním účinkem. V teoretické části práce je kromě stručného popisu tuberkulózy (TBC) jako nemoci popsána epidemiologická situace TBC v celosvětovém měřítku a přidružené rizikové faktory této nemoci v podobě rostoucí rezistence k antituberkulotikům první linie a koinfekce s virem HIV. Dále jsou popsána v současnosti klinicky používaná antituberkulotika a podán přehled nových antituberkulotik v klinické fázi testování. Zvláštní pozornost je věnována pyrazinamidu (PZA), který se uplatňuje jako jedno z nejdůležitějších antituberkulotik první linie. Práce rovněž popisuje současné teorie mechanismu účinku PZA (POA). Důležitou částí této práce je přehled strukturních obměn PZA/POA prováděných v minulosti ve snaze o přípravu nových látek s antimykobakteriálním účinkem a zhodnocení prospěšnosti a významu těchto obměn. V rámci praktické části této práce bylo připraveno celkem 76...
|
host ::
RSS.