|
|
Synthesis and study of azaphthalocyanine quenchers of fluorescence
Kántor, Michal ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Kučerová, Marta (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Michal Kántor Školiteľ: prof. PharmDr. Petr Zimčík, Ph.D. Konzultant: Mgr. Jiří Demuth Názov práce: Syntéza a hodnotenie zhášačov fluorescencie zo skupiny azaftalocyanínov Nesymetrické dialkylamino substituované azaftalocyaníny (AzaPcs) majú unikátne fotofyzikálne vlastnosti - absorpciu svetla medzi 300 a 700nm, skoro nulovú vlastnú fluorescenciu a schopnosť zhášať fluorescenciu ďalších zlúčenín. Tieto vlastnosti robia z AzaPcs vhodných kandidátov na univerzálne ,,dark quenchers", ktoré môžu byť využité v real time PCR. V tejto práci som sa zameral na hodnotenie rozdielov v zhášaní sond značených v rozdielnych pozíciách oligodeoxynukleotidového (ODN) reťazca. Boli pripravené dva zhášače z rôznymi substituentmi vhodnými k väzbe na rozdielne miesta ODN (viď Obr.). Nasledujúc syntézu zhášačov, boli pripravené tri rôzne sondy- jedna so zhášačom v strede ODN (Obr. A), druhá so zhášačom na konci ODN (Obr. B), tretia so zhášačom v strede a na konci ODN (Obr. C). Všetky pripravené sondy boli čistené na systéme HPLC a následne bola zmeraná a porovnaná efektivita zhášania týchto sond.
|
|
|
Compounds combining pyrazinamide and 4-aminobenzoic acid fragments as potential antituberculars
Žecová, Jana ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chémie a farmaceutické analýzy Riešiteľ: Jana Žecová Vedúci diplomovej práce: PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Názov diplomovej práce: Zlúčeniny kombinujúce fragment pyrazínamidu a 4-aminobenzoovej kyseliny ako potencionálne antituberkulotiká Tuberkulóza je závažné infekčné ochorenie, ktoré po storočia sužuje ľudskú svetovú populáciu. Jej stále zastúpenie v rebríčku najsmrteľnejších ochorení, rovnako tak ako výskyt foriem rezistentných na terapiu, naďalej vyžaduje seriózny prístup k tejto problematike a nájdení nových terapeutických možností. V škále liečiv súčasné terapie TBC sa vyskytujú dve látky, PZA a PAS. Pyrazínamid je liečivo 1. línie, jeho derivátmi sa roky zaoberá výskum na Katedre farmaceutickej chémie a farmaceutickej analýzy. Štruktúrne podobná 4-aminobenzoovej kyseline, PAS je antituberkulotikom 2. línie, ktoré sa po rokoch znovu stáva aktuálnym v liečbe rezistentných foriem M. tbc. Táto diplomová práca sa zaoberá možnosťami využitia zlúčenín zložených z fragmentu PZA a 4-aminobenzoovej kyseliny ako potencionálnych antituberkulotík. Práca naďalej zhodnocuje vplyv fragmentu PAS v derivátoch pripravovaných s antimykobakteriálnym účelom. Teoretická časť práce popisuje súčasný svetový stav tuberkulózy, jej...
|
|
|
Oxadiazoly jako potenciální léčiva II.
Kolčárková, Lucie ; Kučerová, Marta (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Kolčárková Lucie Školitel: PharmDr. Marta Kučerová, Ph.D. Název diplomové práce: Oxadiazoly jako potencionální léčiva II. Ve své práci jsem se zaměřila na hledání nových potenciálních léčiv s antibakteriální a antifungální aktivitou a to z důvodu zvyšující se rezistence mikroorganismů na stávající léčiva. Jako strukturní základ byl vybrán 3-pyrazin-2-yl-1,2,4-oxadiazol. V teoretické části jsem se věnovala zejména různým způsobům přípravy 1,2,4-oxadiazolů. Způsoby přípravy jsou rozděleny podle použitých výchozích látek. V experimentální části byly vyzkoušeny různé způsoby přípravy s cílem syntetizovat hledané látky a následně zdokonalit podmínky reakcí, aby bylo dosaženo čistých produktů s vysokým reakčním výtěžkem. Ani jedna z připravených sloučenin dosud popsána nebyla. Sloučeniny byly charakterizovány IČ a NMR spektry a také teplotou tání. Čistota látek byla ověřena za pomocí tenkovrstvé chromatografie a elementární analýzy. Z připravených látek bylo odevzdáno šest produktů na biologické testování antibakteriální a antifungální aktivity in vitro. Byla nalezena střední antifungální aktivita u jedné sloučeniny a u jiné látky střední aktivita vůči Mycobacterium smegmatis a M .aurum.
|
|
|
Studium distribuce substituentů v derivátech na bázi hyaluronanu
Sedláček, Jakub ; Šatínský, Dalibor (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent) ; Chmelař, Josef (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Katedra analytické chemie Kandidát Ing. Jakub Sedláček Školitel doc. RNDr. Dalibor Šatínský, Ph.D. Název disertační práce Studium distribuce substituentů v derivátech na bázi hyaluronanu Deriváty na bázi hyaluronanu nacházejí uplatnění v řadě medicínských odvětví. Připravované deriváty bývají charakterizovány molární hmotností a stupněm substituce, nicméně tyto parametry neumožňují odlišit deriváty s rozdílnou distribucí substituentů podél řetězce, které mohou vykazovat rozdílné makroskopické vlastnosti. Z toho důvodu jsou potřebné metody, které dokážou distribuci substituentů postihnout. Předkládaná disertační práce pojednává o stanovení distribuce aminoskupiny v deacetylovaném hyaluronanu. Teoretická část začíná popisem hyaluronanu, jeho struktury a jeho derivátů. Následně se zaměřuje na deacetylovaný hyaluronan, na jeho využití, přípravu a charakterizaci, přičemž hlavní zájem je věnován jeho depolymerizaci na oligosacharidy pomocí deaminačního štěpení nebo pomocí enzymů štěpících hyaluronan. Nakonec jsou uvedeny příklady metod použitých pro analýzu oligosacharidů hyaluronanu pomocí kapalinové chromatografie. Experimentální část popisuje přípravu vzorků deacetylovaného hyaluronanu, stanovení jejich molárních hmotností rozměrově...
|
|
|
Deriváty kombinující fragment pyrazinamidu a 4-aminosalicylové kyseliny jako antimykobakteriální sloučeniny
Šlechta, Petr ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Řešitel: Petr Šlechta Vedoucí diplomové práce: doc. PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Konzultant: MSc. Ghada Basem Bouz, Ph.D. Název diplomové práce: Deriváty kombinující fragment pyrazinamidu a 4-aminosalicylové kyseliny jako antimykobakteriální sloučeniny Podle Světové zdravotnické organizace (WHO) je tuberkulóza (TB) celosvětově hlavní příčinou úmrtí na infekční onemocnění způsobené jedním infekčním agens a počet případů s lékově rezistentní TB se neustále zvyšuje. Tyto faktory vytvářejí urgentní potřebu vývoje nových, účinnějších antituberkulotik. Z těchto důvodů v této práci prezentujeme design, syntézu a antimikrobiální zhodnocení série hybridních sloučenin, kombinujících různé deriváty pyrazinamidu a p-aminosalicylové kyseliny, jako potencionálních antituberkulotických léčiv. Sloučeniny byly připraveny reakcí různých derivátů pyrazin-2-karboxylové kyseliny, po její aktivaci 1,1'-karbonyldiimidazolem s p-aminosalicylovou kyselinou v prostředí dimethylsulfoxidu jako rozpouštědla. Získané sloučeniny byly testovány in vitro pro zjištění jejich antimykobakteriální aktivity proti M. tuberculosis H37Rv, M. tuberculosis H37Ra a čtyřem dalším mykobakteriálním kmenům. Připravené sloučeniny byly dále...
|
|
|
Synthesis of isoprenoid naringenin derivatives
Kernal, Jakub ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Demuth, Jiří (oponent)
4 Abstrakt Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát Jakub Kernal Konzultant Hubert Chapuis, Ph.D. Název diplomové práce , intenzivního výzkumu pro své antibakteriální, antimykotické a cytotoxické - v této práci (Fig. 1) cí hydroxylové skupiny flavonoidu v poloze 4 , nebo esterifikací hydroxylových skupin na obou kruzích flavonoidu A -uhlík na kruhu A flavonoidu. Fig. 1. Modifikace molekuly naringeninu esterifikace (modrá) nebo tvroba vazby uhlík-uhlík .
|
|
|
Synthesis and delivery of novel fluorescently-labelled nucleotides and their nucleic acids for bio-analytical applications
Güixens Gallardo, Pedro ; Hocek, Michal (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent) ; Klán, Petr (oponent)
1 Abstrakt Cílem disertační práce bylo syntetizovat nové fluorescenčně značené nukleotidy a odpovídající nukleové kyseliny pro bioanalytické aplikace a také pro jejich transport do buněk. Práce se také zaměřila na vývoj účinné metody pro inhibici netemplátové inkorporace nukleotidů. Problematická netemplátová enzymatická inkorporace nukleotidů je řešena použitím několika komerčně dostupných 5'-modifikovaných-oligonukleotidů. Oligonukleotidy (ON), které jsme testovali, obsahovaly ortho interkalující skupinu (oTINA), tritylovou skupinu nebo biotin na 5'-konci. Modifikované oligonukleotidy byly použity jako templáty v experimentech enzymatického prodloužení primeru (PEX) v přítomnosti buď modifikovaných nukleotidů nebo pouze přírodních deoxynukleosid trifosfátů (dNTP). Templáty oTINA byly použity pro PEX reakce s využitím přírodních dNTP a různých DNA polymeráz rodiny A nebo B. Souběžně byly nezávisle na sobě navrženy a syntetizovány dva typy fluorescenčních nukleosidových derivátů. Nejprve jsme navrhli nové fluorescenční nukleotidové značky obsahující hexamethylovanou BODIPY skupinu jako výraznou fluorescenční značku. Mimo to jsme se zaměřili na zlepšení fluorescenčních nukleotidových sond citlivých na viskozitu a polaritu. Fluorescenčně značené methylované BODIPY nukleotidy (dNmBdpTP) byly připraveny s...
|
|
|
Syntéza anionických derivátů ftalocyaninů jako potenciálních fotodynamicky aktivních látek
Kollár, Jan ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Mosinger, Jiří (oponent) ; Zitko, Jan (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Mgr. Jan Kollár Školitel: prof. PharmDr. Petr Zimčík, Ph.D. Konzultant: doc. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Disertační práce: Syntéza anionických derivátů ftalocyaninů jako potenciálních fotodynamicky aktivních látek Ftalocyaniny (Pc) a jejich aza-analogy (např. tetrapyrazinoporfyraziny TPyzPz) představují nadějnou skupinu organických barviv se zajímavými fotofyzikálními vlastnostmi (silná absorpce v oblasti 650-750 nm, vysoká produkce singletového kyslíku) velmi vhodnými pro použití ve fotodynamické terapii (PDT) nádorových onemocnění. Mají však také některé nevýhody snižující jejich potenciální použití v PDT (nízká rozpustnost ve vodě, silná tendence k agregaci). Téma mé disertační práce úzce navazuje na téma mé diplomové práce, během které byl připraven TPyzPz s 16 karboxylátovými skupinami v rigidním uspořádání, u kterého jsme pozorovali výrazný negativní vliv pH a sérových proteinů na fotodynamickou aktivitu. V první části disertační práce jsem proto připravil nový zinečnatý TPyzPz s 8 sulfonátovými skupinami na periferii charakterizovaný dobrou rozpustností ve vodě. Sulfonové kyseliny byly vybrány jako silnější kyseliny než karboxylové, takže se očekávalo, že...
|
|
|
Syntéza anionických derivátů ftalocyaninů jako potenciálních fotodynamicky aktivních látek
Kollár, Jan ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Mosinger, Jiří (oponent) ; Zitko, Jan (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Mgr. Jan Kollár Školitel: prof. PharmDr. Petr Zimčík, Ph.D. Konzultant: doc. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Disertační práce: Syntéza anionických derivátů ftalocyaninů jako potenciálních fotodynamicky aktivních látek Ftalocyaniny (Pc) a jejich aza-analogy (např. tetrapyrazinoporfyraziny TPyzPz) představují nadějnou skupinu organických barviv se zajímavými fotofyzikálními vlastnostmi (silná absorpce v oblasti 650-750 nm, vysoká produkce singletového kyslíku) velmi vhodnými pro použití ve fotodynamické terapii (PDT) nádorových onemocnění. Mají však také některé nevýhody snižující jejich potenciální použití v PDT (nízká rozpustnost ve vodě, silná tendence k agregaci). Téma mé disertační práce úzce navazuje na téma mé diplomové práce, během které byl připraven TPyzPz s 16 karboxylátovými skupinami v rigidním uspořádání, u kterého jsme pozorovali výrazný negativní vliv pH a sérových proteinů na fotodynamickou aktivitu. V první části disertační práce jsem proto připravil nový zinečnatý TPyzPz s 8 sulfonátovými skupinami na periferii charakterizovaný dobrou rozpustností ve vodě. Sulfonové kyseliny byly vybrány jako silnější kyseliny než karboxylové, takže se očekávalo, že...
|
|
|
Příprava a studium aminoftalocyaninů II.
Mocák, Ivan ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Ivan Mocák Školitel: prof. PharmDr. Petr Zimčík, Ph.D. Název diplomové práce: Příprava a studium aminoftalocyaninů II. Azaftalocyaniny (AzaPc) jsou dusíkaté analogy ftalocyaninů (Pc), které se od nich liší záměnou benzenového jádra za jádro pyrazinové, pyridinové nebo pyridazinové. Vyznačují se širokým spektrem charakteristických fotofyzikálních a fotochemických vlastností, díky kterým nacházejí své uplatnění v mnoha oblastech, jako například průmyslová barviva, fotosenzitizéry ve fotodynamické terapii nebo jako fluorescenční senzory. V posledních letech roste význam dialkylamino substituovaných AzaPc v oblasti zhášení fluorescence. Díky svému širokému absorpčnímu spektru jsou vhodnými kandidáty stát se univerzálními zhášeči. Za jejich zhášení fluorescence zodpovídá proces nazývaný intramolekulární přenos náboje (ICT) z periferních dialkylamino skupin. Tyto skupiny ovšem dávají také vznik unikátním supramolekulárním útvarům - J-dimerům V této práci je zkoumán vliv objemnosti dialkylamino substituentů na tvorbu J-dimerů, které se ve srovnání s druhou formou, H-dimery, vyskytují vzácněji. Výsledky práce také popisují, jak tvorba J-dimerů ovlivňuje proces ICT. Syntéza zkoumaných...
|
host ::
RSS.