|
|
Optimalizace metody izotermální amplifikace zprostředkované smyčkou pro testování infekce způsobené bakterií Haemophilus influenzae
Zadáková, Kateřina ; Jeřábek, Petr (vedoucí práce) ; Svášková, Dagmar (oponent)
Haemophilus infuenzae je gramnegativní, tyčinkovitý a převážně lidský patogen. Infekce způsobená tímto mikroorganismem je nebezpečná především pro děti do pěti let, u kterých způsobuje hlavně pneumonii a meningitidu. Ačkoliv je proti jeho nejnebezpečnějšímu typu b dostupné očkování, působí především v rozvojových zemích stále potíže. Díky tamější nízké proočkovanosti se navíc šíří kmeny, které jsou více rezistentní vůči antibiotikům, jež se pro léčbu infekce využívají. Přístrojová náročnost pro současné možnosti detekce infekce bakterií H. influenzae (např. polymerázová řetězová reakce) způsobuje, že v ekonomicky chudších částech světa je spolehlivá detekce problémem. Možnou levnou a spolehlivou metodou by se mohla stát izotermální amplifikace DNA pomocí smyčky. Předmětem této bakalářské práce tak bylo navržení sad "primerů" a jejich aplikace při LAMP reakci. Navržené "primery" cílily na gen ompP6, kterýjiž v některýchstudiíchbyl cílem LAMP reakce a je také častým cílem při detekci metodou PCR. V rámci optimalizace byly zkoušeny rozdílné objemy reakční směsi a více možností detekce produktů LAMP reakce - kolorimetrická detekce pomocí acidobazického indikátoru a fluorescenční detekce pomocí různých barviv sledována v reálném čase. Klíčová slova: Haemophilus influenzae, izotermální amplifikace...
|
|
|
Porovnání různých molekulárně-biologických přístupů pro detekci přítomnosti DNA patogenní bakterie Haemophilus influenzae
Smrčka, Tomáš ; Martínková, Markéta (vedoucí práce) ; Dračínská, Helena (oponent)
Haemophilus influenzae patří mezi hlavní původce meningitidy a zápalu plic u dětí. Zavedení rychlé, levné a přístrojově nenáročné metody detekce tohoto patogenu by zásadní měrou přispělo k včasné a cílené léčbě pacientů. Rozvoj amplifikačních metod v posledních dekádách umožňuje, krom běžně používané metody PCR, aplikaci alternativních přístupů, mezi něž patří i metoda LAMP. Předmětem zájmu této bakalářské práce proto bylo studium alternativní metody LAMP jakožto nástroje pro detekci Haemophilus influenzae. LAMP metoda byla pro Haemophilus influenzae úspěšně zavedena, nicméně se potýkala s falešnou pozitivitou negativní kontroly v případě delších inkubačních časů. Byla proto navržena optimalizovaná metoda LAMP v přítomnosti deoxyuridintrifosfátu a uracil-DNA glykosylasy. Jejím cílem bylo za pomocí inkorporace uracilů do amplifikovaných úseků DNA a následného odštěpení uracilů působením uracil-DNA glykosylasy pozměnit strukturu amplifikačních produktů, zabránit tak jejich replikaci při případné kontaminaci reakčních směsí při dalších stanoveních a tím snížit riziko falešné pozitivity negativních kontrol na minimum. Byla optimalizována koncentrace deoxyuridintrifosfátu v reakční směsi pro výše uvedené účely. Zásadním přispěním předkládané bakalářské práce k optimalizaci LAMP metody pro detekci...
|
|
|
Pandemie španělské chřipky 1918/19 se zvláštním zřetelem na České země a středoevropské poměry
Salfellner, Harald ; Hlaváčková, Ludmila (vedoucí práce) ; Fialová, Ludmila (oponent) ; Pock, Lumír (oponent)
Univerzita Karlova v Praze 1. lékařská fakulta Studijní program: Dějiny lékařství Abstrakt disertační práce Pandemie španělské chřipky 1918/19 se zvláštním zřetelem na České země a středoevropské poměry Dr. med. univ. Harald Salfellner Praha, 2017 Abstrakt Na konci první světové války, v letech 1918 a 1919, postihla lidstvo dosud nevídaná pandemie chřipky, jíž během několika málo měsíců padlo za oběť více lidí, než ve všech bitvách první světové války 1914-18 dohromady. Přesný počet obětí není znám a je dnes různými prameny udáván mezi 20 a 50 miliony. S výjimkou několika odlehlých ostrůvků byl touto takzvanou španělskou chřipkou postižen celý svět, zvláštní měrou pak Evropa vykrvácená industriálně vedenou válkou. V létě roku 1918 dorazila pandemie v podobě první, relativně neškodné vlny, do českých zemí, o několik týdnů později se nemoc proměnila ve smrtelné ohrožení, kterému i u Vltavy podlehly tisíce lidí. Zatímco v říjnu 1918 povstávala z trosek rakouského mnohonárodního státu první Československá republika a davy ve městech jásaly, hleděly tisíce nemocných svírané horečkou a kašlem za zataženými závěsy vstříc svému nejistému osudu. Zatímco v USA byla chřipková pandemie jakožto největší zdravotní katastrofa 20. století podrobně probádána v četných vědeckých příspěvcích a monografiích, existují v mnoha...
|
|
| |
|
|
Beta-laktamáza pozitivní Haemophilus influenzae u dětí
BROMOVÁ, Pavla
Tato bakalářská práce Beta-laktamáza pozitivní Haemophilus influenzae u dětí pojednává o základních vlastnostech a současném výskytu bakterií Haemophilus influenzae, ale také o výskytu ostatních hemofilů (Haemophilus species)u dětí, které se vyskytly v materiálu přijatém mikrobiologickou laboratoří Laboma s.r.o. v Českých Budějovicích, jež některé z nich byly producenty {$\beta$}-laktamáz. Přítomnost těchto enzymů může být velkým problémem pro správnou volbu antibiotika při léčbě onemocnění způsobených těmito hemofily. Základním cílem této práce bylo shromáždit a vyhodnotit veškerá data o {$\beta$}-laktamáza pozitivních hemofilech, z materiálu dýchacích cest u dětí, ve věkovém rozmezí od narození až do 15 let a s určitými čísly diagnóz v již zmíněné mikrobiologické laboratoři. Data v mé práci jsem shromáždila za druhé pololetí roku 2008 a první roku 2009, po té jsem je statisticky zpracovala do grafických obrázků a tabulek jako výsledky. Také jsem se naučila ovládat jednoduchou používanou diagnostickou metodu pro průkaz {$\beta$}-laktamázy (test {$\beta$}-LACTAstrip), při které došlo v přítomnosti {$\beta$}-laktamázy k barevné změně v zóně indikátorového papírku. Navštívila jsem i praktické lékaře pro děti a dorost, kteří spolupracují s touto laboratoří. Odpověděli mi ochotně na čtyři otázky v dotazníku, jejichž hlavní cíl byl zaměřen na léčbu nemocných dětí, které mají v materiálu horních cest dýchacích přítomné {$\beta$}-laktamáza pozitivní hemofily. Ze shromážděných výsledků jsem pak dokázala vyvrátit hypotézu 1, tak že jsem vypočetla průměrnou relativní četnost z celkového výskytu hemofilů produkujících {$\beta$}-laktamázy a zjistila, že produkce těchto enzymů je nižší než 50 %. Zároveň jsem potvrdila hypotézu 2, že častějšími producenty {$\beta$}-laktamáz jsou ostatní hemofily (H. species) než H. influenzae. Z odpovědí od lékařů na můj dotazník jsem pak vyčetla, že všichni tito lékaři berou při volbě antibiotik v úvahu přítomnost {$\beta$}-laktamázy, čímž jsem potvrdila hypotézu 3. Tato bakalářská práce může sloužit jako argument pro to, aby praktičtí dětští lékaři brali v úvahu při volbě antibiotik v materiálu přítomnost producentů {$\beta$}-laktamáz.
|
host ::
RSS.