|
Detekce onemocnění způsobených diabetem na snímcích sítnice
Zapletal, Michal ; Semerád, Lukáš (oponent) ; Kavetskyi, Andrii (vedoucí práce)
Cílem této práce je návrh a implementace algoritmu na detekci exsudátů a mikroaneurysmat na barevných snímcích sítnice. Tato onemocnění jsou prvními projevy diabetické retinopatie a včasné diagnostikování je stěžejní. Navržený algoritmus začíná předzpracováním, kde je odstraněno přebytečné pozadí, zvýšen kontrast pomocí CLAHE a histogram stretching a filtrování šumu. Lokalizace optického disku je založena na iterativním odstranění pozadí a řádkových a sloupcových rozptylech. Detekce exsudátů probíhá na základě gamma korekce, prahování a odstranění optického disku. Detekce mikroaneurysmat je založena na morfologických operacích, hit-or-miss transformaci a principal component analysis (PCA). Testováno bylo celkem na 4 datových sadách s přesností 73,1 % pro exsudáty a 73,3 % pro mikroaneurysmata. Výsledný program by mohl pomoci k automatické detekci onemocnění, které by mohlo ušetřit samotným lékařům čas.
|
|
Segmentace významných struktur v obrazových datech sítnice
Trojánek, Václav ; Mézl, Martin (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zaměřuje na segmentaci významných struktur v obrazových datech sítnice s cílem zlepšit diagnostiku a léčbu očních onemocnění. V práci jsou zkoumány a implementovány metody analýzy obrazů sítnice. Práce začíná přehledem anatomie oka a principů snímání očního pozadí pomocí fundus kamery a experimentálního video oftalmoskopu. Následuje podrobná literární rešerše zaměřená na aktuální metody detekce a segmentace diagnosticky významných struktur, jako jsou optický disk, žlutá skvrna a krevní cévy. Klíčovou částí práce je implementace a testování vybraných algoritmů, včetně Houghovy transformace pro detekci optického disku, OTSU prahování pro segmentaci krevních cév a detekci žluté skvrny na základě předchozí segmentace optického disku.
|
|
Lokalizace optického disku na snímcích sítnice
Pěchotová, Barbora ; Kolář, Radim (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá analýzou retinálních snímků z digitální fundus kamery, zejména vlastnostmi struktury optického disku (OD). Teoreticky popisuje základní vlastnosti lidského zrakového systému a princip vyšetření očního pozadí, jehož výstupem jsou právě zkoumané retinální snímky. V práci jsou zmíněny dostupné metody, které již byly pro lokalizaci OD použity. V druhé části je navržen automatický detektor optického disku, založený na principu genetických algoritmů s využitím segmentace cévního řečiště sítnice. Tato metoda je otestována na snímcích databáze.
|
|
Segmentace významných objektů v barevných oftalmologických obrazech
Malínský, Miloš ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Optický disk a žlutá skvrna patří mezi hlavní prvky sítnice. Jejich detekce a rozměření sehrává významnou roli v diagnostice očních onemocnění. Tato práce popisuje metody detekce optického disku a žluté skvrny v barevných oftalmologických obrazech. Jedná se o nalezení středu žluté skvrny a optického disku, u kterého je dále detekována vnější hranice. Existuje řada metod pro segmentaci těchto prvků z retinálních obrazů. Všeobecně přijatá detekční metoda však není známa z důvodu existence různých technik pořizování dat s rozlišnými charakteristikami. Diplomová práce popisuje veškerý proces detekce, od předzpracování přes segmentaci k závěrnému zpracování. Prezentované metody jsou založeny na kombinaci korelačních technik, Houghovy transformace, aktivních kontur a morfologických operací. Výsledné kontury optického disku jsou zpracovány a kvantitativně vyhodnoceny pomocí porovnání s konturou označenou zkušeným oftalmologem. Diplomová práce obsahuje množství obrázků, které mají usnadnit pochopení aplikované detekce.
|
|
Analýza cévní pulzace v retinálních video sekvencích
Valentová, Vanessa ; Kolář, Radim (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Glaukóm je treťou najčastejšou príčinou slepoty na svete. Existuje niekoľko typov glaukómu, čo sťažuje včasnú diagnózu tohoto ochorenia. Jednou z možných metód včasnej diagnostiky môže byť analýza pulzácie retinálnych ciev. Použité dáta v tejto práci boli získané prostredníctvom experimentálneho zariadenia nazývaného video oftalmoskop. Bolo navrhnutých niekoľko metód segmentácie optického disku. Zo segmentovaných častí bola nahraná pulzačná krivka. Boli navrhnuté dva typy analýzy pulznej krivky: Analýza celej pulznej krivky a Analýza priemerného pulzu. Obe metódy boli testované s rôznymi referenčnými signálmi.
|
|
Lokalizace optického disku na snímcích sítnice
Pěchotová, Barbora ; Kolář, Radim (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá analýzou retinálních snímků z digitální fundus kamery, zejména vlastnostmi struktury optického disku (OD). Teoreticky popisuje základní vlastnosti lidského zrakového systému a princip vyšetření očního pozadí, jehož výstupem jsou právě zkoumané retinální snímky. V práci jsou zmíněny dostupné metody, které již byly pro lokalizaci OD použity a je vybrána metoda pro další práci s obrazovými daty. Práce se podrobněji zabývá vybranou metodou detekce OD pomocí geometrického modelu s využitím segmentace cévního řečiště pomocí metody založené na přizpůsobené filtraci. Na originálních snímcích z dostupné databáze je otestována navržená semiautomatická metoda pro lokalizaci polohy optického disku.
|
|
Optic disc segmentation in retinal images
Vymazal, Bronislav ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
The goal of this thesis is to propose a compact algorithm for localizing, segmenting and tracking the optic disk in fundus images. For localizing the optic disk a new technique based on fast radial symmetry transform was used. The segmentation is based on the Chan-Vese model but is also extended about multi feature space and implemented in its localized version that helped to deal with image inhomogeneity. The optical flow approach base on lucas-kanade algorithm is used for tracking of the optic disk through the image sequences. The algorithms are evaluated on two different fundus image databases with different characteristics. First is high resolution databases containing 45 images and the second is noisy low resolution database containing 33 images provided separately for each color plane. The results are then compared to a gold standard reference values.
|
|
Detekce optického disku v sériích snímků z video oftalmoskopu
Čermák, Marek ; Mézl, Martin (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Tato práce je zaměřena na automatickou detekci optického disku v sítnicových obrazech. Je zde stručně popsána anatomie lidského oka, principy snímání očního pozadí a také přehled používaných metod pro detekci optického disku. Praktická část popisuje vytvořené postupy pro detekci optického disku, tedy detekci založenou na metodě rozvodí, aktivních konturách a také na metodě narůstání oblastí. Stěžejní metodou této práce je metoda kruhové transformace, která jako jediná umožnila detekovat optický disk na snímcích z video oftalmoskopu a také na kvalitních snímcích z fundus kamer. Metoda kruhové transformace byla otestována na třech databázích. Na databázi HRF dosáhla průměrného překrytí 92,44 %, na databázi DRIONS 91,03 % a na snímcích z video oftalmoskopu pak 77,36 %.
|
|
Detekce optického disku ve snímcích optické koherentní tomografie
Šeda, Jan ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Hlavním úkolem této práce je návrh programu pro lokalizaci hranic optického disku v datech OCT. Součástí programu je také lokalizace „optic cup“ a výpočet několika hodnot charakterizující optický disk. Práce se dále zabývá popisem principu optické koherentní tomografie používané v oftalmologii. V jedné kapitole jsou popsány vybrané publikované metody lokalizace optického disku. V závěru práce je vyhodnocena úspěšnost navrhovaného programu a porovnání s OCT Zeiss Stratus 3000.
|
|
Detekce optického disku ze sekvencí snímků fundus kamery
Juráček, Radek ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Hracho, Michal (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá detekcí optického disku v retinálních snímcích pořízených experimentálním video-oftalmoskopem. Na úvod stručně popisuje anatomii zraku a sítnice, onemocnění sítnice a vybrané diagnostické metody snímání sítnice. V práci jsou popsány metody detekce objektů v obraze, které jsou následně použity v praktické části zabývající se detekcí optického disku pomocí Houghovy transformace a přizpůsobené filtrace. Navržené postupy byly otestovány na sadě 100 snímků. Detekce pomocí Houghovy transformace byla úspěšná v 64% případů, detekce pomocí přizpůsobené diltrace byla úspěšná v 44% případů.
|