|
|
Evoluční algoritmy pro ultrazvukovou perfúzní analýzu
Kolářová, Jana ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato diplomová práce je zaměřena na aplikaci evolučních algoritmů při prokládání dat získaných ultrazvukovým snímání tkáně. Proložená křivka slouží k odhadům perfúzních parametrů, umožňuje odhalit případné patofyziologie ve snímané oblasti. Teoretický úvod je věnován perfúzi a jejím parametrům, kontrastním látkám pro ultrazvukovou aplikaci, snímání ultrazvukovou modalitou, optimalizaci, evolučním algoritmům obecně a dvěma zvoleným evolučním algoritmům – genetický algoritmus a včelí algoritmus. Tyto dva algoritmy byly testovány na zašuměných datech získaných z klinických snímků myší s nádorem. V závěrečné části jsou shrnuty výsledky praktické části a poskytnuty návrhy a doporučení pro další možné zpracování.
|
|
|
Funkční nanodiagnostika pro 31-P zobrazování magnetickou rezonancí: Nové paradigma pro kontrastní látky
Pechrová, Zdislava ; Hrubý, Martin (vedoucí práce) ; Kotek, Jan (oponent)
Náplní mojí diplomové práce je vývoj koncepčně nové třídy kontrastních látek pro 31P zobrazení magnetickou rezonancí (MRI). Tyto kontrastní látky jsou založeny na nanočásticích fytátu vápenatého (CaIP6), což je sůl kyseliny fytové (myo-inositol-1,2,3,4,5,6-hexakisfosfátu). Fytát je běžně přítomen v rostlinách (zejména v semenech a zrnech). Není biologicky rozložitelný, ale je netoxický pro zvířata i lidi a kolem 22 % jeho hmotnosti tvoří fosfor, což je využitelné pro 31P NMR / MRI. Tyto nanočástice CaIP6 jsou dopovány paramagnetickými ionty Fe3+, které rozšiřují signál 31P, čímž jsou nanočástice ve zdravých tkáních neviditelné. V přítomnosti bakterií produkujících siderofory (například v Helicobacter pylori v žaludečních vředech), je Fe3+ uvolňován rechelatací z nanočástic a 31P a signál je opět detekovatelný. In vitro simulace tohoto uvolnění byla modelována deferoxaminem, což je bakteriální siderofor ze Streptomyces pilosus s vysokou afinitou k iontům Fe3+. Nanočástice CaIP6 byly syntetizovány dvěma způsoby. První cestou je přímé srážení fytátu vápenatou solí. Druhou možností je iontová výměna fosfátu v nanočásticovém hydroxyapatitu, který vytváří elektrostaticky stabilizované nanočástice fytátu vápenatého. Nejlepší metodou na přípravu dopovaných částic se ukázala syntéza srážením fytátu...
|
|
|
Kontrastní MRI perfuzní zobrazování
Šejnoha, Radim ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Krátká, Lucie (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce je zaměřena na kontrastní MRI perfuzní zobrazování pomocí metody Dynamic Contrast-Enhanced MRI. Jsou zde popsány základní principy nukleární magnetické rezonance a pulzní sekvence používané při DCE MRI. Práce obsahuje část věnovanou dynamickému kontrastnímu zobrazování fantomu na experimentálním NMR přístroji umístěném na Ústavu přístrojové techniky AV ČR v Brně. Výsledky měření jsou vyhodnoceny na základě modelů a získané perfuzní parametry jsou diskutovány.
|
|
|
Modelování parametrické arteriální vstupní funkce v perfúzním zobrazování
Černý, Štěpán ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Kratochvíla, Jiří (vedoucí práce)
Cílem bakalářské práce je prostudovat tématiku v oblasti perfúzního zobrazování založené na dynamickém zobrazování s T1 kontrastem. Zaměření bylo především na úlohu arteriální vstupní funkce. Jsou popsány principy jevu dynamického měření magnetickou rezonancí, úloha kontrastních látek a jejich vliv na relaxační čas T1. Dále je popsána problematika perfusní analýzy, měření a matematické modelování arteriální vstupní funkce a získávání perfúzních parametrů. V experimentální části je provedeno naprogramování jedenácti modelů arteriální vstupní funkce a jejich zhodnocení. Dále vytvoření programu pro aproximaci reálných měřených arteriálních vstupních funkcí vytvořenými modely a začlenění tohoto programu do vytvořeného grafického rozhraní pro práci s modely. Dále byla ověřena funkčnost programu a zhodnocena úspěšnost aproximace pro jednotlivé modely.
|
|
|
Využití multi-echo sekvencí pro DSC-MRI
Černý, Štěpán ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Macíček, Ondřej (vedoucí práce)
Cílem diplomové práce bylo prostudovat tématiku v oblasti perfúzního zobrazování založené na dynamickém zobrazování s T2/T2* kontrastem. Zaměření bylo na akvizice běžně používané pro DSC-MRI a především na akviziční pulzní sekvence, které zaznamenávají obrazy s různým echo časem, tzv. multi-echo sekvence. Jsou popsány principy jevu dynamického měření magnetickou rezonancí, úloha kontrastních látek a jejich vliv na relaxační časy. Dále je popsána problematika perfusní analýzy, měření a matematické modelování parametrů vstupujících do konvoluční závislosti pro zisk perfúzních parametrů. V experimentální části je provedeno naprogramování algoritmu pro zisk relaxační křivky času T2*. Dále jsou vytvořeny umělá data a je na nich testována robustnost odhadu perfuzních parametrů vůči šumu. V další fázi práce jsou porovnávány reálné nasnímáné živé a neživé objekty za použití konverze s T2* a bez. V poslední fázi práce je porovnáván vliv echo délky použitých echo časů na výsledné koncentrační křivky a po provedení perfuzní analýzy vliv na výsledné perfuzní parametry
|
|
|
Zvýraznění kontrastu pro rozlišení tkání a detekci kontrastních nanočástic metodami magnetickorezonančního zobrazování
Bačovský, Jaromír ; Macíček, Ondřej (oponent) ; Starčuk, Zenon (vedoucí práce)
Předložená diplomová práce se zabývá mechanismy vzniku kontrastu a jeho modifikací v magneticko-rezonančních obrazech molekulárními a nanočásticovými kontrastními činidly. V teoretické části shrnuje principy vzniku kontrastu a funkce kontrastních látek se speciálním důrazem na paramagnetické gadoliniové kontrastní látky a superparamegnetické nanočástice. Na základě analýzy typických MRI sekvencí si diplomová práce kladla za cíl vytvořit softwarovou aplikaci nazvanou MRICalc umožňující zjistit vhodné nastavení parametrů pulzní sekvence pro dosažení maximálního kontrastu. Program byl včetně grafického uživatelského prostředí vyvíjen v programovacím jazyce Python. V základní nabídce obsahuje pulsní sekvence spinové echo, FLASH, SSFP-Echo, TrueFISP, Dual - echo SSFP, Dual - echo GRE a FISP. Program umožňuje výpočet parametrů pulsní sekvence (opakovací čas, echo čas, sklápěcí úhel), kde nastává maximum kontrastu a vykreslení grafu průběhu kontrastu v závislosti na zvoleném proměnném parametru. Uživatel vybírá z předem definovaných látek, mezi kterými má být optimalizován kontrast. Korektní funkce aplikace MRICalc byla experimentálně ověřena pomocí fantomu připraveného z roztoků síranu měďnatého a destilované vody. Síran měďnatý plní ve fantomu funkci kontrastního činidla. Měření probíhalo na preklinickém MR systému Bruker Avance III 94/30 instalovaném v ÚPT AV ČR, v.v.i. Byla proměřena křivka kontrastu pro sekvenci FLASH, která je typickou variantou gradientního echa. Výsledek měření byl následně srovnán s teoretickým modelem spočteným aplikací MRICalc.
|
|
|
Model dynamických kontrastních CT dat pro hodnocení lícovacích algoritmů
Kupková, Karolína ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Walek, Petr (vedoucí práce)
Diplomová práce je zaměřena na popis dynamického kontrastního CT vyšetření a jeho přínosnosti v pneumoonkologii. Součástí je program pro vytvoření dvojrozměrného modelu snímku z oblasti hrudního koše a pro simulaci perfuzního vyšetření pomocí časově-kontrastní křivky. Pomocí rigidních geometrických transformací a šumu s výkonovým spektrem typickým pro tento typ dat jsou věrohodněji simulovaná skutečná CT data. Model je navržen pro validaci lícovacích algoritmů, které slouží k potlačení prostorových deformací vznikajících pohyby pacienta při dlouhotrvajícím vyšetření.
|
|
|
Akvizice MRI obrazových sekvencí pro preklinické perfusní zobrazování
Krátká, Lucie ; Bartoš, Michal (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Úkolem diplomové práce je prostudovat akviziční metody pro perfusní zobrazování zaloţené na dynamickém MR zobrazování s T1 kontrastem. Jsou zde popsány metody měření relaxačního času T1 a moţnosti hodnocení výsledků. Dále jsou zde popsány fantomy a způsob jejich vyuţití. A je zde zmíněn akviziční protokol pro dynamické perfusní zobrazování. Dále je zde podrobně popsán vytvořený program pro automatické ovládání NMR systému. V experimentální části jsou provedena měření na statickém a dynamickém fantomu a jsou zde také vyhodnoceny perfusní parametry ze sekvence Flash.
|
|
|
Akvizice a předzpracování MRI obrazových sekvencí pro klinické perfusní zobrazování
Krchňavý, Jan ; Bartoš, Michal (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce popisuje teorii pro statické a dynamické magneto-rezonanční zobrazování s použitím kontrastní látky ovlivňující relaxační dobu T1. Jsou popsány dostupné akviziční metody v určeném nemocničním zařízení Masarykova onkologického ústavu v Brně. Jsou vybrány vhodné sekvence pro následné experimentální měření. Jsou popsány použití fantomy. Definován je akviziční protokol pro měření a navrhnut je způsob hodnocení naměřených dat. Pomocí odhadu relaxační doby T1, citlivosti a poměru signálu k šumu je vybrána nejvhodnější sekvence a metoda pro dynamické měření. Je provedena perfusní analýza a zjištěny perfusní parametry dynamického měření. Práce byla podpořena Evropským fondem pro regionální rozvoj a státním rozpočtem České republiky (OP VaVpI - RECAMO, CZ.1.05/2.1.00/03.0101)
|
|
| |
host ::
RSS.