|
|
Laboratorní úlohy z RTG zobrazovacích systémů
Kuchař, Otakar ; Macíček, Ondřej (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Bakalářská práce se zabývá studií rentgenového záření a výpočetní tomografie. První část této práce obsahuje vysvětlení základních fyzikálních principů, je věnována elementárním částicím, atomu a ionizujícímu záření. Následující části objasňují témata od vzniku a druhu rentgenového záření, přes interakce záření s tkání, po detekci RTG záření. U výpočetní tomografie práce objasňuje sběr dat, rekonstrukci obrazu pomocí metod prosté zpětné projekce, filtrované zpětné projekce a algebraické rekonstrukce. V praktické části je popsáno několik provedených měření na rentgenové komoře pro výukové účely od firmy Leybold. Témata řeší útlum rentgenového záření v závislosti na druhu a tloušťce materiálu a spektrum RTG záření. V oblasti výpočetní tomografie jsou zařazeny úlohy řešící změnu kontrastu, akvizičních parametrů a metody pro rekonstrukci. Práce zahrnuje vypracovaná ukázková řešení k laboratorním úlohám.
|
|
|
Tvorba konečněprvkového modelu lidského vokálního traktu a prostoru okolo hlavy na základě dat z počítačové tomografie
Švarc, Martin ; Pellant, Karel (oponent) ; Švancara, Pavel (vedoucí práce)
Následující práce se zabývá vytvořením výpočtového modelu pro šíření akustických vln vokálním traktem a prostorem okolo hlavy. Součástí práce je zmapování trojrozměrného modelu lidské hlavy, jako doplňující akustické prostředí pro zpřesnění měření lidského hlasu na základu dat z výpočtové tomografie, sepsání rešeršní studie o funkci hlasivek, biomechaniky tvorby lidského hlasu a uvedení přehledu medicínských zobrazovacích metod vhodných pro zobrazování biomechanických modelů. Na základě vytvořené geometrie vokálního traktu (od hlasivek ke rtům) a akustického prostoru okolo hlavy člověka dojde k následnému vytvoření sítě pro výpočty metodou konečných prvků (MKP). Síť bude vytvořena za účelem získání nových poznatků ohledně různých umístění mikrofonu u lidské hlavy.
|
|
|
Algoritmy pro rekonstrukci obrazu z projekcí
Zemek, Marek ; Chmelík, Jiří (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Práce je zaměřena na problematiku rekonstrukce obrazu z jeho projekcí a na hodnocení kvality této rekonstukce pomocí různých typů algoritmů. Obzvláštní pozornost je věnována aplikaci těchto algoritmů v lékařské zobrazovací modalitě CT. Úvodní část se zabývá teoretickým rozborem algoritmů používaných v současnosti. Následně je popsána realizace několika jednoduchých rekonstrukčních metod v prostředí Matlab, jejich aplikace na simulovaná i reálná data a následné zhodnocení a porovnání z hlediska kvality rekonstrukce a výpočetní náročnosti.
|
|
|
Anatomy based landmark detection in brain CT scans
Krajčiová, Alexandra ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Manual detection of anatomical landmarks from head CT (Computed Tomography) scans is time-consuming task prone to observer errors. In addition, the accuracy of the detection correlates with image quality. The aim of this work is to create an algorithm that will perform automatic detection of anatomical landmarks. These landmarks can be later used to form radiological lines, which finds its application in CT scanning. SVM (Support Vector Machines) and HOG (Histograms of Oriented Gradients) features was chosen for anatomical landmark detection. The achieved results, possibilities of further progress and improvement of detection are summarized in the conclusion.
|
|
|
Digitální metody zpracování trojrozměrného zobrazení v rentgenové tomografii a holografické mikroskopii
Kvasnica, Lukáš ; Číp, Ondřej (oponent) ; Štarha, Pavel (oponent) ; Chmelík, Radim (vedoucí práce)
Disertační práce se zabývá metodami počítačového zpracování obrazových dat v rentgenové mikrotomografii a v digitální holografické mikroskopii. Práce si klade za cíl dosáhnout optimalizací a využitím masivně paralelních grafických karet (GPU -- graphic processing unit) výrazného zrychlení algoritmů jak pro rekonstrukci tomografického zobrazení, tak pro rekonstrukci obrazu v holografické mikroskopii. V oblasti mikrotomografie předkládá práce nové GPU akcelerované implementace filtrované zpětné projekce a filtrace zpětné projekce derivovaných dat. Dále je představena technika normalizace orientace a vyhodnocení 3D tomografických dat. V části týkající se holografické mikroskopie je uveden popis jednotlivých kroků celého zpracování obrazu. Je představena nová původní technika navazování a korekce obrazové fáze poškozené výskytem optických vírů v nenavázané obrazové fázi. Následuje popis rychlé GPU implementace metody kompenzace deformací obrazové fáze a techniky trasování buněk. V závěru je krátce představen program Q-PHASE, který je výsledkem spojení všech algoritmů nezbytných jak pro ovládání, tak rekonstrukci obrazu v holografickém mikroskopu.
|
|
|
Segmentace meziobratlové ploténky v obrazových datech
Meloun, Jan ; Nemček, Jakub (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Práce je zaměřena segmentaci meziobratlové ploténky v obrazových datech. Úvod prácese věnuje problematice páteře, výhřezu meziobratlové ploténky. Dále se věnuje zobrazo-vacím modalitám, především výpočetní tomografii a magnetické rezonanci. V praktickéčásti práce je popsána segmentace obrazových dat a následně provedena. realizace tří zpublikovaných segmentačních metod.
|
|
|
X-ray computed tomography analysis of mouse embryonic heart
Dobrovodská, Daniela ; Oberta, Peter (oponent) ; Zikmund, Tomáš (vedoucí práce)
X-ray computed tomography is a versatile technique allowing non-destructive three-dimensional (3D) imaging. It is widely used in industry for metrology and material characterisation. Lately, it has found its importance also in biology and developmental science, where the 3D reconstructed data provide more comprehensive information about the sample than the conventional 2D imaging methods. Moreover, it can produce high-quality images of various biological samples. The obstacle in imaging biological samples might be a very similar attenuation coefficient of soft tissue, and therefore staining with chemical substance must be used. This thesis aims to use microcomputed tomography to visualise and qualitatively evaluate embryonic mouse hearts E17.5 and introduce the best staining protocol. Furthermore, the methodology for highlighting differences between wild type mice and mutant were introduced. Rigaku nano 3DX was used for the experiments with mouse heart interventricular septum, and after considering the specific setting of the device, the phase retrieval algorithm was applied. Finally, the validation of the $\mu$CT data was performed by comparing pictures from the confocal microscope.
|
|
|
Segmentace meziobratlové ploténky v obrazových datech
Meloun, Jan ; Nemček, Jakub (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Práce je zaměřena na segmentaci meziobratlových plotének v obrazových datech z dvou medicínských zobrazovacích modalit - výpočetní tomografie (CT) a zobrazovaní pomocí magnetické rezonance (MRI). Teoretický úvod práce se věnuje problematice výhřezu meziobratlové ploténky a popisu relevantních zobrazovacích modalit. Též je uveden teoretický popis základních a pokročilých segmentačních metod. V praktické části byly vybrány a implementovány tři různé segmentační metody (jedna pro CT data a dvě pro obrazy z MRI), které byli aplikovány na obrazy získané z Radiodiagnostického oddělení Nemocnice Havlíčkův Brod. Úspěšnost segmentace byla vyhodnocena kvantitativně porovnáním výsledků jednotlivých metod s manuálně vytvořenou referenční segmentací meziobratlových plotének.
|
|
|
Možnosti determinace povrchu objektů v tomografických datech
Kalasová, Dominika ; Novotný, Jan (oponent) ; Zikmund, Tomáš (vedoucí práce)
Práce se zabývá určováním povrchu objektů v tomografických datech. Tento proces je velmi důležitý pro následné zpracování - vizualizaci objektů, souřadnicová měření, export do formátu STL apod. Určování povrchu znesnadňují tomografické artefakty, pórovitost a nehomogenita materiálu a nekvalitní data. Práce popisuje možnosti determinace povrchu v programu VGStudio MAX 2.2 a demonstruje je na určení povrchu vzorku drátkobetonu.
|
|
| |
host ::
RSS.