|
|
Identification of horizontal genes transfer elements across strains inhabiting the same niche using pan-genome analysis
Schwarzerová, J. ; Čejková, D.
Tracing horizontal gene flux across strains in farm animals is one of the important steps for research focused on detection and genomic enzymology of genes conferring antibiotic resistance. In this study, we have built the comprehensive computational methodology for the detection of horizontal genes transfer elements via pan-genome analysis. In total, 133 anaerobes isolated from chicken gastrointestinal tract were examined for the presence of traits of horizontal transfer. The shared genes from all isolates, so called core genome genes were identified and characterised in order to assign the function to the gene within individual bacterial cell and within community of cells. This study provides an evidence that horizontal transmission frequently occurs not only between closely related bacteria, but also between distant taxonomical groups. Hence chickens are known primary reservoirs of antibiotic resistance genes, and the dissemination of these genes to other bacterial pathogens often leads to life-threatening infections, even within human population. Thus, the research on this subject, and the associated results are of a great importance for public health.
|
|
|
The impact of cannabidiol consumption on oral microbiome composition
Richweissová, Viktória ; Bartoň, Vojtěch (oponent) ; Čejková, Darina (vedoucí práce)
The composition of oral microbiome plays a significant role in maintaining both oral, and overall systemic health. When in equilibrium, the oral microbiome maintains the oral cavity in health. However, certain ecological shifts in the microbiota allow pathogens to manifest and cause various oral and systemic diseases. The analysis of the oral microbiome makes it possible to define the role of its components in health and disease, and the effect of various therapeutic techniques on its composition. This bachelor's thesis investigates the possible effect of toothpaste with cannabidiol on oral microbiome. The aim of this work is the bioinformatics analysis of oral microbiome communities before and after using CBD toothpaste using pipeline QIIME 2.
|
|
| |
|
| |
|
|
Peroxisomy a jejich úloha v energetickém metabolismu srdce.
Čejková, Denisa ; Kolář, David (vedoucí práce) ; Horníková, Daniela (oponent)
Peroxizomy jsou malé eukaryotické organely, známé zejména pro svou schopnost vytvářet a degradovat peroxid vodíku. Jejich enzymy však zastávají mnoho dalších významných funkcí, podílí se na beta-oxidaci mastných kyselin s velmi dlouhým nebo větveným řetězcem, prostřednictvím alfa-oxidace umožňují zpracování molekul, které nemohou být degradovány v beta-oxidačním cyklu, také se účastní počátečních kroků syntézy éterických lipidů nebo formování žlučových kyselin. Výše zmíněné aspekty činí peroxizomy potenciálně zajímavými pro jejich možný vliv na metabolismus srdce, který je založen především na oxidativním zpracování mastných kyselin, avšak dosud o této problematice není mnoho známo. Práce se zaměřuje jednak na vznik a funkce samotných peroxizomů, ale také srdeční metabolismus společně s možnou rolí peroxizomů v něm.
|
|
|
Uspokojování potřeb pacienta s chronickou obstrukční plicní chorobou
Čejková, Denisa ; Tomová, Šárka (vedoucí práce) ; Křivková, Jana (oponent)
Záměrem bakalářské bylo na základě průzkumného šetření zjistit, zda se potřeby pacientů s CHOPN mění v závislosti na stadiu onemocnění. Práce je rozdělená na teoretickou a empirickou část. Teoretická část je rozdělená do tří kapitol. První se zabývá charakteristikou CHOPN, její diagnostikou a následnou léčbou. Druhá pojednává o klasifikaci potřeb, motivech a důsledcích, které plynou pro pacienty z nedostatečného uspokojení potřeb. Třetí část se zaměřuje na specifika ošetřování pacientů s CHOPN. V empirické části jsou prezentovány výsledky kvantitativního průzkumu, který probíhal pomocí dotazníkového šetření. Dotazníky byly distribuovány hospitalizovaným pacientům s chronickou obstrukční plicní chorobou ve stadiu II, III a IV na Pneumologické klinice 2. LF UK a FN Motol. Průzkumné šetření probíhalo anonymně, od července do prosince 2017. Celkem bylo osloveno 76 pacientů, z nichž se šetření tři zúčastnit nechtěli. Z průzkumného šetření vyplynulo, že pacienti ve II. stadiu mají odlišně stanovené potřeby, než pacienti ve stadiu III a IV. U respondentů ve II. stadiu byla zjištěna na prvním místě potřeba lásky, 100% z nich ji uvedlo jako potřebu důležitou. U pacientů ve III. stadiu jsou na prvním místě zachovány fyziologické potřeby, potřebu kyslíku uvedlo 100% respondentů, dále byly jako důležité stanoveny...
|
|
| |
host ::
RSS.