Název: Enzymová syntéza hypermodifikovaných DNA nesoucích aniontové nebo kationtové funkční skupiny
Překlad názvu: Enzymatic synthesis of hypermodified DNA bearing anionic or cationic functional groups
Autoři: Kuprikova, Natalia ; Hocek, Michal (vedoucí práce) ; Míšek, Jiří (oponent) ; Urban, Milan (oponent)
Typ dokumentu: Disertační práce
Rok: 2025
Jazyk: eng
Abstrakt: SOUHRN Tato disertační práce popisuje syntézu dvou sad na bázi modifikovaných 2'-deoxyribonukleosid-5'-O-trifosfátů (dNR TP) nesoucích nabité funkční skupiny, jejich aplikaci v enzymatické syntéze k získání různých typů hypermodifikovaných DNA a následné biofyzikální studie získaných DNA forem. Dvě sady dNR TP, obsahující buď aniontové nebo kationtové modifikace, byly syntetizovány pomocí Sonogashirovy reakce. Aniontové (kyselé) skupiny zahrnovaly karboxylát, sulfonát, fosfonát a fosfát, zatímco kationtové (zásadité) modifikace tvořily amino, methylamino, dimethylamino a trimethylamonium skupiny. Získané dNR TP byly systematicky testovány jako substráty pro enzymatickou syntézu DNA pomocí dvou DNA polymeráz. Všechny aniontově i kationtově modifikované nukleotidy byly úspěšně začleněny do DNA metodou prodloužení primeru (PEX), a to jak jednotlivě, tak v různých kombinacích. Navíc bylo možné nahradit všechny čtyři kanonické nukleotidy v PEXu buď aniontovými, nebo kationtovými dNR TP, což vedlo k syntéze hypermodifikovaných DNA sond, kde každá nukleobáze nese odlišnou funkční skupinu. DNA nesoucí všechny čtyři aniontové modifikace byla pojmenována 'superaniontová DNA', díky dvojnásobnému zápornému náboji ve srovnání s přirozenou DNA. Naopak pro hypermodifikovanou DNA obsahující celou škálu kationtových skupin...
Klíčová slova: DNA; nukleotidy; DNA; nucleosides

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/199229

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-684649