Název:
Narušení metabolismu proteinů a jeho efekt na růst rostlin
Autoři:
Luklová, Markéta Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2016
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Studie signálních drah rostlinných hormonů posledních let prokázaly zásadní roli degradace regulačních proteinů těchto drah prostřednictvím ubikvitin-proteazomového systému (UPS). Inhibice tohoto systému má tudíž významný vliv na růst a vývoj rostlin. Tato práce s názvem Narušení metabolismu proteinů a jeho vliv na růst rostlin shrnuje známe informace o mechanismech degradace proteinů proteazomem a blíže rozebírá jeho roli v signální dráze fytohormonu cytokininu. Experimentální část byla rozdělena do dvou částí (i) analýza růstových změn rostlin a (ii) analýzu diurnálních variací semen transgenní linie Arabidopsis RV 86-5, která je nositelkou inducibilního genu pro expresi varianty ubikvitinu zabraňující degradaci zprostředkovanou UPS, pomocí LC-MS profilování. Získané výsledky naznačují, že složitá rovnováha mezi UPS a hladinou cytokininů ovlivňuje cytokininovou signální dráhu a tím i odpověď organismu na jejich působení. Pomocí LC-MS profilování proteomu bylo identifikováno >4,000 proteinů, z nichž 61 bylo na základě předešlých analýz blíže sledováno.Recent years have shown that plant hormones operate through circuits in which targeted, conditional turnover of regulator proteins via proteasome are of critical importance. Thus, a disruption of the ubiquitin-proteasome system (UPS) would have a significant impact on plant growth and development. This thesis entitled Protein metabolism disruption and its effect on plant growth reviews the mechanisms of proteasome-mediated targeted degradation and analyzes its role in plant hormone cytokinin signaling. The experimental part is divided into two sections (i) growth response analyzes and (ii) an LC-MS profiling of diurnal variations in transgenic Arabidopsis seedlings RV 86-5 carrying modified inducible ubiquitin that prevents protein degradation via the UPS. The results present evidence that an intricate balance between the UPS and cytokinin modulates the growth response output of cytokinin signaling. On the proteome level, an LC-MS profiling identified >4,000 proteins, 61 of which were previously identified in response to proteasome inhibition.
Klíčová slova:
cytokininy; degradace proteinů; hmotnostní spektrometrie; ubikvitin-proteazomový systém