Název:
Studium genetické diverzity planého hrachu
Autoři:
Trněný, Oldřich Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2014
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Rod hrách (Pisum) je rozdělen do tří druhů Pisum sativum, P. fulvum a P. abyssinicum, kdežto mezi plané formy řadíme P. sativum ssp. elatius, P. fulvum a P abyssinicum. Genetická diverzita planých druhů byla tvořena v průběhu evolučního vývoje v jejich přirozeném místě výskytu. Protože kulturní hrách je důležitá plodina, která byla v minulosti domestifikována právě z planých druhů rodu Pisum, je hodnota informací o struktuře genetické diverzity planých druhů vysoká, s ohledem na potenciální využití planých druhů jako donorů genů plasticity a rezistence při procesu šlechtění kulturního hrachu. Součástí této bakalářské práce je kromě souhrnu informací o planých druzích hrachu a o využití molekulárních markerů při studiu variability rostlin také studie genetické diverzity metodou RBIP (Retrotransposon Based Insert Polymorphysm) souboru 50 položek složeného z druhů P. abyssinicum a P. fulvum a získaných z genofondových kolekcí hrachu. Z tohoto souboru bylo dále vybráno 12 položek, na kterých byla provedena analýza DNA sekvenčních dat jaderné oblasti ITS a chloroplastových oblastí trnSG a matK. Výsledky všech provedených analýz v kontextu již dříve zjištěných informací nám znázornili genetickou diverzitu druhů P. fulvum a P. abyssinicum.The genus pea (Pisum) is divided into three species Pisum sativum, P. fulvum and P. abyssinicum, while we sort P. sativum ssp. elatius, P. fulvum and P abyssinicum into group of wild type. Genetic diversity of wild species was formed in their natural habitat during the event of evolution. Pea is an important crop that was domesticated from the wild species of the genus Pisum in the past. We can use wild species potentially as donors of genes of resistance and plasticity in the process of peas breeding. Hence the value of the information about the structure of the genetic diversity of wild species is quite high. The literary part of this work is focused to the summary information about the wild pea and application of molecular markers in the study of variability of plants. The research part of this work is aimed to study of genetic diversity on set of 50 accessions ,which are composed of the species P. abyssinicum and P. fulvum, by RBIP (Retrotransposon Based Insert Polymorphysm) method. Furthermore, 12 selected accessions were sequenced in nuclear region ITS and chloroplast region matK and trnSG. In context of others studies our results of all analyzes illustrate the genetic diversity of the species P. fulvum and P. abyssinicum.
Klíčová slova:
analýza sekvencí DNA; ITS; matK; Pisum; Pisum abyssinicum; Pisum fulvum; RBIP; retrotransposon; trnSG