host ::
| Hlavní stránka > Konferenční materiály > Příspěvky z konference > Py/ExplorReg: Exploration of Transcriptome for Potential Regulon Structure Detection |
Název:
Py/ExplorReg: Exploration of Transcriptome for Potential Regulon Structure Detection
Autoři: Janigová, Patrícia ; Weckwerth, Wolfram ; Schwarzerová, Jana
Typ dokumentu: Příspěvky z konference
Jazyk: eng
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: This study introduces Py/ExplorReg, a tool designed for exploring transcriptomic landscapes and identifying potential regulon structures, with a particular focus on its utility in the context of Arabidopsis thaliana research. Developed using Python, Py/ExplorReg demonstrates its effectiveness in identifying potential regulons through a pioneering approach rooted in the analysis of gene expression data. Leveraging publicly available datasets from the EMBL-EBI project PRJNA779072, this case study highlights its adaptability to Arabidopsis thaliana datasets.
Klíčová slova: Arabidopsis thaliana; Gene expression analysis; Regulon; Transcription units
Zdrojový dokument: Proceedings I of the 30st Conference STUDENT EEICT 2024: General papers, ISBN 978-80-214-6231-1, ISSN 2788-1334
Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: https://hdl.handle.net/11012/249245
Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-622511
Autoři: Janigová, Patrícia ; Weckwerth, Wolfram ; Schwarzerová, Jana
Typ dokumentu: Příspěvky z konference
Jazyk: eng
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: This study introduces Py/ExplorReg, a tool designed for exploring transcriptomic landscapes and identifying potential regulon structures, with a particular focus on its utility in the context of Arabidopsis thaliana research. Developed using Python, Py/ExplorReg demonstrates its effectiveness in identifying potential regulons through a pioneering approach rooted in the analysis of gene expression data. Leveraging publicly available datasets from the EMBL-EBI project PRJNA779072, this case study highlights its adaptability to Arabidopsis thaliana datasets.
Klíčová slova: Arabidopsis thaliana; Gene expression analysis; Regulon; Transcription units
Zdrojový dokument: Proceedings I of the 30st Conference STUDENT EEICT 2024: General papers, ISBN 978-80-214-6231-1, ISSN 2788-1334
Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: https://hdl.handle.net/11012/249245
Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-622511
Záznam vytvořen dne 2024-07-21, naposledy upraven 2024-07-21.