Název: Predikce vlivu mutací na stabilitu proteinů
Překlad názvu: Prediction of the effect of mutations on protein stability
Autoři: Rosinská, Monika ; Martínek, Tomáš (oponent) ; Musil, Miloš (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2024
Jazyk: eng
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstrakt: [eng] [cze]
Cílem této práce bylo vytvořit klasifikační model, který dokáže rozlišovat mutace proteinu jako stabilizující či destabilizující. Model byl implementován pomocí konvolučních neuronových sítí s využitím předtrénované sítě ResNet50V2 a datové sady založené na FireProtDB. Model dokáže predikovat vliv mutací na stabilitu proteinu s přesností 0.7 a zároveň poskytuje informaci o míře jistoty dané predikce. The aim of this thesis is to develop a classification model for protein mutations, distinguishing between stabilizing and destabilizing variants. The model was implemented using a convolutional neural network architecture, utilising the ResNet50V2 pre-trained neural network and a dataset sourced from FireProtDB. With an accuracy of 0.7, the model effectively predicts the impact of mutations on protein stability. Furthemore, it can provide a confidence measure for its predictions.
Klíčová slova: convolutional neural network; machine learning; protein engeneering; protein mutant stability prediction; protein stability; single-point mutation; jednobodová mutace; konvoluční neuronové sítě; machine learning; predikce stability mutovaného proteinu; proteinové inženýrství; stabilita proteinu

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: https://hdl.handle.net/11012/248559

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-619788


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce