Název: Využití hybridního mapování pro stanovení přítomnosti plazmidů v NGS datech
Překlad názvu: Hybrid mapping for plasmid content determination in NGS data
Autoři: Pražáková, Martina ; Vítková, Helena (oponent) ; Nykrýnová, Markéta (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2024
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Tato bakalářská práce se zabývá využitím hybridního mapování pro stanovení přítomnosti plazmidů v NGS datech. Začátek práce je věnován teorii, nejprve jsou popsány jednotlivé sekvenační technologie s větším zaměřením na platformu Illumina a sekvenování nanopórem. Dále jsou pak uvedeny způsoby skládání sekvencí a seznámení s bakteriálním genomem. V druhé části práce je postup zpracování nanopórových dat a návrh postupu pro stanovení přítomnosti plazmidů v NGS datech s jeho následovnou realizací. This bachelor's thesis is focused on hybrid mapping for determining the presence of plasmids in NGS data. The beginning of the thesis is dedicated to theory, firstly, various sequencing technologies are described, with a greater emphasis on the Illumina platform and nanopore sequencing. Next, methods for assembling sequences and bacterial genome are explained. In the second part of the thesis, the process of processing nanopore data is outlined, along with the proposal of a procedure for determining the presence of plasmids in NGD data and it's implementation .
Klíčová slova: bakteriální genom; hybridní mapování; Klebsiella pneumoniae; plazmid; sekvenování; bacterial genom; hybrid mapping; Klebsiella pneumoniae; plasmid; sequencing

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: https://hdl.handle.net/11012/247401

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-619268


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce