Original title: Charakterizace karotenogenních kvasinek pomocí molekulárních technik
Translated title: Characterization of carotenogenic yeasts using molecular techniques
Authors: Kostovová, Iveta ; Čarnecká, Martina (referee) ; Márová, Ivana (advisor)
Document type: Master’s theses
Year: 2013
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstract: [cze] [eng]
Cílem předložené diplomové práce byla charakterizace karotenogenních kvasinek pomocí molekulárních technik. K tomuto účelu byly amplifikovány mezidruhově variabilní a přitom konzervované sekvence genomové DNA, a to konkrétně oblasti rDNA D1/D2 velké ribosomální podjednotky a úseky ITS1 a 5,8-ITS2 rDNA. Tyto sekvence byly podrobeny analýze metodou DGGE, která prokázala odlišnost kmene S. roseus ve všech analyzovaných úsecích rDNA od ostatních kmenů karotenogenních kvasinek. Ke karyotypové charakterizaci kvasinek byla optimalizována metoda PFGE, a to jak izolace intaktní DNA, tak parametry PFGE. Celkem bylo analyzováno devět kmenů karotenogenních kvasinek rodů Rhodotorula, Sporobolomyces, Cystofilobasidium a Phaffia. Součástí diplomové práce byla také aplikace molekulárních metod k molekulární analýze úseků D1/D2 u mutantních kmenů karotenogenních kvasinek. Tyto kmeny byly adaptovány na odpadní substráty, jakými byly těstoviny a glycerol a v této práci byla ověřena stabilita jejich produkčních vlastností. The aim of this master’s thesis was focused on characterization of carotenogenic yeast using molecular techniques. For this usage, interspecific variables of strongly conserved sequences of genomic DNA, especially rDNA D1/D2 large ribosomal subunit and ITS1 and 5,8-ITS2 rDNA regions were amplified. These sequences were subjected analysed by DGGE method, which approved differences of S. roseus in all analyzed rDNA sequencies compared to the other analyzed carotenogenic yeasts. Parameters of PFGE and isolation procedure of the intact DNA were optimized for caryotypic yeast characterization. At all, nine of carotenogenic yeast strains Rhodotorula, Sporobolomy-ces, Cystofilobasidium a Phaffia were analyzed by this techniques. Further part of this thesis was focused to application of molecular methods to analysis of region D1/D2 of large ribosomal subunit in mutant carotenogenic yeast strains. Mutant strains were pre-viously adapted to waste substrates - pasta and glycerol, and stability of their production properties was verified.
Keywords: Carotenogenic yeast; DGGE; Karyotipic charac-terization; Molecular technics; PCR; PFGE; DGGE; Karotenogenní kvasinka; karyoty-pová charakterizace; molekulární charakterizace; PCR; PFGE

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/25488

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-603100


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Master’s theses