Original title: Vysoce propustný systém pro analýzu organoidů v biomedicínských aplikacích
Translated title: High-throughput organoid analysis platform for biomedical applications
Authors: Roček, Vojtěch ; Chmelíková, Larisa (referee) ; Janoušek, Oto (advisor)
Document type: Master’s theses
Year: 2019
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
V posledních letech se dostává do popředí zájmu využití tzv. 3D kultur a organoidů jako modelových systémů pro translační a preklinický výzkum, zejména pro potřeby testování nových druhů léčiv. Standartní přístupy studia zahrnují jak invazivní přístupy biochemické či molekulárně biologické analýzy, tak i neinvazivní metody optické. Mezi základní optické metody, užívané ke studiu organoidů patří zejména různé mikroskopické techniky, které poskytují detailní informace o struktuře, ale jsou náročné časově i na experimentální vybavení. Pro rozsáhlejší studie by byl výhodný systém automatické analýzy, umožňující testování velkého počtu vzorků. Tato práce je zaměřena na vývoj zařízení pro vysoce propustnou automatickou analýzu organoidních struktur na bázi mikrotitračních destiček pro biomedicínské aplikace. Je provedena literární rešerše neinvazivních optických metod, vhodných pro analýzu 3D buněčných kultur a organoidů. Jsou diskutovány nutné úpravy existující platformy na fenotypizaci řas. Dále pak je navržen experiment za účelem otestování funkčnosti takto upraveného systému. Praktické využití v klinické praxi je otestováno navrženým experimentem reakce sferoidů na vybraná cytostatika. V diskuzi jsou rozebrány dosažené výsledky a poznatky celé práce jsou shrnuty v závěru. Nowadays, the organoids structures has become more popular as suitable model systems for clinical research, particularly for development of new medication and drug screening. The standard study approaches include invazive biochemical or molecular-biology analysis as well as non-invasive optical approaches. Among optical methods, various microscopy techniques can give a very detailed information about the structure of organoids. However, the microscopy is time consuming as well as it puts a great demand on instrumentation. Therefore, the microscopy is not suitable for high content analysis of multiple samples. This work is focused on the development of the device and experimental technique for high-throughput screenings of organoids structures for biomedical applications based on microtitrate plates. Literatre search for non-invasive optical methods, suitable for analysis of organoid structures. The necessary adjustements of existing system for algae phenotypization are discussed. An experiment was made to test functionality of designed system. Practical use for clinical use is tested by the experiment of spheroids reaction to selected cytostatics. The results and findings are discussed in the conclusion.
Keywords: FluorCam; High – throughput screening; mCherry; Microtier plate; Organoid; Phenotypization; Fenotypizace; FluorCam; mCherry; Mikrotitrační destičky; Organoid; Vysoce propustný screening

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/177659

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-589469


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Master’s theses