Original title: Kompenzace geometrického zkreslení obrazu gelové elektroforézy
Translated title: Compensation of geometric distortion of electrophoretic gel image
Authors: Dvořáček, Tomáš ; Vítek, Martin (referee) ; Škutková, Helena (advisor)
Document type: Master’s theses
Year: 2015
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Tato diplomová práce se zabývá problematikou vzniku a kompenzace geometrických zkreslení u 1D elektroforézy na agarózovém gelu. Diplomová práce rozebírá problematiku příčin vzniku těchto deformací a shrnuje teorii, nutnou k jejich kompenzaci. Na základě takto získané teorie a vytvořených elektroforetických fantomů, obsahuje práce několik návrhů algoritmů pro kompenzaci vzniklých deformací. Tyto návrhy jsou dále přetvořeny do funkcí, které jsou spojeny do funkčního uživatelského rozhraní, sloužící k analýze obrazu gelu a pro kompenzaci geometrických deformací. This master thesis is engaged in problematics of creation and compensation of geometric distortions in 1D agarose electrophoresis. This master thesis analyze the problematics of cause of these distortions and summarize the theory needed for compensation of these distortions. Based on acquired theory and created electrophoretic phantoms, the master thesis contains several suggestions for compensation of incurred distortions. These suggestions are recreated into functions, which are connected into a functional user interface for gel image analysis and geometric distortions compensation.
Keywords: 1D; agarose; air bubbles in gel; algorithm; band; compensation.; contrast; deformation; distortion; Electrophoresis; fragment; gel; geometric; isolated pixel; ladder; noise; smile effect; 1D; agaróza; algoritmy; band; deformace; Elektroforéza; fragment; gel; geometrická; izolovaný pixel; kompenzace.; kontrast; smile efekt; velikostní marker; vzduchové bubliny v gelu; zkreslení; šum

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/38944

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-589048


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Master’s theses