Original title: Měření konformačních vlastností nukleových kyselin
Translated title: Measuring of conformational properties of nucleic acids
Authors: Hrazdilová, Ivana ; Renčiuk,, Daniel (referee) ; Maděránková, Denisa (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2011
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Tato bakalářská práce se zabývá charakteristikou nejvýznamějších konformací nukleových kyselin. Kromě klasické B-DNA šroubovice popisuje i alternativní konformace A-DNA, Z-DNA, triplexu, nebo také guaninového, či cytozinového kvadruplexu. Dále je zde uveden přehled nejrozšířenějších metod používaných pro určení konkrétní konformace. Mezi metody uvedené v práci patří nukleární magnetická rezonance (NMR), metoda cirkulárního dichroismu (CD), rentgenová krystalografie, výpočetní metody, absorpční spektrofotometrie a její využití při analýze křivek tání. V prostředí MATLAB byl vytvořen algoritmus s grafickým uživatelským rozhraním pro analýzu křivek tání, který uživateli poskytuje termodynamické parametry, jako je mezní teplota a entalpie, určující stabilitu zkoumaného vzorku. This thesis gives a brief characteristic of the most important conformations of nucleic acids. It describes alternative conformations that are different from canonical B-DNA helix, such as A-DNA, Z-DNA, triplex structures, or guanine and cytozin quadruplex structures. In the next part it presents most common methods used for determing secondary structure of nucleic acids, which are nuclear magnetic resonance (NMR), measurement of circular dichroism (CD), X-ray diffraction, computational methods, measurements of ultraviolet absorbance and its utilization for analysis of thermal melting curves. In MATLAB was created algorithm with graphical user interface, which analyze melting curves and graphically computes thermodynamic parameters, which are melting temperature and transition enthalpy, which defines stability of examined sample.
Keywords: conformance stability; conformation; DNA; DNA denaturation; enthaply; melting temperature; quadruplex structure; secondary structure; triplex structure; ultraviolet absorbance spectra; wavelength; denaturace DNA; DNA; entalpie; konformace; kvadruplex; křivka tání; mezní teplota; sekundární struktura; stabilita konformace; triplex; UV absorpční spektrum; vlnová délka

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/2024

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-586645


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses