Název:
Analýza dat z DNA čipů
Překlad názvu:
Microarray Data Analysis
Autoři:
Vogel, Ivan ; Smrž, Pavel (oponent) ; Šilhavá, Jana (vedoucí práce) Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2008
Jazyk:
cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstrakt: [cze][eng]
Cieľom tejto bakalárskej práce je popísať technológiu a analýzu komplementárnych DNA čipov. Predstavené sú niektoré algoritmy využívané pri analýze. Podrobnejšie sa venuje problematike zhlukovania dát, predovšetkým rozoberá varianty hierarchického zhlukovania. Ďalej predstavuje prehľad dostupného komerčného aj nekomerčného softvéru z tejto oblasti. Zahŕňa návrh vlastnej implementácie hierarchických metód. V závere sú porovnané výsledky s podobným nekomerčným softvérom.
The aim of this bachelor thesis is to describe the DNA microarray technology. Several analytical algorithms are discussed. It describes closely the clustering methods, especially several hierarchical clustering modifications. It gives a summary of available commercial and uncommercial software for microarray analysis. The thesis describes own implementation design of hierarchical methods. At the end, results are compared with similar uncommercial software.
Klíčová slova:
dendrogram; DNA čip; hybridizácia; korelačný koeficient; matica podobností; zhlukovanie; clustering; correlation coefficient; dendrogram; DNA microarray; hybridisation; similarity matrix
Instituce: Vysoké učení technické v Brně
(web)
Informace o dostupnosti dokumentu:
Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT. Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/55365