Original title: Softwarové řešení systému FLIM s využitím pulsního laditelného laseru v konfokální mikroskopii
Translated title: Software FLIM system with pulse white light laser in confocal microscopy
Authors: Grund, Pavel ; Odstrčilík, Jan (referee) ; Čmiel, Vratislav (advisor)
Document type: Master’s theses
Year: 2015
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Teoretická část této diplomové práce je zaměřena na rešerši konfokální mikroskopie a na metodu FLIM. Rozvádí principy a druhy konfokální mikroskopie a využití širokospektrálního laseru, jakožto základního zdroje světla u těchto mikroskopů. Přiblíží, co je to metoda FLIM a její využití nejen v buněčné biologii. Praktická část diplomové práce zahrnuje pořízení tří sad fluorescenčních intenzitních snímků s využitím aplikace pulsního laditelného laseru, funkce TimeGate a detekce hybridními detektory. Pro praktické zpracování této diplomové práce je v softwarovém prostředí Fiji vytvořen plugin, což je zdrojový kód v programovacím jazyku Java. Typy pluginů a jejich použití jsou popsány ve třetí kapitole práce. Tento plugin včetně grafického uživatelského prostředí ve formě dialogového okna zpracovává fluorescenční intenzitní snímky a vytváří z nich grafickou reprezentaci dat znázorňující dobu života fluorescence, tzv. pseudobarevnou mapu. The theoretical part of this master's thesis is focused on research of confocal microscopy and FLIM method. There are a principles and types of confocal microscopy and the use of broad-spectrum laser as a basic light source of these microscopes. It gives what the FLIM method and its use not only in cell biology. The practical part thesis includes the acquisition of three sets of fluorescence intensity images with use of applications tunable pulsed laser, function TimeGate and detection of hybrid detectors. For practical elaboration of this thesis is in the software Fiji created a plugin, which is the source code in the Java programming language. The types of plugins and their uses are described in the third chapter of the thesis. This plugin including the graphical user interface in the form of the dialog box, proceses the fluorescence intensity images and creates a graphical representation of data showing the fluorescence lifetime, so called pseudocolor map.
Keywords: broad-spectrum laser; confocal microscopy; Fiji; FLIM; fluorescence; ImageJ; plugin; white light laser; bílý laser; Fiji; FLIM; fluorescence; ImageJ; konfokální mikroskopie; plugin; širokospektrální laser

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/38976

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-567504


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Master’s theses