Název: Evoluční strategie v úloze anotace funkce nukleotidového polymorfismu
Překlad názvu: Functional Annotation of Nucleotide Polymorphism Using Evolution Strategy
Autoři: Šalanda, Ondřej ; Martínek, Tomáš (oponent) ; Bendl, Jaroslav (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2013
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Tato práce prezentuje nový přístup k predikci vlivu nukleotidového polymorfismu na funkci proteinu. Cílem je vytvořit nový metanástroj, který pomocí váhového konsensu kombinuje vlastnosti osmi již existujících nástrojů za účelem zvýšení přesnosti a univerzálnosti predikce. K nalezení vhodného rozložení vah je přistoupeno inovativně, používá se evoluční strategie. Parametry pro její spuštění jsou zjištěny experimentálně. Na závěr je uvedeno zhodnocení úspěšnosti nového nástroje a porovnání výsledků na testovacích sadách. This thesis brings a new approach to the prediction of the the effect of amino acid substitution. The main goal is to create a new meta-tool, which combines evaluations of eight already implemented prediction tools. The use of weighted consensus over those tools should lead to better accuracy and versatility of prediction. The novelty of developed tool lies in involving evolution strategy with experimentally defined parameters as a way to determine the best weight distribution. At the end, a complex comparison and evaluation of results is given.
Klíčová slova: evoluční strategie; jednoduchý nukleotidový polymorfismus; mutace; Protein; váhový konsensus.; evolution strategy; mutation; Protein; simple nucleotide polymorphism; weighted consensus.

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/54995

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-566445


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce