Original title: Webový server pro predikci sekundární struktury proteinů
Translated title: Web Server for Protein Secondary Structure Prediction
Authors: Villem, Lukáš ; Očenášek, Pavel (referee) ; Burgetová, Ivana (advisor)
Document type: Master’s theses
Year: 2013
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Tento diplomový projekt se zabývá problematikou predikce sekundární struktury proteinů. Po teoretickém úvodu následuje studie dostupných nástrojů, návrh a implementace webové aplikace, která kombinuje funkcionalitu několika webových nástrojů pro predikci sekundární struktury. Uživatel má možnost volit si počet využitých metod a vložit vybranou sekvenci jako prostý text nebo jako soubor ve standardním formátu. Získáním výsledků z vybraných nástrojů lze data konvertovat na unifikovaný formát, výsledek zobrazit uživateli a nad daty vytvořit vlastní predikci. Výsledná aplikace je testována a vliv jednotlivých nástrojů je upraven s cílem zvýšit úspešnost predikce. Výstupem aplikace je výsledek predikce, který je opět k dispozici jako text nebo soubor ke stažení. This master’s thesis deals with protein secondary structure prediction. There is a theoretical introduction followed by study of available tools, proposal and implementation of web application, which combines functionality of several web tools used to predict secondary structure. User is asked to choose prediction methods and insert input sequence as plain text or upload a file. Results collected from selected tools serve to convert data into common format, show the result and create new type of prediction. Finally, the testing is applied and influences of tools are adjusted in order to increase percentage of prediction. The output of application is a result of prediction also available as plain text or as a file.
Keywords: prediction; prediction methods; Proteins; secondary structure; structural state; tool; web application; web services.; metody predikce; nástroj; predikce; Proteiny; sekundární struktura; strukturální stav; webová aplikace; webové služby.

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/53402

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-555354


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Master’s theses