Název: Software pro zobrazování molekulárních struktur
Překlad názvu: Software for visualization of molecular structures
Autoři: KROHOVÁ, Lucie
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2011
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Bakalářská práce je zaměřena na vizualizaci a úpravu molekulárních struktur. Cílem práce je seznámení se s prací v programech sloužících pro zobrazování molekulárních struktur, vyřešení několika modelových úloh v těchto aplikacích a následné zhodnocení jednotlivých programů, jejich možností, jednoduchosti ovládání a doporučení vhodných programů k řešení konkrétních úkolů. V první kapitole předkládám úvod do vizualizace molekul, tzn. popisuji přechod od fyzických modelů k dnešním softwarovým aplikacím pro zobrazování molekulárních struktur. Dále se zabývám formáty souborů, pro ukládání molekulárních struktur. Třetí kapitola je věnována popisu funkcí komerčního programu DS ViewerPro 5.0 a volně šiřitelných aplikací DS Visualuzer 3.0, Visual Molecular Dynamics (VMD) a Rasmol. Čtvrtá kapitola obsahuje vyřešení několika modelových úloh. V závěrečných kapitolách jsem jednotlivé programy porovnala. Tato práce by mohla sloužit k rychlému seznámení s prohlížeči a pomoci při výběru programu pro konkrétní úlohy. The thesis is focused on visualization and modification of molecular structures. The aim is to get familiar with the work with software that are used for the molecular structures imaging, solving several model problems in those applications and subsequent evaluation of individual programs, their options, ease of use and recommendation of appropriate solutions to specific tasks. The first chapter presents an introduction to the visualization of molecules, ie. describes the transition from physical models to today's software applications for imaging molecular structures. The other chapter deals with the file formats for storing molecular structures. The third chapter describes the functions of commercial program ViewerPro DS 5.0 and open source applications Visualizer DS 3.0, Visual Molecular Dynamics (VMD) and Rasmol. The fourth chapter contains several model problems solving. In the final chapter I compare the different programs. This work could serve to quickly familiarize with the browser and help in selecting the program for specific tasks.
Klíčová slova: Discovery Studio; DS ViewerPro; DS Visualizer; Rasmol; Software; VMD; Discovery Studio; DS ViewerPro; DS Visualizer; Rasmol; Software; VMD
Citace: KROHOVÁ, Lucie. Software pro zobrazování molekulárních struktur. České Budějovice, 2011. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Zdravotně sociální fakulta

Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU.
Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/15940

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-55281


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce