Original title:
Metody predikce aktivních míst v proteinech
Translated title:
Prediction methods of protein hot spots
Authors:
Duras, Jan ; Provazník, Ivo (referee) ; Maděránková, Denisa (advisor) Document type: Master’s theses
Year:
2012
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Diplomová práce se zabývá metodami vyhledávání aktivních míst v proteinech. V teoretické části je popsáno složení proteinových rozhraní jako i aktivních míst. Jsou zde uvedeny základní principy vyhledávání aktivních míst. V praktické části je vybraná metoda, využívající S-Transformaci, navržena do pseudokódu a následně implementována do programového prostředí Matlab. Program je po té ověřen na souboru vybraných dat a porovnán s dostupnými metodami.
This master's thesis deals with prediction of hot spots in proteins. The theorethical part describes compositions of proteins interfaces and hot spots. There are mentioned basic principles of hot spots prediction. In the practical part is selected method, using the S-Transform, designed to pseudocode and then implmented to Matlab software. Created program is tested on a sample of data and compared with available methods.
Keywords:
EIIP; hot spots; inerface; interaction; Protein; S-Transfom; aktivní místo; EIIP; interakce; Protein; rozhraní; S-Transformace
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/4777