Original title: Komplexní přístup k pochopení nových zoonotických patogenů z komplexu Trichophyton benhamiae
Translated title: One Health approach to understand emerging zoonotic pathogens in the Trichophyton benhamiae complex
Authors: Čmoková, Adéla ; Hubka, Vít (advisor) ; Buchta, Vladimír (referee) ; Gené, Josepa (referee)
Document type: Doctoral theses
Year: 2024
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
The Trichophyton benhamiae complex encompasses several zoonotic pathogens that are of increasing concern to the scientific community due to their epidemic spread among pets and their owners. Of particular concern is the sudden appearance and rapid spread of T. benhamiae yellow phenotype strains in Europe. Considerable genetic and phenotypic variability has been revealed in the pathogens from the complex, yet the species limits and host spectra have not been clearly elucidated. To explore the diversity, epidemiology, and taxonomy of the T. benhamiae complex, my colleagues and I formed an international, cross-disciplinary team and applied a holistic One Health approach. We collected a large dataset of strains from several continents, along with associated data about host, clinical picture, and locality. Due to the high level of clonality in commonly used DNA sequence markers, I developed a new typing schema based on ten microsatellite markers and four DNA sequence markers. We then used a polyphasic approach combining data from independent analyses to decide on species limits in the T. benhamiae complex, including phylogenetic and population-genetic analyses, phenotypic and physiological analyses, mating-type gene characterization, ecological data and MALDI- TOF mass spectrometry analysis. Thanks to... Komplex druhů Trichophyton benhamiae zahrnuje několik zoonotických patogenů, které vědeckou komunitu stále více znepokojují kvůli svému epidemickému šíření mezi domácími zvířaty a jejich majiteli. Zvláštní obavy vzbuzuje náhlé objevení a rychlé šíření kmenů se žlutým fenotypem druhu T. benhamiae v Evropě. U patogenů z tohoto komplexu byla zjištěna značná genetická a fenotypová variabilita, avšak druhové hranice a hostitelské spektrum nebyly dosud jasně objasněny. Abychom prozkoumali rozmanitost, epidemiologii a taxonomii komplexu T. benhamiae, vytvořili jsme s kolegy mezinárodní mezioborový tým a uplatnili holistický "One Health" přístup. Shromáždili jsme rozsáhlý set kmenů z několika kontinentů spolu se souvisejícími údaji o hostitelích, klinickém obrazu a lokalitě. Vzhledem k vysoké míře klonality u běžně používaných DNA markerů jsem vyvinula nové typizační schéma založené na deseti mikrosatelitních a čtyřech sekvenčních markerech. Pro zjištění druhových hranic v komplexu T. benhamiae jsme využili polyfázický přístup, ve kterém jsme zohlednili data z fylogenetických, a populačně-genetických, fenotypových a fyziologických analýz spolu s charakterizací příslušnosti k jedné ze dvou křížících idiomorf a s ekologickými údaji. Díky našemu přístupu se nám podařilo uvnitř komplexu popsat čtyři nové...
Keywords: antifungal susceptibility; clonality; dermatophytosis; diversity; epidemiology; fungal pathogens; population genetics; taxonomy; Trichophyton; zoonotic infections; zoophilic dermatophytes; citlivost k antimykotikům; dermatofytózy; diverzita; epidemiologie; houboví patogeni; klonalita; populační genetika; taxonomie; Trichophyton; zoofilní dermatofyty; zoonotické infekce

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/187805

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-540699


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses