Original title: Zkoumání velikosti genomu, karyotypu a ploidie v rámci rodu Monocercomonoides
Translated title: Investigation of the genome sizes, karyotype and ploidy within the genus Monocercomonoides
Authors: Kornalíková, Martina ; Hampl, Vladimír (advisor) ; Čepička, Ivan (referee)
Document type: Rigorous theses
Year: 2023
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Oxymonády jsou skupinou anaerobních bičíkatých protist, žijících převážně ve střevech hmyzu a obratlovců. V této práci zkoumáme ploidii a karyotyp různých kmenů Monocercomonoides pomocí Fluorescence in situ Hybridization (FISH). Pro analýzy ploidie jsme použili próby proti genu SufDSU, o kterém je známo, že je přítomen v jediné kopii v genomu M. exilis. Pro vyšetření karyotypu jsme použili FISH próby proti sekvenci telomerické repetice TTAGGG. Výsledky ukázaly, že všechny zkoumané kmeny jsou haploidní s jediným jasným signálem z našich prób proti SufDSU. Analýzy karyotypu ukázaly, že průměrný počet signálů na jádro se u většiny zkoumaných kmenů pohyboval mezi 9 až 17, což ukazuje na počet chromozomů podobných M. exilis. Pozoruhodnou výjimkou jsou kmeny M. mercovicensis, kde jsme pozorovali mnohem vyšší počet signálů, což naznačuje mnohem vyšší počet chromozomů. Pro odhad obsahu DNA v jádrech těchto oxymonád jsme použili průtokovou cytometrii s M. exilis jako standard. Naše výsledky ukazují, že dva ze zkoumaných kmenů, Monocercomonoides sp. kmeny OEV a Mural1 mají menší velikost genomu než M. exilis, zatímco ostatní kmeny mají velikost genomu větší než M. exilis. Pozorovali jsme neobvykle velkou variabilitu velikostí genomu v rámci rodu Monocercomonoides, která se nezdá být způsobena změnami v... Oxymonads are a group of anaerobic flagellated protists living mainly in the gut of insects and vertebrates. Here, we invetigate the ploidy and karyotype of various strains of Monocercomonoides using Fluorescence in situ Hybridization (FISH). For ploidy we used probes against the SufDSU gene, which is known to be present in a single copy in the genome of M. exilis. For karyotype investigations we used FISH probes against the TTAGGG telomeric repeat sequence. The results showed that all the investigated strains are haploid with a single clear signal from our SufDSU probes. The karyotype analyses showed that the average number of signals per nucleus varied between 9 to 17 in most of the investigated strains, indicating number of chromosomes similar to M. exilis. A notable exception from this are the strains of M. mercovicensis, where we observed a much higher number of signals, suggesting much higher number of chromosomes. For estimating of the DNA content in the nuclei of these oxymonads we used the flow cytometry, with M. exilis as a standard. Our results indicate that two of the investigated strains, Monocercomonoides sp. strain OEV and Mural1, have smaller genome sizes than M. exilis, while the rest of the strains have genomes sizes larger than M. exilis. We observed an unusually large variation...

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/181752

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-528876


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Rigorous theses