Original title: 6S RNA jako nástroj ke zvýšení produkce klinicky významných antibiotik u relevantních kmenů
Translated title: 6S RNA as a tool for increased production of clinically relevant antibiotics
Authors: Kostílek, Štěpán ; Bobek, Jan (advisor) ; Ulrych, Aleš (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2023
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Streptomycety patří do skupiny půdních mikroorganismů a jsou významnými producenty biologicky aktivních látek využívaných v celé řadě odvětví, ať už se jedná o medicínu, zemědělství či biotechnologie. Právě z tohoto důvodu je výzkum těchto mikroorganismů zajímavý pro řadu výzkumných institucí a skupin. Jednou z nejdůležitějších skupin těchto látek jsou antibiotika. Značná část v přírodě produkovaných antibiotik je produkována právě streptomycetami, a proto je v našem zájmu porozumět mechanismům, které tuto produkci ovlivňují. U streptomycet byla doposud nalezena široká škála různých regulačních mechanismů řídících produkci antibiotik. Jedním z těchto regulačních mechanismů je využití scr3559 RNA. scr3559 RNA je malá, nekódující molekula RNA regulující produkci antibiotik na úrovni transkripce DNA. Tyto malé molekuly RNA napodobují svou strukturou promotorové sekvence, a jsou tak schopny interagovat s RNA polymerázou. Přítomnost scr3559 RNA nebyla u streptomycet jednoznačně potvrzena, a stále se hledají nové molekuly scr3559 RNA. K nalezení těchto nových molekul je využíváno in silico metod, kdy se sleduje podobnost sekvence scr3559 RNA S. coelicolor se sekvencemi v genomech různých streptomycet. Vzhledem k tomu, že zvýšená produkce scr3559 RNA má vliv na syntézu antibiotik, rozhodli jsme se v této... Streptomyces belong to the group of soil microorganisms, and they are significant producers of biologically active substances used in a wide range of industries, whether it is medicine, agriculture or biotechnology. It is for this reason that the research of these microorganisms is of interest to a number of research institutions. One of the most important groups of these biologically active substances are antibiotics. A significant part of antibiotics produced in nature is produced precisely by streptomyces, and therefore it is in our interest to understand the mechanisms that influence this production. A wide variety of different regulatory mechanisms controlling antibiotic production have been found so far in streptomyces. One of these regulatory mechanisms is the utilization of scr3559 RNA. Scr3559 RNA is a small, non-coding RNA molecule that regulates antibiotic production at the level of DNA transcription. These small RNA molecules mimic the structure of the target promoter sequence and are able to interact with RNA polymerase. The presence of scr3559 RNA has not been confirmed in streptomyces as of yet, but new scr3559 RNA molecules are still being sought. To find new molecules, in silico methods are used, where the similarity of the scr3559 RNA sequence of S. coelicolor with homologous...

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/181357

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-527733


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses