Název:
DNA markery rezistencie voči biotickému stresu u uhorky siatej
Autoři:
Zvalová, Monika Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2021
Jazyk:
slo
Abstrakt: [cze][eng] DNA marekry se díky stále napredujícím technikám biotechnologii staly neodmyslitelnou součástí studia rostlinného genomu. Znalosti ideálních molekulárních markerů jsou široce použitelné a nápomocné při mapování genomů, konstrukci genetických map, systematické taxonomii či při konvenčním šlechtění. V porovnání s klasickými přístupy mají DNA markery mnoho výhod, například vysokou stabilitu, spolehlivost a nejsou ovlivněny prostředím. Diplomová práce se věnuje aplikaci různých typů genetických markerů při studiu oblastí genomu okurky seté zodpovědných za rezistenci či náchylnost vůči vybraným biotickým stresorům, konkrétně bakteriózám a virózám. Porovnává účinnost RAPD s markery SCAR a CAPS. Dále byly definovány vhodné a nevyhovující genetické markery vůči bakteriální skvrnitosti a žluté virové mozaice cukety, které se každoročně podílejí na hospodářských ztrátách mnoha plodin. Součástí práce byla jako optimalizace PCR protokolu, tak i sekvenční analýza vybraných amplifikovaných oblastí genomu okurky a jejich následné srovnání v databázi NCBI. Do budoucna bylo navrženo praktické zužitkování výsledků v rámci spolupráce s firmou Moravoseed CZ a.s. Závěry laboratorní práce mohou být nápomocné v perspektivním využití markerů specifických k PSyLA a ZYMV.Thanks to ever-advancing biotechnology techniques, DNA markers have become an integral part of the study of the plant genome. Knowledge of ideal molecular markers is widely applicable and helpful in genome mapping, genetic map construction, systematic taxonomy or conventional breeding. Compared to conventional approaches, DNA markers have many advantages, such as high stability, reliability and they are not affected by the environment. The diploma thesis deals with the application of various types of genetic markers in the study of regions of the cucumber genome responsible for resistance or susceptibility to selected biotic stressors, especially bacteries and viruses. It compares the effectiveness of RAPD with SCAR and CAPS markers. Furthermore, suitable and unsatisfactory genetic markers against angular leaf spot and disease caused by Zucchini yellow mosaic virus have been defined, which contribute to the economic losses of many crops every year. The work includes optimization of the PCR protocol and sequence analysis of selected amplified regions of the cucumber genome and their subsequent comparison in the NCBI database. For the future, a practical use of the results is proposed for cooperation with the MORAVOSEED CZ a.s company. The conclusion of the laboratory work can be helpful in the perspective use of markers specific to PSyLA and ZYMV.
Klíčová slova:
CAPS; Cucumis sativus; molecular marker; molekulární marker; PSyLA; RAPD; SCAR; ZYMV
host ::
