Název: Ověření souvislosti genů \kur{enol-1} a \kur{astacinu} s evoluční adaptací na parazitismus u druhu \kur{Heterorhabditis bacteriophora}
Autoři: HARTMANN, Jan
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2020
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Zaměřením této práce byla možná spojitost dvou kandidátních genů, enol-1 a astacinové metalopeptidázy, s adaptacemi na parazitický způsob života u hlístice Heterorhabditis bacteriophora.Ačkoliv experimentální umlčování genů nepodporuje spojitost (zejména kvůli neuspěšné provedené metodě "soaking")biostatistická analýza ortologů z 25 druhů vybraných napříč klady III, IV a V nalezla známky episodické selekce. Bohužel nebyla zjištěna vazba na parazitické druhy, jelikož převažujícím typem selekce byla selekce purifikační. S větší pravděpodobností jsou kandidátní geny konzervované, než spojeny s adaptačním tlakem spojeným s parazitismem. This thesis was focused on the verification wheter the two candidate genes, enol-1 and astacin metalloprotease, are linked to the parasitic adaptation of Heterorhabditis bacteriophora. While the expression analysis and knock-down of those genes by RNAi did not corroborate thwe hypothesis, biostatistical evolutionary analysis of orthologs from 25 nematode species across clades III, IV and V found several footprints of episodic diversifying selection. However, none of this was strictly linked to the parasitic species. Since the prevailing detected selection was purifying, both candidate genes are more likely conserved and not directly shaped by adaptation to parasitism.
Klíčová slova: Entomopatogenní hlístovka; Evoluce parazitismu; vliv selekce; Entomopathogenic nematode; Evolution of parasitism; Selective pressure
Citace: HARTMANN, Jan. Ověření souvislosti genů \kur{enol-1} a \kur{astacinu} s evoluční adaptací na parazitismus u druhu \kur{Heterorhabditis bacteriophora}. České Budějovice, 2020. diplomová práce (Mgr.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU.
Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/55623

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-514078


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce