Original title: Diverzita mikrořas z extrémních habitatů: propojení fylogeneze a ekologie
Translated title: Diversity of microalgae from extreme habitats: linking phylogeny and ecology
Authors: Barcyte, Dovile ; Nedbalová, Linda (advisor) ; Dvořák, Petr (referee) ; Bock, Christina (referee)
Document type: Doctoral theses
Year: 2019
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
The diversity of microalgae from extreme habitats is far from being fully explored and understood. This is due, in part, to limited sampling efforts along with complex algal taxonomy and systematics. In particular, little investigated extremely acidic (pH < 3.0) and polar habitats might veil novel, undescribed species. This doctoral thesis aimed to study algal strains isolated from acidic or acidic and hot, and cold environments using a polyphasic approach. It focused on coccoid (Coccomyxa and Watanabea), monadoid (Chloromonas and its relatives) and saccoderm (Cylindrocystis) green microalgae from the classes Trebouxiophyceae, Chlorophyceae, and Zygnematophyceae, respectively. In addition, coccoid red algae (Galdieria) from the class Cyanidiophyceae were covered. The main research methods included light and transmission electron microscopy combined with Sanger sequencing. Nuclear 18S rDNA and plastid rbcL sequences were used for construction of phylogenetic trees for taxonomic position evaluation. Comparisons of secondary structure models of the highly variable ITS2 rDNA molecular marker served for a more detailed genetic relationship estimation among close relatives. Results have shown that Coccomyxa and Watanabea are present in extremely acidic lakes and that acidity and increased availability of... in Czech Diverzita mikrořas z extrémních habitatů není zcela prozkoumaná, což je zřejmě způsobeno omezeným úsilím, které bylo dosud věnováno sběru vzorků z často nehostinných prostředí, spolu s komplikovanou taxonomií a systematikou řas. Zejména v málo prozkoumaných extrémně kyselých (pH < 3.0) a polárních habitatech se mohou vyskytovat nové, dosud nepopsané druhy. Cílem této disertační práce bylo polyfázické studium řasových kmenů z extrémních stanovišť s nízkým pH, s nízkým pH v kombinaci s vysokými teplotami a z polárních oblastí. Práce je zaměřena na kokální zelené řasy z třídy Trebouxiophyceae (rody Coccomyxa a Watanabea), monadoidní zelené řasy z třídy Chlorophyceae (Chloromonas a příbuzné rody) a saccodermní zelené řasy z třídy Zygnematophyceae (rod Cylindrocystis). Dále se zabývá kokálními ruduchami z třídy Cyanidiophyceae (rod Galdieria). Hlavní metody výzkumu získaných řasových kmenů zahrnovaly světelnou a transmisní elektronovou mikroskopii a Sangerovo sekvenování jaderných a chloroplastových molekulárních markerů. Jaderné (18S rDNA) a plastidové (rbcL) sekvence byly použity na rekonstrukci fylogenetických stromů a na vyhodnocení taxonomického postavení studovaných organismů. Porovnání modelů sekundární struktury jaderné ITS2 rDNA jako vysoce variabilního molekulárního markeru sloužilo...

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/111070

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-508920


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses