Original title: Identifikace variability v celogenomových sestaveních
Translated title: Variability identification in whole-genome assemblies
Authors: Morávková, Dalena ; Škutková, Helena (referee) ; Bartoň, Vojtěch (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2022
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Tato bakalářská práce se zabývá vyhledáváním variabilit v genomu organismu Treponema pallidum. V teoretické části jsou popsány významné sekvenační technologie, metody mapování genomu a variability genomu. Praktickou část tvoří mapování dat ze sekvenátoru Illumina, jejich zpracování a vyhledávání variabilních pozic. This bachelor thesis deals with searching variable positions in the Treponema Pallidum genome. The theoretical part describes sequencing technologies, methods of genome assembly and variability of genome. The practical part includes processing data sequenced by Illumina sequencing technology and identification of variability in them.
Keywords: Bowtie2; genetic variability; genome assembly; Illumina; NGS; sequencing technology; Treponema pallidum; Bowtie2; genetická variabilita; Illumina; mapování genomu; NGS; sekvenační technologie; Treponema pallidum

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/205743

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-503317


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses