Original title: Proteomická a bioinformatická charakterizace N-terminálních sekvencí proteinů modifikovaných po importu do hydrogenosomu Trichomonas vaginalis.
Translated title: Proteomická a bioinformatická charakterizace N-terminálních sekvencí proteinů modifikovaných po importu do hydrogenosomu Trichomonas vaginalis.
Authors: Zákoucká, Eva ; Man, Petr (advisor) ; Šulc, Miroslav (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2014
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Trichomonas vaginalis is a human pathogen causing trichomoniasis, one of the most common non-viral sexually transmitted diseases in both men and women. Trichomoniasis is currently treated with metronidazole, but the pathogen is known to develop resistance against this drug. However as the pathogen is eukaryotic, the targets for the pathogen elimination without seriously affecting the host are limited. Throughout the evolution Trichomonas vaginalis adapted to anaerobic environments by developing an alternative metabolism resulting in a reduced form of mitochondria named hydrogenosome. Hydrogenosomes lack genetic information, therefore all its proteins are nucleus-encoded and need to be transported inside the hydrogenosome using a targeting N-terminal presequence. The peptidase recognizing and cleaving those presequences at the entrance of the organelle, the hydrogenosomal processing peptidase (HPP), is unique for hydrogenosomes and therefore represents a potential drug target against the pathogen. In this work the HPP's substrate specificity towards the targeting presequences was investigated. To do so a proteomic analysis of the proteome of Trichomonas vaginalis hydrogenosomes was performed using a novel optimized protocol for N-terminal peptide sequencing. N-terminal peptides were captured using a... Trichomonas vaginalis je lidským anaerobním patogenem způsobujícím trichomoniasu, jednu z nejrozšířenějších nevirových pohlavně přenosných nemocí. Toto onemocnění postihující muže i ženy je v současnosti běžně léčeno metronidazolem, avšak jsou známy případy, kdy vznikla rezistence vůči tomuto léčivu. Jelikož je Trichomas vaginalis eukaryotní organismus, je paleta cílů terapeutického zásahu proti tomuto patogenu bez ohrožení hostitele omezená. Během evoluce se Trichomas vaginalis přizpůsobila anaerobnímu prostředí vznikem alternativního anaerobního metabolismu, kdy se mitochondrie přeměnily na organely s výrazně omezenou enzmatickou výbavou. Jelikož je jedním z konečných produktů energetického metabolismu v těchto organelách molekulární vodík, nazývají se tyto organely hzdrogenosomy. Hydrogenosomy nemají vlastní genetickou informaci, všechny proteiny v nich přítomné jsou kódované v jádře, syntetizované na volných ribosomech v cytosolu a poté transportovány do hydrogenosomů pomocí N-koncových presekvencí. Peptidasa rozeznávající a odštěpující tyto presekvence, hydrogenosomální procesující peptidasa, je pro hydrogenosomy unikátní a představuje jeden z mála potencionálních terapeutických cílů pro léčbu trichomoniasy. Cílem této práce bylo určení substrátové specifity hydrogenosomální procesující...
Keywords: hydrogenosomes; mass spectrometry; N-terminal sequencing; protein modification; hmotnostní spektrometrie; hydrogenosomy; modifikace proteinů; sekvenování N-terminálních peptidů

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/68220

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-500843


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses